MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254 chromosome

Total Repeats: 13053

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_011080	CTTCA	2	10	617923	617932	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
1502	NC_011080	GC	3	6	618006	618011	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1503	NC_011080	CAA	2	6	618023	618028	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1504	NC_011080	TGAC	2	8	618140	618147	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1505	NC_011080	ATG	2	6	618164	618169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_011080	ACAG	2	8	618173	618180	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1507	NC_011080	TG	3	6	618183	618188	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_011080	TAG	2	6	618197	618202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_011080	GAA	2	6	618221	618226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_011080	CAT	2	6	618236	618241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1511	NC_011080	TG	3	6	618254	618259	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_011080	GTT	2	6	618301	618306	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_011080	CTG	2	6	618436	618441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1514	NC_011080	CTG	2	6	618468	618473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1515	NC_011080	TAA	2	6	618619	618624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_011080	A	6	6	618623	618628	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_011080	T	6	6	618649	618654	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_011080	CT	3	6	618718	618723	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1519	NC_011080	GGC	2	6	618749	618754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1520	NC_011080	ACT	2	6	618794	618799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1521	NC_011080	GGTAC	2	10	618800	618809	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1522	NC_011080	TA	3	6	618837	618842	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_011080	ATGT	2	8	618854	618861	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_011080	CTA	2	6	618876	618881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1525	NC_011080	TAG	2	6	618882	618887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_011080	TTGAT	2	10	622179	622188	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_011080	AAT	2	6	622203	622208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_011080	TAT	2	6	622239	622244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_011080	GTT	2	6	622254	622259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_011080	AC	3	6	622310	622315	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1531	NC_011080	TTG	2	6	622393	622398	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_011080	GC	3	6	622458	622463	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1533	NC_011080	CTC	2	6	622581	622586	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1534	NC_011080	ATT	2	6	622617	622622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_011080	GATG	2	8	622631	622638	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_011080	GTC	2	6	622656	622661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1537	NC_011080	TCA	2	6	622757	622762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1538	NC_011080	A	6	6	622830	622835	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_011080	GC	3	6	623038	623043	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1540	NC_011080	GGGA	2	8	623138	623145	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_011080	CAA	2	6	623213	623218	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1542	NC_011080	GTC	2	6	623232	623237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1543	NC_011080	CTT	2	6	623240	623245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1544	NC_011080	GGC	2	6	623272	623277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1545	NC_011080	AG	3	6	623295	623300	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_011080	GCA	2	6	623321	623326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1547	NC_011080	CAG	2	6	623347	623352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1548	NC_011080	ATTT	2	8	624536	624543	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_011080	A	6	6	624645	624650	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_011080	T	6	6	624675	624680	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_011080	TTAT	2	8	624685	624692	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_011080	ATAA	2	8	626064	626071	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_011080	T	7	7	626093	626099	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_011080	TCG	2	6	627056	627061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1555	NC_011080	TGA	2	6	627091	627096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_011080	ATG	2	6	627097	627102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_011080	A	6	6	628353	628358	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_011080	GC	3	6	628452	628457	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1559	NC_011080	CTTTT	2	10	628461	628470	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1560	NC_011080	T	7	7	628487	628493	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_011080	TAACGT	2	12	628500	628511	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1562	NC_011080	T	6	6	630002	630007	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_011080	TC	3	6	631292	631297	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1564	NC_011080	CAG	2	6	631307	631312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1565	NC_011080	CGT	2	6	631563	631568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1566	NC_011080	CAA	2	6	631575	631580	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1567	NC_011080	AGGG	2	8	633580	633587	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_011080	CGTT	2	8	633595	633602	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1569	NC_011080	AGTA	2	8	633646	633653	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_011080	CGT	2	6	633682	633687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1571	NC_011080	A	6	6	636482	636487	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_011080	AGA	2	6	636506	636511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_011080	GCC	2	6	636574	636579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1574	NC_011080	TCC	2	6	637606	637611	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1575	