MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633 chromosome

Total Repeats: 13097

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_011094	TCA	2	6	4021072	4021077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11002	NC_011094	TGT	2	6	4021116	4021121	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11003	NC_011094	T	7	7	4021165	4021171	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11004	NC_011094	AAGCG	2	10	4021211	4021220	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
11005	NC_011094	G	6	6	4021232	4021237	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11006	NC_011094	ATCA	2	8	4025324	4025331	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11007	NC_011094	AG	3	6	4025354	4025359	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11008	NC_011094	GTGA	2	8	4025381	4025388	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11009	NC_011094	GTC	2	6	4025405	4025410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11010	NC_011094	AAT	2	6	4025421	4025426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11011	NC_011094	TGTA	2	8	4025484	4025491	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11012	NC_011094	TCTT	2	8	4025497	4025504	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11013	NC_011094	T	6	6	4025549	4025554	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11014	NC_011094	GGC	2	6	4028246	4028251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11015	NC_011094	AAT	2	6	4031147	4031152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11016	NC_011094	CGC	2	6	4031163	4031168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11017	NC_011094	GCTT	2	8	4031198	4031205	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11018	NC_011094	GAT	2	6	4031222	4031227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11019	NC_011094	AGT	2	6	4034653	4034658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11020	NC_011094	AAGCG	2	10	4034729	4034738	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
11021	NC_011094	CGG	2	6	4034772	4034777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11022	NC_011094	GCC	2	6	4037029	4037034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11023	NC_011094	ATT	2	6	4037115	4037120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11024	NC_011094	AC	3	6	4037209	4037214	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11025	NC_011094	T	6	6	4037310	4037315	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11026	NC_011094	TG	3	6	4037366	4037371	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11027	NC_011094	TGG	2	6	4038377	4038382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11028	NC_011094	A	6	6	4038433	4038438	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11029	NC_011094	AAC	2	6	4039362	4039367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11030	NC_011094	CTT	2	6	4039892	4039897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11031	NC_011094	TTG	2	6	4039900	4039905	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11032	NC_011094	AAG	2	6	4039917	4039922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11033	NC_011094	TAAC	2	8	4039926	4039933	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11034	NC_011094	TG	3	6	4039939	4039944	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11035	NC_011094	TC	3	6	4040910	4040915	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11036	NC_011094	A	6	6	4042806	4042811	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11037	NC_011094	CAT	2	6	4043501	4043506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11038	NC_011094	TGTGT	2	10	4044189	4044198	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
11039	NC_011094	ACG	2	6	4044204	4044209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11040	NC_011094	A	6	6	4044211	4044216	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11041	NC_011094	TTGT	2	8	4046088	4046095	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11042	NC_011094	TCA	2	6	4046173	4046178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11043	NC_011094	GGC	2	6	4046276	4046281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11044	NC_011094	TGG	2	6	4046347	4046352	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11045	NC_011094	CAT	2	6	4046369	4046374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11046	NC_011094	CGC	2	6	4046443	4046448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11047	NC_011094	TGA	2	6	4046473	4046478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11048	NC_011094	CGT	2	6	4046484	4046489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11049	NC_011094	ATT	2	6	4046541	4046546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11050	NC_011094	GACC	2	8	4046561	4046568	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11051	NC_011094	TGG	2	6	4046626	4046631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11052	NC_011094	GCA	2	6	4046666	4046671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11053	NC_011094	TGG	2	6	4046707	4046712	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11054	NC_011094	CGG	2	6	4046713	4046718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11055	NC_011094	GTG	2	6	4046796	4046801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11056	NC_011094	AAT	2	6	4046874	4046879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11057	NC_011094	ACT	2	6	4046897	4046902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11058	NC_011094	CAG	2	6	4046925	4046930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11059	NC_011094	ACTT	2	8	4048046	4048053	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11060	NC_011094	CGC	2	6	4048081	4048086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11061	NC_011094	AATAA	2	10	4048129	4048138	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11062	NC_011094	GCG	2	6	4050451	4050456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11063	NC_011094	AGC	2	6	4050629	4050634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11064	NC_011094	GCG	2	6	