MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483 chromosome

Total Repeats: 14042

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_011149	TA	3	6	1936840	1936845	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5502	NC_011149	GGC	2	6	1936873	1936878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5503	NC_011149	GC	3	6	1938860	1938865	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5504	NC_011149	AAT	2	6	1938926	1938931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5505	NC_011149	CA	3	6	1938935	1938940	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5506	NC_011149	TCA	2	6	1939023	1939028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5507	NC_011149	A	6	6	1939047	1939052	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5508	NC_011149	TCAGT	2	10	1939936	1939945	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5509	NC_011149	C	6	6	1940101	1940106	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5510	NC_011149	CAAAA	2	10	1940976	1940985	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
5511	NC_011149	GA	3	6	1941026	1941031	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5512	NC_011149	G	6	6	1941996	1942001	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5513	NC_011149	CA	3	6	1942031	1942036	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5514	NC_011149	TTA	2	6	1942101	1942106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5515	NC_011149	A	6	6	1942129	1942134	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5516	NC_011149	AAT	2	6	1942195	1942200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5517	NC_011149	ATC	2	6	1942269	1942274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5518	NC_011149	GCA	2	6	1942278	1942283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5519	NC_011149	TCT	2	6	1942355	1942360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5520	NC_011149	GCT	2	6	1942379	1942384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5521	NC_011149	GTC	2	6	1942537	1942542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5522	NC_011149	AAT	2	6	1942551	1942556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5523	NC_011149	T	8	8	1945809	1945816	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5524	NC_011149	ATA	2	6	1945888	1945893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5525	NC_011149	GAC	2	6	1945943	1945948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5526	NC_011149	A	7	7	1945950	1945956	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5527	NC_011149	GTT	2	6	1948687	1948692	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5528	NC_011149	CGG	2	6	1951525	1951530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5529	NC_011149	CCT	2	6	1955049	1955054	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5530	NC_011149	TCC	2	6	1955883	1955888	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5531	NC_011149	CG	4	8	1955928	1955935	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5532	NC_011149	TATT	2	8	1955967	1955974	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5533	NC_011149	TGCT	2	8	1955982	1955989	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5534	NC_011149	ATG	2	6	1956739	1956744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5535	NC_011149	ATAA	2	8	1956779	1956786	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5536	NC_011149	ATT	2	6	1959276	1959281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5537	NC_011149	TAT	2	6	1959297	1959302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5538	NC_011149	AT	3	6	1959314	1959319	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5539	NC_011149	ATT	2	6	1959368	1959373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5540	NC_011149	TAC	2	6	1959403	1959408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5541	NC_011149	TCCT	2	8	1961632	1961639	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5542	NC_011149	T	6	6	1961712	1961717	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5543	NC_011149	TGC	2	6	1961722	1961727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5544	NC_011149	TGA	2	6	1961735	1961740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5545	NC_011149	A	7	7	1961769	1961775	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5546	NC_011149	A	6	6	1961797	1961802	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5547	NC_011149	CGC	3	9	1961808	1961816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5548	NC_011149	AGA	2	6	1961822	1961827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5549	NC_011149	TCC	2	6	1963085	1963090	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5550	NC_011149	GGA	2	6	1963118	1963123	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5551	NC_011149	CGCC	2	8	1963777	1963784	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5552	NC_011149	GGC	2	6	1963786	1963791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5553	NC_011149	GCC	2	6	1963803	1963808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5554	NC_011149	TGC	2	6	1963852	1963857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5555	NC_011149	GC	3	6	1964471	1964476	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5556	NC_011149	T	7	7	1964485	1964491	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5557	NC_011149	TTA	2	6	1964559	1964564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5558	NC_011149	TA	3	6	1965632	1965637	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5559	NC_011149	TA	4	8	1965651	1965658	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5560	NC_011149	ATGT	2	8	1965947	1965954	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5561	NC_011149	T	6	6	1965973	1965978	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5562	NC_011149	TGA	2	6	1965990	