MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633 chromosome

Total Repeats: 13097

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_011094	AT	3	6	1625710	1625715	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4502	NC_011094	TTA	2	6	1625717	1625722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4503	NC_011094	CA	3	6	1625774	1625779	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4504	NC_011094	AAT	2	6	1625786	1625791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4505	NC_011094	TTA	2	6	1625809	1625814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4506	NC_011094	ATT	2	6	1625911	1625916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4507	NC_011094	TGT	2	6	1627012	1627017	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4508	NC_011094	GC	3	6	1629135	1629140	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4509	NC_011094	TAA	2	6	1629755	1629760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4510	NC_011094	AAG	2	6	1629793	1629798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4511	NC_011094	CAT	2	6	1629799	1629804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4512	NC_011094	CGCGC	2	10	1629815	1629824	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
4513	NC_011094	T	6	6	1629833	1629838	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4514	NC_011094	A	7	7	1629863	1629869	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4515	NC_011094	T	6	6	1629910	1629915	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4516	NC_011094	T	7	7	1629919	1629925	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4517	NC_011094	ATAC	2	8	1631347	1631354	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4518	NC_011094	CGT	2	6	1638136	1638141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4519	NC_011094	ATG	2	6	1638162	1638167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4520	NC_011094	TTC	2	6	1638169	1638174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4521	NC_011094	A	6	6	1639116	1639121	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4522	NC_011094	CATTAA	2	12	1639978	1639989	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4523	NC_011094	CA	3	6	1640003	1640008	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4524	NC_011094	CTC	2	6	1640926	1640931	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4525	NC_011094	TC	3	6	1640930	1640935	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4526	NC_011094	TCAA	2	8	1640950	1640957	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4527	NC_011094	AT	3	6	1640975	1640980	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4528	NC_011094	CTTAT	2	10	1641016	1641025	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4529	NC_011094	GCT	2	6	1641026	1641031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4530	NC_011094	ATT	2	6	1641107	1641112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4531	NC_011094	CAC	2	6	1641175	1641180	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4532	NC_011094	CA	3	6	1641188	1641193	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4533	NC_011094	CCG	2	6	1641265	1641270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4534	NC_011094	ATAA	2	8	1643170	1643177	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4535	NC_011094	ATC	2	6	1643246	1643251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4536	NC_011094	CGG	2	6	1643259	1643264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4537	NC_011094	GAC	2	6	1644393	1644398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4538	NC_011094	GCT	2	6	1644422	1644427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4539	NC_011094	ACT	2	6	1644432	1644437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4540	NC_011094	TTA	2	6	1644465	1644470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4541	NC_011094	AAT	3	9	1644480	1644488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4542	NC_011094	ATT	2	6	1644490	1644495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4543	NC_011094	CTTAA	2	10	1644558	1644567	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4544	NC_011094	TCCT	2	8	1647500	1647507	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4545	NC_011094	AAC	2	6	1647522	1647527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4546	NC_011094	GAA	2	6	1647544	1647549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4547	NC_011094	A	6	6	1647568	1647573	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4548	NC_011094	AAAT	2	8	1647596	1647603	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4549	NC_011094	ACA	2	6	1647642	1647647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4550	NC_011094	ATG	2	6	1647757	1647762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4551	NC_011094	GCC	2	6	1647816	1647821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4552	NC_011094	T	6	6	1647823	1647828	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4553	NC_011094	AAT	2	6	1648900	1648905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4554	NC_011094	C	6	6	1648978	1648983	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4555	NC_011094	GCC	2	6	1649026	1649031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4556	NC_011094	TAT	2	6	1650322	1650327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4557	NC_011094	CGC	3	9	1650357	1650365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4558	NC_011094	CCT	2	6	1650366	1650371	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4559	NC_011094	CCG	2	6	1650441	1650446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4560	NC_011094	TTGC	2	8	1650448	1650455	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4561	NC_011094	GAA	2	6	1650482	1650487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4562	NC_011094	AAC	2	6	1650499	1650504	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4563	NC_011094	A	6	6	1657201	1657206	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4564	NC_011094	CG	3	6	1657207	1657212	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4565	NC_011094	AC	3	6	1657233	1657238	