MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476 chromosome

Total Repeats: 13670

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_011083	GCT	2	6	2001162	2001167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5502	NC_011083	CAA	2	6	2001174	2001179	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5503	NC_011083	ACA	2	6	2001189	2001194	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5504	NC_011083	TAA	2	6	2001632	2001637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5505	NC_011083	CCGA	2	8	2001733	2001740	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5506	NC_011083	GCA	2	6	2001742	2001747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5507	NC_011083	ACA	2	6	2001767	2001772	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5508	NC_011083	TCTA	2	8	2001850	2001857	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5509	NC_011083	A	6	6	2001932	2001937	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5510	NC_011083	TCT	2	6	2002432	2002437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5511	NC_011083	ATTA	2	8	2002474	2002481	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5512	NC_011083	CAG	2	6	2002500	2002505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5513	NC_011083	TAT	2	6	2002528	2002533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5514	NC_011083	TA	3	6	2002556	2002561	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5515	NC_011083	GT	3	6	2002729	2002734	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5516	NC_011083	AT	3	6	2002751	2002756	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5517	NC_011083	GCA	2	6	2002805	2002810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5518	NC_011083	TTAA	2	8	2003284	2003291	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5519	NC_011083	GTTT	2	8	2003307	2003314	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5520	NC_011083	GAT	2	6	2003588	2003593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5521	NC_011083	AAGG	2	8	2003926	2003933	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5522	NC_011083	CAA	2	6	2004121	2004126	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5523	NC_011083	CAG	2	6	2004155	2004160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5524	NC_011083	AGA	2	6	2004197	2004202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5525	NC_011083	AG	3	6	2004266	2004271	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5526	NC_011083	TTA	2	6	2004321	2004326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5527	NC_011083	ATA	2	6	2004358	2004363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5528	NC_011083	GCC	2	6	2004380	2004385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5529	NC_011083	T	6	6	2004408	2004413	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5530	NC_011083	ATAA	2	8	2004434	2004441	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5531	NC_011083	CGG	2	6	2004554	2004559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5532	NC_011083	CATC	2	8	2004649	2004656	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5533	NC_011083	GCC	2	6	2004666	2004671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5534	NC_011083	TCGG	2	8	2004675	2004682	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5535	NC_011083	TGG	2	6	2004696	2004701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5536	NC_011083	CA	3	6	2004826	2004831	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5537	NC_011083	GCCA	2	8	2004911	2004918	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5538	NC_011083	TTG	2	6	2004977	2004982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5539	NC_011083	GAC	2	6	2005009	2005014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5540	NC_011083	CGT	2	6	2005131	2005136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5541	NC_011083	CGA	2	6	2005155	2005160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5542	NC_011083	CTT	2	6	2005234	2005239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5543	NC_011083	AGC	2	6	2005241	2005246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5544	NC_011083	GT	3	6	2005278	2005283	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5545	NC_011083	CAGC	2	8	2005386	2005393	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5546	NC_011083	TTAC	2	8	2005575	2005582	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5547	NC_011083	TCAGT	2	10	2005587	2005596	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5548	NC_011083	ATT	2	6	2005600	2005605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5549	NC_011083	A	7	7	2006160	2006166	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5550	NC_011083	ATTA	2	8	2006233	2006240	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5551	NC_011083	CAAA	2	8	2006357	2006364	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5552	NC_011083	CAA	2	6	2006451	2006456	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5553	NC_011083	CCG	2	6	2006533	2006538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5554	NC_011083	CATCA	2	10	2006624	2006633	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
5555	NC_011083	GGT	2	6	2006690	2006695	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5556	NC_011083	TCC	2	6	2006761	2006766	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5557	NC_011083	T	6	6	2006794	2006799	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5558	NC_011083	ATC	2	6	2007011	2007016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5559	NC_011083	CAA	2	6	2007055	2007060	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5560	NC_011083	ATG	2	6	2007073	2007078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5561	NC_011083	CTG	2	6	2007138	2007143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5562	NC_011083	TAT	2	6	2007195	2007200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5563	NC_011083	TCT	2	6	2007224	2007229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5564	NC_011083	A	6	6	2007257	2007262	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5565	NC_011083	GAA	2	6	2007269	2007274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5566	