1965995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5563	NC_011149	AAT	2	6	1966016	1966021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5564	NC_011149	A	7	7	1966035	1966041	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5565	NC_011149	ATGA	2	8	1966043	1966050	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5566	NC_011149	TCC	2	6	1966095	1966100	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5567	NC_011149	TTA	2	6	1966129	1966134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5568	NC_011149	AGA	2	6	1966157	1966162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5569	NC_011149	G	6	6	1966210	1966215	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5570	NC_011149	CT	3	6	1966490	1966495	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5571	NC_011149	ATC	2	6	1966561	1966566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5572	NC_011149	AG	3	6	1966575	1966580	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5573	NC_011149	TTA	2	6	1967731	1967736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5575	NC_011149	GCT	2	6	1969299	1969304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5577	NC_011149	GGCA	2	8	1970407	1970414	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5578	NC_011149	CA	3	6	1970444	1970449	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5579	NC_011149	AAC	2	6	1970486	1970491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5580	NC_011149	ATAATT	2	12	1971595	1971606	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5581	NC_011149	TGA	2	6	1971626	1971631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5582	NC_011149	CAT	2	6	1971646	1971651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5583	NC_011149	TCA	2	6	1972937	1972942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5584	NC_011149	TG	3	6	1977741	1977746	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5585	NC_011149	CGATC	2	10	1977754	1977763	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
5586	NC_011149	GC	3	6	1977815	1977820	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5587	NC_011149	CG	4	8	1979132	1979139	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5588	NC_011149	C	7	7	1981108	1981114	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5589	NC_011149	CAG	2	6	1981142	1981147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5591	NC_011149	TCC	2	6	1981974	1981979	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5592	NC_011149	A	8	8	1981982	1981989	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5593	NC_011149	T	7	7	1982006	1982012	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5594	NC_011149	GATT	2	8	1982503	1982510	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5595	NC_011149	T	6	6	1983047	1983052	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5596	NC_011149	CGT	2	6	1983060	1983065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5598	NC_011149	TAA	2	6	1983150	1983155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5599	NC_011149	T	6	6	1983172	1983177	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5600	NC_011149	AGA	2	6	1983197	1983202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5601	NC_011149	A	6	6	1983220	1983225	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5602	NC_011149	GT	4	8	1983236	1983243	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5603	NC_011149	GCC	2	6	1983247	1983252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5604	NC_011149	G	6	6	1983278	1983283	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5605	NC_011149	AC	3	6	1983302	1983307	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5606	NC_011149	T	8	8	1983312	1983319	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5607	NC_011149	A	6	6	1983363	1983368	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5608	NC_011149	AAT	2	6	1983390	1983395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5609	NC_011149	AATT	2	8	1983413	1983420	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5610	NC_011149	T	6	6	1983437	1983442	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5611	NC_011149	A	7	7	1983496	1983502	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5612	NC_011149	ACA	2	6	1983510	1983515	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5613	NC_011149	AT	4	8	1983521	1983528	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5614	NC_011149	CAG	2	6	1983649	1983654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5615	NC_011149	TTTAT	2	10	1983683	1983692	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5616	NC_011149	A	7	7	1983718	1983724	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5617	NC_011149	GAA	2	6	1986112	1986117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5619	NC_011149	ATG	2	6	1986671	1986676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5620	NC_011149	CT	3	6	1988031	1988036	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5621	NC_011149	T	6	6	1988078	1988083	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5622	NC_011149	TTGA	2	8	1989220	1989227	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5623	NC_011149	GT	3	6	1989326	1989331	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5624	NC_011149	C	7	7	1989359	1989365	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5625	NC_011149	AAGA	2	8	1989380	1989387	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5626	NC_011149	T	8	8	1989408	1989415	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5627	NC_011149	CAG	2	6	1989908	1989913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5629	NC_011149	TAA	2	6	1989944	1989949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5630	NC_011149	CAT	2	6	1989960	1989965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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