MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483 plasmid unnamed

Total Repeats: 112

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011148	GGC	2	6	6	11	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_011148	T	6	6	16	21	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011148	TCT	2	6	23	28	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_011148	A	6	6	55	60	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011148	GAT	2	6	528	533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011148	ACCT	2	8	551	558	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_011148	ATC	2	6	562	567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_011148	AAATA	2	10	631	640	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011148	GAAAA	2	10	2235	2244	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011148	CCT	2	6	2737	2742	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_011148	TATT	2	8	3130	3137	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011148	T	6	6	3139	3144	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011148	AGGGT	2	10	3407	3416	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011148	AACC	2	8	4193	4200	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_011148	TAA	2	6	4554	4559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011148	AAGG	2	8	4577	4584	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011148	A	8	8	4653	4660	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011148	CA	3	6	4672	4677	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_011148	TAACA	2	10	4746	4755	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_011148	TAT	2	6	4789	4794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011148	CCT	2	6	5004	5009	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_011148	CAA	2	6	5592	5597	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_011148	GCA	2	6	5671	5676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_011148	GCATCA	2	12	5729	5740	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_011148	AAT	2	6	5752	5757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011148	GCCTT	2	10	5762	5771	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
27	NC_011148	ATC	2	6	5836	5841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_011148	AAT	2	6	5962	5967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011148	TGC	2	6	5981	5986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_011148	T	6	6	5993	5998	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011148	CTT	2	6	6036	6041	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_011148	TCT	2	6	6045	6050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_011148	TGC	2	6	6107	6112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_011148	AG	3	6	6142	6147	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011148	AGCG	3	12	6154	6165	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
36	NC_011148	ACC	2	6	6166	6171	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_011148	AAT	2	6	6174	6179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011148	ACA	2	6	6201	6206	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_011148	A	6	6	6314	6319	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011148	TGCT	2	8	6325	6332	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_011148	TCTT	2	8	6368	6375	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_011148	TACAA	2	10	6390	6399	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_011148	AAT	2	6	6443	6448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011148	CCCGC	2	10	6541	6550	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
45	NC_011148	A	7	7	6580	6586	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011148	CGC	2	6	7260	7265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_011148	TCC	2	6	7778	7783	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_011148	ATA	2	6	10002	10007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011148	A	6	6	10476	10481	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011148	C	6	6	10874	10879	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
51	NC_011148	C	8	8	12909	12916	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
52	NC_011148	ATTT	2	8	14044	14051	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011148	C	8	8	16078	16085	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
54	NC_011148	T	7	7	20718	20724	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011148	A	6	6	21783	21788	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011148	CTA	2	6	21789	21794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_011148	AAG	2	6	22273	22278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011148	ATTA	2	8	22416	22423	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011148	TAC	2	6	22434	22439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_011148	C	6	6	24022	24027	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
61	NC_011148	T	7	7	24286	24292	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011148	AGGAA	2	10	24581	24590	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011148	GAA	3	9	24588	24596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011148	A	6	6	24628	24633	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011148	ATA	2	6	24654	24659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011148	CGTT	2	8	24676	24683	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_011148	AGG	2	6	24916	24921	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011148	A	8	8	24947	24954	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011148	GCC	2	6	24955	24960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_011148	GGC	2	6	24975	24980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_011148	TAT	2	6	25007	25012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011148	T	6	6	25066	25071	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011148	ACTTA	2	10	25077	25086	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_011148	AC	3	6	25104	25109	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_011148	TGT	2	6	25360	25365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011148	ATAAA	2	10	26485	26494	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011148	G	8	8	26522	26529	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011148	GGC	2	6	27131	27136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_011148	ATT	2	6	27473	27478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011148	T	8	8	27503	27510	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011148	C	7	7	27557	27563	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
82	NC_011148	TCCCC	2	10	27564	27573	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
83	NC_011148	AT	3	6	27585	27590	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011148	AAAC	2	8	27601	27608	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_011148	ACTAT	2	10	27651	27660	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_011148	TAGT	2	8	27664	27671	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011148	T	6	6	27873	27878	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011148	T	7	7	28301	28307	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011148	TAG	2	6	28322	28327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011148	GTAT	2	8	28357	28364	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011148	ATTGT	2	10	30136	30145	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011148	ACAAT	2	10	30146	30155	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_011148	TAAA	2	8	31449	31456	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011148	TAAC	2	8	32725	32732	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_011148	T	7	7	32891	32897	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011148	TA	3	6	32966	32971	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011148	GCC	2	6	33014	33019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_011148	T	7	7	37073	37079	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011148	GCAGG	2	10	37085	37094	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
100	NC_011148	G	6	6	37093	37098	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011148	ATT	2	6	37236	37241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011148	TAT	2	6	37248	37253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011148	CTC	2	6	37257	37262	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_011148	GTTC	2	8	37272	37279	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_011148	TCGCT	2	10	37281	37290	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
106	NC_011148	TGCGG	2	10	37312	37321	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
107	NC_011148	A	8	8	37329	37336	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011148	ACA	2	6	37854	37859	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_011148	TAC	2	6	37860	37865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_011148	AAG	2	6	37890	37895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011148	AACC	2	8	37929	37936	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_011148	CTTT	2	8	37969	37976	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.