NC_011080	ATA	2	6	637624	637629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_011080	TAA	2	6	637638	637643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_011080	ATT	2	6	641300	641305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_011080	A	6	6	641399	641404	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_011080	TGGT	2	8	642098	642105	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_011080	CAG	2	6	642123	642128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1581	NC_011080	GGA	2	6	642157	642162	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_011080	GTCGC	2	10	643183	643192	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1583	NC_011080	ACTC	2	8	643259	643266	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1584	NC_011080	TG	3	6	643338	643343	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_011080	TTA	2	6	643345	643350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_011080	TGCGG	2	10	643378	643387	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
1587	NC_011080	T	6	6	645922	645927	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_011080	TCCC	2	8	645934	645941	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1589	NC_011080	GAGG	2	8	645947	645954	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_011080	GTG	2	6	648282	648287	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_011080	CG	3	6	648298	648303	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1592	NC_011080	TGCAAA	2	12	648328	648339	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1593	NC_011080	AAT	2	6	648348	648353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_011080	AT	3	6	648361	648366	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_011080	TA	3	6	648376	648381	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_011080	ATA	2	6	648390	648395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_011080	GTT	2	6	653760	653765	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_011080	ATA	2	6	653797	653802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_011080	ATT	2	6	653810	653815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_011080	T	6	6	653821	653826	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_011080	TG	3	6	655182	655187	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_011080	TATC	2	8	658014	658021	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1603	NC_011080	A	7	7	658065	658071	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_011080	TCTG	2	8	659364	659371	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1605	NC_011080	TTA	2	6	660367	660372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_011080	CAG	3	9	660401	660409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1607	NC_011080	ATA	2	6	660497	660502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_011080	ATT	2	6	660506	660511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_011080	AAG	2	6	660528	660533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_011080	GAA	2	6	660550	660555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_011080	TG	3	6	660577	660582	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_011080	CAA	2	6	660604	660609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1613	NC_011080	TA	3	6	660634	660639	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_011080	GGA	2	6	660653	660658	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_011080	AG	3	6	663466	663471	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_011080	GCA	2	6	665524	665529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1617	NC_011080	TGTAA	2	10	665562	665571	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_011080	A	6	6	665570	665575	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_011080	TGT	3	9	665599	665607	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_011080	GTT	2	6	665608	665613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_011080	TC	3	6	665651	665656	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1622	NC_011080	ACA	2	6	665673	665678	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1623	NC_011080	T	6	6	667790	667795	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_011080	TCT	2	6	669191	669196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1625	NC_011080	GTT	2	6	669201	669206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_011080	GT	3	6	669261	669266	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_011080	CAA	2	6	669267	669272	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1628	NC_011080	AAT	2	6	672326	672331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_011080	TAT	2	6	672373	672378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_011080	AT	3	6	672392	672397	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_011080	CTT	2	6	672444	672449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1632	NC_011080	T	6	6	673327	673332	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_011080	AAT	2	6	673405	673410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_011080	TTA	2	6	673426	673431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1635	NC_011080	TTTA	2	8	673446	673453	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1636	NC_011080	AAT	2	6	673491	673496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1637	NC_011080	T	6	6	674418	674423	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1638	NC_011080	ATG	3	9	674454	674462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1913	NC_011080	TTC	2	6	791919	791924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1914	NC_011080	ATA	2	6	793501	793506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1916	NC_011080	GTG	2	6	795315	795320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1917	NC_011080	TGA	2	6	795322	795327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1919	NC_011080	TAA	2	6	795408	795413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1931	NC_011080	TTA	2	6	802165	802170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1944	NC_011080	GCC	2	6	806289	806294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1952	NC_011080	TAA	2	6	813107	813112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1953	NC_011080	ATT	2	6	813155	813160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1972	NC_011080	GTC	2	6	815716	815721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1975	NC_011080	AT	3	6	817326	817331	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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