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4566	NC_011094	TAT	2	6	1657311	1657316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4567	NC_011094	ATG	2	6	1657355	1657360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4568	NC_011094	AATG	2	8	1657373	1657380	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4569	NC_011094	CGT	2	6	1657394	1657399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4570	NC_011094	TGC	3	9	1657415	1657423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4571	NC_011094	TGC	2	6	1657491	1657496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4572	NC_011094	T	6	6	1657540	1657545	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4573	NC_011094	GCC	2	6	1659041	1659046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4574	NC_011094	GC	3	6	1659066	1659071	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4575	NC_011094	GCT	2	6	1660577	1660582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4576	NC_011094	GTT	2	6	1660610	1660615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4577	NC_011094	AAC	2	6	1660622	1660627	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4578	NC_011094	CAA	2	6	1660679	1660684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4579	NC_011094	CAT	2	6	1661555	1661560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4580	NC_011094	C	6	6	1661562	1661567	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4581	NC_011094	CGC	2	6	1661624	1661629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4582	NC_011094	AAT	2	6	1661645	1661650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4583	NC_011094	GGC	2	6	1661665	1661670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4584	NC_011094	AGT	2	6	1661754	1661759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4585	NC_011094	GTT	2	6	1661763	1661768	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4586	NC_011094	TA	3	6	1661817	1661822	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4587	NC_011094	GTT	2	6	1661894	1661899	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4588	NC_011094	CTG	2	6	1661939	1661944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4589	NC_011094	ATT	2	6	1661954	1661959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4590	NC_011094	GCG	2	6	1661980	1661985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4591	NC_011094	CCT	2	6	1662393	1662398	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4592	NC_011094	AAAT	2	8	1662431	1662438	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4593	NC_011094	ACA	2	6	1662455	1662460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4594	NC_011094	TTG	2	6	1662550	1662555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4595	NC_011094	TAA	2	6	1662562	1662567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4596	NC_011094	CTT	2	6	1662582	1662587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4597	NC_011094	CAA	2	6	1662613	1662618	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4598	NC_011094	ATA	2	6	1662635	1662640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4599	NC_011094	TAAT	2	8	1662648	1662655	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4600	NC_011094	ATG	3	9	1662671	1662679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4601	NC_011094	AGG	2	6	1662737	1662742	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4602	NC_011094	ATA	2	6	1662838	1662843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4603	NC_011094	ACC	2	6	1662852	1662857	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4604	NC_011094	TAT	2	6	1662874	1662879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4605	NC_011094	AATAC	2	10	1663905	1663914	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
4606	NC_011094	AAT	2	6	1663936	1663941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4607	NC_011094	AGTATA	2	12	1663992	1664003	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4608	NC_011094	AAT	2	6	1664063	1664068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4609	NC_011094	ATT	2	6	1664080	1664085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4610	NC_011094	CAT	2	6	1664088	1664093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4611	NC_011094	ACG	2	6	1664100	1664105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4612	NC_011094	TCTT	2	8	1666324	1666331	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4613	NC_011094	AGC	2	6	1666339	1666344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4614	NC_011094	GGC	2	6	1666350	1666355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4615	NC_011094	TGAC	2	8	1666994	1667001	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4616	NC_011094	ATG	2	6	1668951	1668956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4617	NC_011094	ATA	2	6	1668965	1668970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4618	NC_011094	A	7	7	1669039	1669045	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4619	NC_011094	GTT	2	6	1670728	1670733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4620	NC_011094	CTT	2	6	1672311	1672316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4621	NC_011094	GTT	2	6	1672318	1672323	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4622	NC_011094	ATT	2	6	1672400	1672405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4623	NC_011094	T	6	6	1672404	1672409	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4624	NC_011094	CAC	2	6	1672502	1672507	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4625	NC_011094	AG	3	6	1676090	1676095	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4626	NC_011094	AGGA	2	8	1680417	1680424	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4627	NC_011094	TAA	2	6	1682181	1682186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4628	NC_011094	T	6	6	1682248	1682253	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4629	NC_011094	CAG	2	6	1682254	1682259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4631	NC_011094	TTG	2	6	1682316	1682321	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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