MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Shigella boydii CDC 3083-94 plasmid pBS512_211

Total Repeats: 1260

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_010660	TACC	2	8	180987	180994	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1002	NC_010660	CGG	2	6	181007	181012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_010660	TGG	2	6	181019	181024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_010660	ATCC	2	8	181050	181057	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1005	NC_010660	GTGCT	2	10	181058	181067	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1006	NC_010660	GTG	2	6	181148	181153	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_010660	GGA	2	6	181158	181163	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_010660	GGCT	2	8	181174	181181	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1009	NC_010660	TCG	2	6	181189	181194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_010660	CTG	2	6	181261	181266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_010660	TCG	2	6	181287	181292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_010660	TG	3	6	181293	181298	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_010660	TTC	2	6	181300	181305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_010660	TGA	2	6	181308	181313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_010660	TGG	2	6	181343	181348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_010660	GTC	2	6	181823	181828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_010660	GTT	2	6	181864	181869	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_010660	TCA	2	6	181976	181981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_010660	AAG	2	6	181987	181992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_010660	G	6	6	182020	182025	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_010660	GAA	2	6	182053	182058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_010660	GTG	2	6	182104	182109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_010660	GCA	2	6	182133	182138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_010660	ATC	2	6	182144	182149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_010660	GCA	2	6	182160	182165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_010660	CGT	2	6	182173	182178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_010660	GGA	2	6	182214	182219	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_010660	GAT	2	6	182233	182238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_010660	ATT	2	6	183003	183008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_010660	GCA	2	6	183039	183044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1031	NC_010660	GGCC	2	8	183058	183065	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1032	NC_010660	GACCT	2	10	183196	183205	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1033	NC_010660	ATG	2	6	183229	183234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_010660	G	8	8	183244	183251	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_010660	TCA	2	6	183301	183306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_010660	TGA	2	6	183337	183342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_010660	CGGA	2	8	183343	183350	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1038	NC_010660	AC	3	6	183431	183436	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1039	NC_010660	GGT	2	6	183443	183448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_010660	GCA	2	6	183461	183466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_010660	GGC	2	6	183731	183736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1042	NC_010660	AAC	2	6	183850	183855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_010660	CGCA	2	8	183867	183874	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1044	NC_010660	GCA	2	6	183911	183916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1045	NC_010660	CTG	2	6	183978	183983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_010660	GCC	2	6	184004	184009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1047	NC_010660	AGC	2	6	184066	184071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1048	NC_010660	CAT	2	6	184157	184162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1049	NC_010660	CCGT	2	8	184250	184257	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1050	NC_010660	ATG	2	6	184323	184328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_010660	GCT	2	6	184362	184367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_010660	TCGC	2	8	184373	184380	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1053	NC_010660	CGT	2	6	184431	184436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1054	NC_010660	TCG	2	6	184480	184485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_010660	CTG	2	6	184524	184529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_010660	G	6	6	184646	184651	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_010660	CCA	2	6	184666	184671	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1058	NC_010660	TCA	2	6	184672	184677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1059	NC_010660	AG	3	6	184748	184753	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_010660	CTGG	2	8	184874	184881	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1061	NC_010660	GGT	2	6	185036	185041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_010660	TTC	2	6	185048	185053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_010660	CAG	2	6	185060	185065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_010660	CCGG	2	8	185078	185085	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1065	NC_010660	A	6	6	185086	185091	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_010660	CGG	2	6	185153	185158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_010660	GTT	2	6	185202	185207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_010660	CCTG	2	8	185234	185241	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1069	NC_010660	CA	3	6	185339	185344	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1070	NC_010660	CCT	2	6	185455	185460	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1071	NC_010660	GGT	2	6	185465	185470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_010660	CAG	2	6	185556	185561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1073	NC_010660	TGG	2	6	185614	185619	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_010660	CTG	2	6	185622	185627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1075	NC_010660	TGC	2	6	185645	185650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1076	NC_010660	ATGTGG	2	12	185719	185730	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_010660	CTG	2	6	185751	185756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1078	NC_010660	CGT	2	6	185767	185772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1079	NC_010660	TTC	2	6	185791	185796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1080	NC_010660	CGC	2	6	185827	185832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1081	NC_010660	GA	3	6	185838	185843	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_010660	GC	3	6	185882	185887	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1083	NC_010660	GGT	2	6	185927	185932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_010660	CA	3	6	185960	185965	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1085	NC_010660	TGC	2	6	185995	186000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1086	NC_010660	TGGGGC	2	12	186025	186036	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
1087	NC_010660	CA	3	6	186038	186043	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1088	NC_010660	GCA	2	6	186119	186124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1089	NC_010660	TGG	2	6	186184	186189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_010660	CAG	2	6	186306	186311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1091	NC_010660	TGC	2	6	186320	186325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1092	NC_010660	TCA	2	6	186334	186339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1093	NC_010660	GCA	2	6	186533	186538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1094	NC_010660	ATG	2	6	186697	186702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_010660	GCAGGT	2	12	186728	186739	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
1096	NC_010660	CGT	2	6	186786	186791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1097	NC_010660	TGCCCT	2	12	186818	186829	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
1098	NC_010660	CAG	2	6	187095	187100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1099	NC_010660	AGC	2	6	187282	187287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_010660	CAA	2	6	187334	187339	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1101	NC_010660	ACCGG	2	10	187382	187391	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1102	NC_010660	GGC	2	6	187445	187450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1103	NC_010660	GCCGT	2	10	187453	187462	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1104	NC_010660	CCG	2	6	187576	187581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1105	NC_010660	CTG	2	6	187710	187715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1106	NC_010660	ATA	2	6	187720	187725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_010660	GTG	2	6	187765	187770	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_010660	TGG	2	6	187771	187776	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_010660	CCGT	2	8	187796	187803	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1110	NC_010660	G	6	6	187837	187842	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_010660	ACA	2	6	187852	187857	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1112	NC_010660	CCG	2	6	187934	187939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1113	NC_010660	ACCTG	2	10	187991	188000	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1114	NC_010660	TGC	2	6	188155	188160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1115	NC_010660	GCA	2	6	188171	188176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1116	NC_010660	A	6	6	189961	189966	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_010660	CTT	2	6	190020	190025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_010660	T	6	6	190093	190098	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_010660	TG	3	6	190139	190144	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_010660	G	6	6	190157	190162	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_010660	AT	3	6	190210	190215	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_010660	TAT	2	6	190224	190229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_010660	GTT	2	6	190274	190279	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_010660	GGT	2	6	190383	190388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_010660	ATG	2	6	190397	190402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_010660	GAAT	2	8	190494	190501	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_010660	CCGGG	2	10	190519	190528	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1128	NC_010660	ACA	2	6	190551	190556	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1129	NC_010660	ACA	2	6	190594	190599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1130	NC_010660	C	6	6	190634	190639	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1131	NC_010660	TAAA	2	8	190657	190664	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_010660	TCAT	2	8	190680	190687	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1133	NC_010660	TGC	2	6	191026	191031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1252	NC_010660	CCA	2	6	210464	210469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1253	NC_010660	GTCTG	2	10	210524	210533	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1254	NC_010660	TAA	2	6	210632	210637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1255	NC_010660	CGT	2	6	210696	210701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1258	NC_010660	A	7	7	210766	210772	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1259	NC_010660	ATC	2	6	210814	210819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1260	NC_010660	CTA	2	6	210871	210876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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