4050635	4050640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11065	NC_011094	TTG	2	6	4052114	4052119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11066	NC_011094	CAA	2	6	4052149	4052154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11067	NC_011094	A	6	6	4053005	4053010	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11068	NC_011094	GT	3	6	4053034	4053039	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11069	NC_011094	ATT	2	6	4053095	4053100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11070	NC_011094	CTT	2	6	4053208	4053213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11071	NC_011094	GAG	2	6	4053233	4053238	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11072	NC_011094	CT	3	6	4054012	4054017	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11073	NC_011094	CTTTT	2	10	4054042	4054051	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
11074	NC_011094	AGT	2	6	4055586	4055591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11076	NC_011094	T	7	7	4058682	4058688	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11077	NC_011094	GTC	2	6	4058760	4058765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11079	NC_011094	TAA	2	6	4058853	4058858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11080	NC_011094	TCA	2	6	4058860	4058865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11081	NC_011094	CCGC	2	8	4060481	4060488	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
11082	NC_011094	GTTG	2	8	4061891	4061898	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11083	NC_011094	GAT	2	6	4061937	4061942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11085	NC_011094	GCG	2	6	4063487	4063492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11086	NC_011094	CCTA	2	8	4064285	4064292	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11087	NC_011094	ATTA	2	8	4064308	4064315	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11088	NC_011094	TAA	2	6	4064371	4064376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11089	NC_011094	TA	3	6	4064422	4064427	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11090	NC_011094	ATTT	2	8	4064434	4064441	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11091	NC_011094	AGTT	2	8	4064466	4064473	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11092	NC_011094	ATTT	2	8	4064474	4064481	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11093	NC_011094	A	6	6	4066339	4066344	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11094	NC_011094	CGGG	2	8	4066356	4066363	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
11095	NC_011094	TTG	2	6	4066410	4066415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11096	NC_011094	CGCTG	2	10	4066476	4066485	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
11097	NC_011094	GT	3	6	4069932	4069937	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11098	NC_011094	TAA	2	6	4069947	4069952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11099	NC_011094	AAAT	2	8	4069958	4069965	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11100	NC_011094	A	7	7	4070050	4070056	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11101	NC_011094	ATT	2	6	4074095	4074100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11102	NC_011094	CCA	2	6	4074144	4074149	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11103	NC_011094	AAC	2	6	4074159	4074164	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11104	NC_011094	GCC	2	6	4074174	4074179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11105	NC_011094	CGC	2	6	4074270	4074275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11106	NC_011094	AAGCG	2	10	4074283	4074292	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
11107	NC_011094	TG	3	6	4074324	4074329	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11108	NC_011094	GGC	2	6	4074478	4074483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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11110	NC_011094	TGC	2	6	4074525	4074530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11111	NC_011094	ACT	2	6	4074592	4074597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11112	NC_011094	TTG	2	6	4074689	4074694	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11113	NC_011094	CGA	2	6	4074717	4074722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11118	NC_011094	GCA	2	6	4074912	4074917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11119	NC_011094	AGA	2	6	4074933	4074938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11120	NC_011094	CAG	2	6	4074959	4074964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11127	NC_011094	TTG	2	6	4075562	4075567	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11129	NC_011094	GGA	2	6	4075614	4075619	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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11260	NC_011094	CGT	2	6	4104101	4104106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11261	NC_011094	TTG	2	6	4105568	4105573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11262	NC_011094	TGTA	3	12	4119772	4119783	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11263	NC_011094	TTG	2	6	4119800	4119805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11340	NC_011094	CT	3	6	4127279	4127284	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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11372	NC_011094	AAATAT	2	12	4139388	4139399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11373	NC_011094	TTG	2	6	4139421	4139426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11381	NC_011094	AAAG	2	8	4143356	4143363	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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11383	NC_011094	A	6	6	4143434	4143439	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11384	NC_011094	T	7	7	4143443	4143449	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11385	NC_011094	TTAA	2	8	4143516	4143523	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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