MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shigella boydii CDC 3083-94 chromosome

Total Repeats: 21560

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
20501	NC_010658	GCAG	2	8	4414632	4414639	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
20502	NC_010658	GGT	2	6	4414671	4414676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20503	NC_010658	GAT	2	6	4414734	4414739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20504	NC_010658	GTT	2	6	4414791	4414796	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20505	NC_010658	GCGCTG	2	12	4414798	4414809	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
20506	NC_010658	TGC	3	9	4414823	4414831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20507	NC_010658	CAT	2	6	4414854	4414859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20508	NC_010658	CAG	2	6	4414882	4414887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20509	NC_010658	GTT	2	6	4414908	4414913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20510	NC_010658	ATG	2	6	4414993	4414998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20511	NC_010658	GACG	2	8	4415019	4415026	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
20512	NC_010658	CAT	2	6	4415063	4415068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20513	NC_010658	A	6	6	4415101	4415106	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20514	NC_010658	GGCT	2	8	4415137	4415144	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
20515	NC_010658	ACA	2	6	4415159	4415164	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20516	NC_010658	TGA	2	6	4415183	4415188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20517	NC_010658	TCT	2	6	4415192	4415197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20518	NC_010658	GGCA	2	8	4415244	4415251	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
20519	NC_010658	TCA	3	9	4415309	4415317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20520	NC_010658	CT	3	6	4415347	4415352	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20521	NC_010658	CTAT	2	8	4415417	4415424	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
20522	NC_010658	ATT	2	6	4415524	4415529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20523	NC_010658	TTC	2	6	4415548	4415553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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20525	NC_010658	CGG	2	6	4415589	4415594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
20526	NC_010658	GCG	2	6	4415602	4415607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
20527	NC_010658	GAT	2	6	4415631	4415636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20528	NC_010658	CCG	2	6	4415719	4415724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
20529	NC_010658	ATG	2	6	4415725	4415730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20530	NC_010658	CTT	2	6	4415736	4415741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20531	NC_010658	TCA	2	6	4415768	4415773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20532	NC_010658	TTC	2	6	4415797	4415802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20533	NC_010658	GC	3	6	4415817	4415822	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20534	NC_010658	AGA	3	9	4415823	4415831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20535	NC_010658	AAC	2	6	4415840	4415845	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20536	NC_010658	TAA	2	6	4415863	4415868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20537	NC_010658	ATT	2	6	4418890	4418895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20538	NC_010658	CCT	2	6	4418897	4418902	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20539	NC_010658	A	6	6	4418942	4418947	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20540	NC_010658	ACA	2	6	4418956	4418961	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20541	NC_010658	A	6	6	4419533	4419538	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20542	NC_010658	GCAAA	2	10	4419555	4419564	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
20543	NC_010658	TGC	2	6	4419721	4419726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20544	NC_010658	GCCA	2	8	4419815	4419822	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
20545	NC_010658	CAC	2	6	4419837	4419842	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20546	NC_010658	CAA	2	6	4419911	4419916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20547	NC_010658	CAGC	2	8	4419948	4419955	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
20548	NC_010658	T	6	6	4420062	4420067	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20549	NC_010658	AAT	2	6	4420148	4420153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20550	NC_010658	CAC	2	6	4420265	4420270	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20551	NC_010658	AGG	2	6	4420288	4420293	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20552	NC_010658	CAT	2	6	4420338	4420343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20553	NC_010658	GCA	2	6	4420363	4420368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20554	NC_010658	CCT	2	6	4420655	4420660	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20555	NC_010658	TG	3	6	4420674	4420679	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
20556	NC_010658	CTC	2	6	4420682	4420687	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20557	NC_010658	TGA	2	6	4420690	4420695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20558	NC_010658	TCT	2	6	4420696	4420701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20559	NC_010658	TTTAAT	2	12	4420704	4420715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20560	NC_010658	AAG	2	6	4420724	4420729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20561	NC_010658	GTT	2	6	4420754	4420759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20562	NC_010658	A	6	6	4420762	4420767	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20563	NC_010658	TGA	2	6	4420783	4420788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20564	NC_010658	AGTT	2	8	4420803	4420810	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
20565	NC_010658	ATTT	2	8	4420830	4420837	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20566	NC_010658	AGG	2	6	4420944	4420949	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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20570	NC_010658	TCAGAT	2	12	4423449	4423460	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20571	NC_010658	GCCA	2	8	4423536	4423543	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
20572	NC_010658	CAG	2	6	4423576	4423581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20573	NC_010658	AGA	2	6	4423586	4423591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20574	NC_010658	TCC	2	6	4423641	4423646	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20575	NC_010658	CAGC	2	8	4423669	4423676	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
20576	NC_010658	ATCAC	2	10	4423732	4423741	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
20577	NC_010658	T	6	6	4423782	4423787	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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20580	NC_010658	GCGAT	2	10	4428489	4428498	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
20581	NC_010658	CCA	2	6	4428536	4428541	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20582	NC_010658	CGA	2	6	4428600	4428605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20583	NC_010658	TGA	2	6	4428619	4428624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20584	NC_010658	CCA	2	6	4428746	4428751	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20585	NC_010658	TCA	2	6	4428807	4428812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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20589	NC_010658	CGT	2	6	4429033	4429038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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20591	NC_010658	ATC	2	6	4429055	4429060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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20593	NC_010658	GGC	2	6	4429139	4429144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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20596	NC_010658	GCG	2	6	4429248	4429253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
20597	NC_010658	TC	3	6	4429310	4429315	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20598	NC_010658	CT	3	6	4430126	4430131	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20599	NC_010658	T	6	6	4430131	4430136	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20600	NC_010658	TGA	2	6	4430154	4430159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20601	NC_010658	GGA	2	6	4430173	4430178	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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20603	NC_010658	TGA	2	6	4430240	4430245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20604	NC_010658	T	6	6	4430264	4430269	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20605	NC_010658	AAATC	2	10	4430279	4430288	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
20606	NC_010658	CAC	2	6	4430302	4430307	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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20609	NC_010658	TAT	2	6	4431683	4431688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20610	NC_010658	TCA	2	6	4431733	4431738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20611	NC_010658	AAG	2	6	4431762	4431767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20612	NC_010658	TGC	2	6	4431779	4431784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20613	NC_010658	ACC	2	6	4431821	4431826	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20614	NC_010658	GCAA	2	8	4431850	4431857	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
20615	NC_010658	CAA	2	6	4431884	4431889	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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20617	NC_010658	CG	3	6	4431995	4432000	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20618	NC_010658	TCG	2	6	4432033	4432038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20619	NC_010658	GCT	2	6	4432058	4432063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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20621	NC_010658	A	6	6	4432094	4432099	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20622	NC_010658	ACCG	2	8	4432175	4432182	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
20623	NC_010658	GTG	2	6	4432245	4432250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20624	NC_010658	CTGG	2	8	4432284	4432291	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
20625	NC_010658	GCG	2	6	4432368	4432373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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