MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476 chromosome

Total Repeats: 13670

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_011083	CTT	2	6	2879565	2879570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8002	NC_011083	T	6	6	2879569	2879574	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8003	NC_011083	TGT	2	6	2879583	2879588	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8004	NC_011083	GCCA	2	8	2879809	2879816	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8005	NC_011083	GTT	2	6	2879824	2879829	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8006	NC_011083	CTA	2	6	2879846	2879851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8007	NC_011083	GCACA	2	10	2879857	2879866	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
8008	NC_011083	T	6	6	2879879	2879884	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8009	NC_011083	GTC	2	6	2879894	2879899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8010	NC_011083	AAG	2	6	2879952	2879957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8011	NC_011083	AAG	2	6	2879996	2880001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8012	NC_011083	CACTGA	2	12	2880004	2880015	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
8013	NC_011083	AGCC	2	8	2880030	2880037	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8014	NC_011083	AGGG	2	8	2880099	2880106	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
8015	NC_011083	TGA	2	6	2880214	2880219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8016	NC_011083	TTGC	2	8	2880230	2880237	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8017	NC_011083	ACAT	2	8	2880301	2880308	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8018	NC_011083	AAG	2	6	2880323	2880328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8019	NC_011083	TGA	2	6	2880334	2880339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8020	NC_011083	CAAT	2	8	2880432	2880439	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8021	NC_011083	AAC	2	6	2880483	2880488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8022	NC_011083	GAG	2	6	2880489	2880494	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8023	NC_011083	TGAA	2	8	2880528	2880535	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8024	NC_011083	GGC	2	6	2880547	2880552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8025	NC_011083	AGA	2	6	2880556	2880561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8026	NC_011083	C	6	6	2880627	2880632	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8027	NC_011083	GCA	2	6	2880654	2880659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8028	NC_011083	ACT	2	6	2880692	2880697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8029	NC_011083	T	6	6	2880740	2880745	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8030	NC_011083	TCC	2	6	2880779	2880784	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8031	NC_011083	TTCA	2	8	2880862	2880869	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8032	NC_011083	TAAA	2	8	2880959	2880966	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8033	NC_011083	TCA	2	6	2881151	2881156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8034	NC_011083	ACG	2	6	2881177	2881182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8035	NC_011083	CAT	2	6	2881197	2881202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8036	NC_011083	GTT	2	6	2881278	2881283	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8037	NC_011083	CAG	2	6	2881309	2881314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8038	NC_011083	AATA	2	8	2881317	2881324	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8039	NC_011083	GCC	2	6	2881359	2881364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8040	NC_011083	GCC	2	6	2881415	2881420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8041	NC_011083	TAA	2	6	2881431	2881436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8042	NC_011083	GT	3	6	2881449	2881454	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8043	NC_011083	TTG	2	6	2881850	2881855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8044	NC_011083	GATT	2	8	2881859	2881866	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8045	NC_011083	GGA	2	6	2881872	2881877	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8046	NC_011083	TTG	2	6	2881946	2881951	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8047	NC_011083	TGT	2	6	2881954	2881959	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8048	NC_011083	TTC	2	6	2882023	2882028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8049	NC_011083	CAG	2	6	2882084	2882089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8050	NC_011083	TG	3	6	2882102	2882107	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8051	NC_011083	CTGG	2	8	2882179	2882186	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8052	NC_011083	TAAA	2	8	2882231	2882238	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8053	NC_011083	TAG	2	6	2882380	2882385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8054	NC_011083	GTT	2	6	2882387	2882392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8055	NC_011083	AGA	2	6	2882395	2882400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8056	NC_011083	ATC	2	6	2882447	2882452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8057	NC_011083	GAA	2	6	2882490	2882495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8058	NC_011083	AAT	2	6	2882506	2882511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8059	NC_011083	CTG	2	6	2882519	2882524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8060	NC_011083	AAAT	2	8	2882620	2882627	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8061	NC_011083	CAT	2	6	2882653	2882658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8062	NC_011083	A	7	7	2882714	2882720	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8063	NC_011083	T	8	8	2882728	2882735	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8064	NC_011083	TTA	2	6	2882764	2882769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8065	NC_011083	CTG	2	6	2882896	2882901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8066	NC_011083	TG	3	6	2884955	2884960	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8067	NC_011083	A	8	8	2885010	2885017	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8068	NC_011083	TCGTA	2	10	2885078	2885087	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
