MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Stenotrophomonas maltophilia K279a chromosome

Total Repeats: 11691

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_010943	CCCTG	2	10	3397023	3397032	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
8002	NC_010943	GCC	2	6	3398851	3398856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8003	NC_010943	GCCG	2	8	3398873	3398880	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8004	NC_010943	GGCGG	2	10	3398923	3398932	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
8005	NC_010943	GCAA	2	8	3399025	3399032	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8006	NC_010943	CCAT	2	8	3399063	3399070	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8007	NC_010943	CCGCC	2	10	3399097	3399106	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
8008	NC_010943	CCACG	2	10	3399136	3399145	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
8009	NC_010943	GC	3	6	3399202	3399207	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8010	NC_010943	GAA	2	6	3399227	3399232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8011	NC_010943	GC	3	6	3399248	3399253	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8012	NC_010943	CGG	2	6	3399257	3399262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8013	NC_010943	AGG	2	6	3399304	3399309	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8014	NC_010943	TTG	2	6	3399326	3399331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8015	NC_010943	CAA	2	6	3399369	3399374	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8016	NC_010943	ACGG	2	8	3400096	3400103	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8017	NC_010943	TTGC	2	8	3400110	3400117	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8018	NC_010943	GGCA	2	8	3402490	3402497	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8019	NC_010943	TCG	2	6	3402498	3402503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8020	NC_010943	AC	3	6	3402517	3402522	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8021	NC_010943	AGA	2	6	3402540	3402545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8022	NC_010943	TGCC	2	8	3403641	3403648	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8023	NC_010943	TCA	2	6	3403724	3403729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8024	NC_010943	CTT	2	6	3403756	3403761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8025	NC_010943	GCA	2	6	3403765	3403770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8027	NC_010943	CGC	2	6	3403837	3403842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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8029	NC_010943	GACA	2	8	3403876	3403883	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8030	NC_010943	GCCC	2	8	3403903	3403910	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
8031	NC_010943	CGC	2	6	3404201	3404206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8032	NC_010943	GC	3	6	3404470	3404475	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8033	NC_010943	CGG	2	6	3404483	3404488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8034	NC_010943	TTC	2	6	3404520	3404525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8035	NC_010943	GCT	2	6	3405454	3405459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8036	NC_010943	GAT	2	6	3405678	3405683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8037	NC_010943	GCG	2	6	3405730	3405735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8038	NC_010943	AGA	2	6	3406398	3406403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8039	NC_010943	CA	4	8	3406439	3406446	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8040	NC_010943	GCA	2	6	3406449	3406454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8041	NC_010943	TGG	2	6	3406461	3406466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8042	NC_010943	CGC	2	6	3406475	3406480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8043	NC_010943	TGC	2	6	3406504	3406509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8044	NC_010943	GCG	2	6	3406531	3406536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8045	NC_010943	GC	3	6	3407237	3407242	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8046	NC_010943	CCT	2	6	3407807	3407812	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8047	NC_010943	GCC	2	6	3407864	3407869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8048	NC_010943	CCCG	2	8	3407876	3407883	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
8049	NC_010943	GCT	2	6	3407908	3407913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8050	NC_010943	GCC	2	6	3407927	3407932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8051	NC_010943	CTG	3	9	3407939	3407947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8052	NC_010943	GCC	2	6	3407948	3407953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8053	NC_010943	CCG	2	6	3407955	3407960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8054	NC_010943	GCC	2	6	3407963	3407968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8055	NC_010943	GCGCT	2	10	3407996	3408005	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
8056	NC_010943	CAA	2	6	3408019	3408024	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8057	NC_010943	CGA	2	6	3408163	3408168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8058	NC_010943	ACAAGG	2	12	3408249	3408260	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
8059	NC_010943	CCG	2	6	3408349	3408354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8060	NC_010943	TGCCG	2	10	3408377	3408386	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
8061	NC_010943	GT	3	6	3408393	3408398	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8062	NC_010943	GCCG	2	8	3408406	3408413	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8063	NC_010943	CG	3	6	3408412	3408417	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8064	NC_010943	GCGT	2	8	3408435	3408442	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8065	NC_010943	A	6	6	3409300	3409305	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8066	NC_010943	TGC	2	6	3409316	3409321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8067	NC_010943	TCA	2	6	3409336	3409341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8068	NC_010943	CGA	2	6	3409369	3409374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8069	NC_010943	C	6	6	3409382	3409387	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8070	NC_010943	TGC	2	6	3409427	3409432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8073	NC_010943	TGG	2	6	3412546	3412551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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8075	NC_010943	GGCTC	2	10	3412632	3412641	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