NC_011083	T	6	6	2007283	2007288	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5567	NC_011083	T	7	7	2007310	2007316	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5568	NC_011083	TAA	2	6	2008254	2008259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5569	NC_011083	AAT	2	6	2008264	2008269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5570	NC_011083	TAA	2	6	2008361	2008366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5571	NC_011083	T	6	6	2008372	2008377	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5572	NC_011083	GT	3	6	2008540	2008545	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5573	NC_011083	AT	3	6	2009188	2009193	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5574	NC_011083	AGCA	2	8	2009194	2009201	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5575	NC_011083	TAG	2	6	2009307	2009312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5576	NC_011083	TAAC	2	8	2009322	2009329	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5577	NC_011083	CTCAA	2	10	2009362	2009371	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
5578	NC_011083	ATG	2	6	2009378	2009383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5579	NC_011083	ATG	2	6	2009395	2009400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5580	NC_011083	GCAC	2	8	2009464	2009471	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5581	NC_011083	CAT	2	6	2009531	2009536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5582	NC_011083	AAT	2	6	2009538	2009543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5583	NC_011083	CTG	2	6	2009550	2009555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5584	NC_011083	TAA	2	6	2009573	2009578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5585	NC_011083	CTGC	2	8	2009585	2009592	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5586	NC_011083	CCA	2	6	2009626	2009631	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5587	NC_011083	AACA	2	8	2009722	2009729	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5588	NC_011083	AGC	2	6	2009731	2009736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5589	NC_011083	CTGT	2	8	2009741	2009748	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5590	NC_011083	TCA	2	6	2009781	2009786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5591	NC_011083	ATG	2	6	2009847	2009852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5592	NC_011083	GCC	2	6	2009949	2009954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5593	NC_011083	ACC	2	6	2009987	2009992	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5594	NC_011083	GCTG	2	8	2010018	2010025	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5595	NC_011083	GCA	2	6	2010027	2010032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5596	NC_011083	GAC	2	6	2010033	2010038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5597	NC_011083	CAG	2	6	2010041	2010046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5598	NC_011083	GTT	2	6	2010051	2010056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5599	NC_011083	TAA	2	6	2010079	2010084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5600	NC_011083	ATT	2	6	2010095	2010100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5601	NC_011083	AT	3	6	2010134	2010139	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5602	NC_011083	A	6	6	2010195	2010200	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5603	NC_011083	TTTA	2	8	2010217	2010224	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5604	NC_011083	GCC	2	6	2010266	2010271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5605	NC_011083	CAG	2	6	2010456	2010461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5606	NC_011083	AG	3	6	2010489	2010494	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5607	NC_011083	GCG	2	6	2010609	2010614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5608	NC_011083	ATC	2	6	2010725	2010730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5609	NC_011083	GAA	2	6	2011771	2011776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5610	NC_011083	A	6	6	2011814	2011819	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5611	NC_011083	GAA	2	6	2011833	2011838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5612	NC_011083	GAA	2	6	2011861	2011866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5613	NC_011083	CCTT	2	8	2011885	2011892	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5614	NC_011083	TGGC	2	8	2011897	2011904	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5615	NC_011083	TGAAG	2	10	2011914	2011923	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
5616	NC_011083	TTGA	2	8	2011924	2011931	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5617	NC_011083	AACA	2	8	2011935	2011942	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5618	NC_011083	TCC	2	6	2011968	2011973	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5619	NC_011083	GAGC	2	8	2011978	2011985	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5620	NC_011083	AATT	2	8	2012026	2012033	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5621	NC_011083	AAATA	2	10	2012042	2012051	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5622	NC_011083	TTTA	2	8	2012069	2012076	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5623	NC_011083	TTTA	2	8	2012100	2012107	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5624	NC_011083	A	6	6	2012297	2012302	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5625	NC_011083	GAA	2	6	2012303	2012308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5626	NC_011083	GTG	2	6	2012332	2012337	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5627	NC_011083	CTG	2	6	2012349	2012354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5628	NC_011083	GACA	2	8	2012442	2012449	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5629	NC_011083	CTT	2	6	2012453	2012458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5630	NC_011083	T	6	6	2012759	2012764	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5632	NC_011083	GTT	2	6	2012841	2012846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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