8069	NC_011083	ACCT	2	8	2885114	2885121	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8070	NC_011083	CTTC	2	8	2886382	2886389	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8071	NC_011083	G	6	6	2886501	2886506	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
8072	NC_011083	TTA	2	6	2886527	2886532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8073	NC_011083	ATT	2	6	2886802	2886807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8074	NC_011083	ATGA	2	8	2886857	2886864	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8075	NC_011083	ATC	2	6	2886871	2886876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8076	NC_011083	GAC	2	6	2886881	2886886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8077	NC_011083	AGA	2	6	2886929	2886934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8078	NC_011083	TC	3	6	2886955	2886960	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8079	NC_011083	ATG	2	6	2886963	2886968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8080	NC_011083	CTT	2	6	2887006	2887011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8081	NC_011083	CAAGAG	2	12	2887016	2887027	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
8082	NC_011083	T	6	6	2887110	2887115	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8083	NC_011083	AT	4	8	2887671	2887678	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8084	NC_011083	T	6	6	2889352	2889357	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8085	NC_011083	GTC	2	6	2889440	2889445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8086	NC_011083	GC	3	6	2889478	2889483	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8087	NC_011083	TA	3	6	2889489	2889494	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8088	NC_011083	T	7	7	2889510	2889516	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8089	NC_011083	TTTA	2	8	2889559	2889566	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8090	NC_011083	ATCC	2	8	2889597	2889604	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8091	NC_011083	TGT	2	6	2889605	2889610	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8092	NC_011083	GAA	2	6	2890219	2890224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8093	NC_011083	GGA	2	6	2890244	2890249	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8094	NC_011083	GTTC	2	8	2890348	2890355	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8095	NC_011083	TAC	2	6	2890420	2890425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8096	NC_011083	CA	3	6	2890489	2890494	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8097	NC_011083	CCG	3	9	2890504	2890512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8098	NC_011083	TAC	2	6	2890547	2890552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8099	NC_011083	TTG	2	6	2890573	2890578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8100	NC_011083	TAA	2	6	2890627	2890632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8101	NC_011083	CG	3	6	2890697	2890702	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8102	NC_011083	TAAA	2	8	2890703	2890710	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8103	NC_011083	CTC	2	6	2890740	2890745	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8104	NC_011083	A	6	6	2890763	2890768	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8105	NC_011083	TCA	2	6	2890769	2890774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8106	NC_011083	ATT	2	6	2890824	2890829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8107	NC_011083	GA	4	8	2890867	2890874	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8108	NC_011083	GGC	2	6	2892023	2892028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8109	NC_011083	GT	3	6	2892039	2892044	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8110	NC_011083	AGG	2	6	2892070	2892075	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8111	NC_011083	AAAG	2	8	2895760	2895767	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8112	NC_011083	CGC	2	6	2898060	2898065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8113	NC_011083	GCG	2	6	2898082	2898087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8114	NC_011083	AAT	2	6	2900286	2900291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8115	NC_011083	TA	3	6	2900343	2900348	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8116	NC_011083	ATT	2	6	2900352	2900357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8117	NC_011083	ATA	2	6	2900372	2900377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8118	NC_011083	TAA	2	6	2900427	2900432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8119	NC_011083	A	7	7	2900431	2900437	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8120	NC_011083	CT	3	6	2900462	2900467	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8121	NC_011083	G	6	6	2900501	2900506	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
8122	NC_011083	ATAAA	2	10	2900550	2900559	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8123	NC_011083	CCG	2	6	2900627	2900632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8124	NC_011083	TGG	2	6	2900691	2900696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8125	NC_011083	AT	3	6	2900722	2900727	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8126	NC_011083	TGT	2	6	2900893	2900898	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8127	NC_011083	T	6	6	2900954	2900959	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8128	NC_011083	TCC	2	6	2900992	2900997	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8129	NC_011083	G	7	7	2901048	2901054	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
8130	NC_011083	TAA	3	9	2901212	2901220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8131	NC_011083	AAT	2	6	2901232	2901237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8132	NC_011083	CTA	2	6	2901248	2901253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8133	NC_011083	ATA	2	6	2902463	2902468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8134	NC_011083	ACG	2	6	2902476	2902481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8137	NC_011083	AT	3	6	2902518	2902523	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8143	NC_011083	TA	3	6	2902652	2902657	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8397	NC_011083	CAT	2	6	2998141	2998146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8398	NC_011083	AC	3	6	2998150	2998155	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8399	NC_011083	ATT	2	6	2998184	2998189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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