8076	NC_010943	G	6	6	3413652	3413657	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
8077	NC_010943	CCG	2	6	3413714	3413719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8078	NC_010943	CGT	2	6	3413732	3413737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8079	NC_010943	A	6	6	3413754	3413759	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8080	NC_010943	CCA	2	6	3414555	3414560	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8081	NC_010943	GCG	2	6	3414619	3414624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8082	NC_010943	GGC	2	6	3414663	3414668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8083	NC_010943	CGGAC	2	10	3415254	3415263	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
8084	NC_010943	GGGC	2	8	3417198	3417205	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
8085	NC_010943	GCG	2	6	3417223	3417228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8086	NC_010943	A	6	6	3417239	3417244	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8087	NC_010943	GGT	2	6	3417299	3417304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8088	NC_010943	CGGC	2	8	3417324	3417331	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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8091	NC_010943	CCG	2	6	3417543	3417548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8092	NC_010943	CCGT	2	8	3417552	3417559	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8093	NC_010943	GCCG	2	8	3417587	3417594	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8094	NC_010943	GC	3	6	3419767	3419772	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8095	NC_010943	GTC	2	6	3421604	3421609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8096	NC_010943	CACC	2	8	3422837	3422844	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
8097	NC_010943	GCC	2	6	3425025	3425030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8098	NC_010943	TAC	2	6	3425073	3425078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8099	NC_010943	AAAAC	2	10	3425079	3425088	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
8100	NC_010943	CAGG	2	8	3425471	3425478	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8101	NC_010943	GCCCGG	2	12	3425545	3425556	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8102	NC_010943	CAA	2	6	3426541	3426546	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8103	NC_010943	GAG	2	6	3426957	3426962	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8104	NC_010943	TGG	2	6	3427051	3427056	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8105	NC_010943	GCA	2	6	3427083	3427088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8106	NC_010943	C	7	7	3429759	3429765	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8107	NC_010943	GCCT	2	8	3431935	3431942	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8108	NC_010943	TTGG	2	8	3431950	3431957	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8109	NC_010943	TGCC	2	8	3432068	3432075	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8110	NC_010943	CCT	2	6	3432085	3432090	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8111	NC_010943	CCG	2	6	3432106	3432111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8112	NC_010943	GCC	2	6	3432116	3432121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8113	NC_010943	TGA	2	6	3432144	3432149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8114	NC_010943	ACG	2	6	3432238	3432243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8115	NC_010943	CGA	2	6	3432347	3432352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8117	NC_010943	TCAT	2	8	3432425	3432432	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8118	NC_010943	CGA	2	6	3432506	3432511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8119	NC_010943	CTG	2	6	3432551	3432556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8120	NC_010943	CT	3	6	3432562	3432567	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8121	NC_010943	GAG	2	6	3432572	3432577	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8122	NC_010943	TCT	2	6	3435652	3435657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8123	NC_010943	GCG	2	6	3444540	3444545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8124	NC_010943	CTGC	2	8	3444560	3444567	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8125	NC_010943	TGGCG	2	10	3444577	3444586	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
8126	NC_010943	GC	3	6	3446657	3446662	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8127	NC_010943	GC	3	6	3447663	3447668	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8128	NC_010943	TTAC	2	8	3447683	3447690	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8129	NC_010943	ACC	2	6	3447737	3447742	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8130	NC_010943	TG	3	6	3449069	3449074	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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8132	NC_010943	G	6	6	3449175	3449180	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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8251	NC_010943	GCCA	2	8	3507927	3507934	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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8255	NC_010943	GT	3	6	3509404	3509409	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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8259	NC_010943	GTGG	2	8	3511814	3511821	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
8260	NC_010943	CCAT	2	8	3511863	3511870	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8261	NC_010943	CCCA	2	8	3511887	3511894	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
8262	NC_010943	GGGT	2	8	3512063	3512070	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
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