MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shigella boydii CDC 3083-94 chromosome

Total Repeats: 21560

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19501	NC_010658	AAC	2	6	4211859	4211864	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19502	NC_010658	AGC	2	6	4211949	4211954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19503	NC_010658	CAT	2	6	4211955	4211960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19504	NC_010658	AAAG	2	8	4211963	4211970	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
19505	NC_010658	TGT	2	6	4212056	4212061	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19506	NC_010658	G	6	6	4212299	4212304	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
19507	NC_010658	TGA	2	6	4212398	4212403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19508	NC_010658	CAA	2	6	4212425	4212430	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19509	NC_010658	GGT	2	6	4212497	4212502	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19510	NC_010658	GA	3	6	4212527	4212532	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19511	NC_010658	GCTG	2	8	4212641	4212648	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
19512	NC_010658	TTA	2	6	4212656	4212661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19513	NC_010658	CGG	2	6	4212780	4212785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19514	NC_010658	ATG	2	6	4212856	4212861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19515	NC_010658	ACC	2	6	4213051	4213056	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19516	NC_010658	TGG	2	6	4213111	4213116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19517	NC_010658	TCC	2	6	4213137	4213142	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19518	NC_010658	GGA	2	6	4213154	4213159	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19519	NC_010658	AGG	2	6	4213192	4213197	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19520	NC_010658	GGT	2	6	4213274	4213279	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19521	NC_010658	CGG	2	6	4213361	4213366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19522	NC_010658	TCA	2	6	4213389	4213394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19523	NC_010658	CGT	2	6	4213469	4213474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19524	NC_010658	G	6	6	4213518	4213523	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
19525	NC_010658	GAC	3	9	4213700	4213708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19526	NC_010658	GT	3	6	4213722	4213727	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19527	NC_010658	GA	3	6	4213809	4213814	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19528	NC_010658	TGA	2	6	4213861	4213866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19529	NC_010658	GGC	2	6	4213881	4213886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19530	NC_010658	GGT	2	6	4213895	4213900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19531	NC_010658	A	7	7	4214046	4214052	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19532	NC_010658	TCT	2	6	4214075	4214080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19533	NC_010658	GGCA	2	8	4214089	4214096	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
19534	NC_010658	GGC	2	6	4214104	4214109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19535	NC_010658	CTT	2	6	4214197	4214202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19536	NC_010658	GTTG	2	8	4214239	4214246	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19537	NC_010658	CCA	2	6	4214277	4214282	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19538	NC_010658	CGC	2	6	4214295	4214300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19539	NC_010658	CA	3	6	4214306	4214311	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19540	NC_010658	TGC	2	6	4214339	4214344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19541	NC_010658	AAC	2	6	4214351	4214356	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19542	NC_010658	AGGA	2	8	4214414	4214421	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19543	NC_010658	CTAG	2	8	4214427	4214434	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19544	NC_010658	CTG	2	6	4214458	4214463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19545	NC_010658	A	6	6	4214466	4214471	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19546	NC_010658	GT	3	6	4214474	4214479	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19547	NC_010658	TCC	2	6	4214514	4214519	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19548	NC_010658	GCG	2	6	4214537	4214542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19549	NC_010658	TAA	2	6	4214548	4214553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19550	NC_010658	TC	3	6	4214560	4214565	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19551	NC_010658	TCT	2	6	4215644	4215649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19552	NC_010658	T	6	6	4215705	4215710	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19553	NC_010658	AGG	2	6	4215729	4215734	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19554	NC_010658	TTAA	2	8	4215781	4215788	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19555	NC_010658	GAG	2	6	4215899	4215904	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19556	NC_010658	ACC	2	6	4217514	4217519	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19557	NC_010658	CAA	3	9	4218849	4218857	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19558	NC_010658	CGC	2	6	4218891	4218896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19559	NC_010658	CGC	2	6	4218989	4218994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19560	NC_010658	TGA	2	6	4219015	4219020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19561	NC_010658	GCA	2	6	4221743	4221748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19562	NC_010658	ACA	2	6	4222501	4222506	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19563	NC_010658	TTA	2	6	4222537	4222542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19564	NC_010658	AAT	2	6	4222574	4222579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19565	NC_010658	TGA	2	6	4225213	4225218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19566	NC_010658	AT	3	6	4225273	4225278	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19567	NC_010658	CCA	2	6	4225348	4225353	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19568	NC_010658	T	7	7	4225381	4225387	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19569	NC_010658	CCAG	2	8	4225457	4225464	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
19570	NC_010658	TGAG	2	8	4225515	4225522	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
19571	NC_010658	TGA	2	6	4225557	4225562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19572	NC_010658	CGC	2	6	4225574	4225579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19573	NC_010658	GTGA	2	8	4225602	4225609	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
19574	NC_010658	GCC	3	9	4225649	4225657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19575	NC_010658	GGCA	2	8	4225661	4225668	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
19576	NC_010658	T	6	6	4225736	4225741	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19577	NC_010658	CCG	2	6	4225759	4225764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19578	NC_010658	CG	3	6	4225763	4225768	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19579	NC_010658	GTC	2	6	4225772	4225777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19580	NC_010658	GCC	2	6	4225784	4225789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19581	NC_010658	GC	3	6	4225843	4225848	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19582	NC_010658	GAA	2	6	4225874	4225879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19583	NC_010658	ATC	2	6	4225955	4225960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19584	NC_010658	TGC	2	6	4226000	4226005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19585	NC_010658	CGG	2	6	4226008	4226013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19586	NC_010658	GC	3	6	4226060	4226065	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19587	NC_010658	TCGGTA	2	12	4226085	4226096	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
19588	NC_010658	AATC	2	8	4226137	4226144	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
19589	NC_010658	GCC	2	6	4226168	4226173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19590	NC_010658	GAT	2	6	4226236	4226241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19591	NC_010658	CGT	2	6	4226311	4226316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19592	NC_010658	CAG	2	6	4226321	4226326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19593	NC_010658	CGC	2	6	4226374	4226379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19594	NC_010658	CCAC	2	8	4226380	4226387	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
19595	NC_010658	ATG	2	6	4228434	4228439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19596	NC_010658	CCT	2	6	4228484	4228489	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19597	NC_010658	GTG	2	6	4228507	4228512	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19598	NC_010658	ATT	2	6	4228624	4228629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19599	NC_010658	A	6	6	4228710	4228715	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19600	NC_010658	GCTG	2	8	4228822	4228829	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
19601	NC_010658	GTT	2	6	4228860	4228865	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19602	NC_010658	GTG	2	6	4228935	4228940	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19603	NC_010658	TGGC	2	8	4228955	4228962	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
19604	NC_010658	GCA	2	6	4229051	4229056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19605	NC_010658	GTC	2	6	4229202	4229207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19606	NC_010658	CCTG	2	8	4229211	4229218	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
19607	NC_010658	TAT	2	6	4229242	4229247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19608	NC_010658	ATA	2	6	4229282	4229287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19609	NC_010658	TTGA	2	8	4229288	4229295	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
19610	NC_010658	ACG	2	6	4229309	4229314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19611	NC_010658	ATT	2	6	4229338	4229343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19612	NC_010658	ATC	4	12	4229365	4229376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19613	NC_010658	T	6	6	4229401	4229406	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19614	NC_010658	GCC	2	6	4229412	4229417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19615	NC_010658	GCC	2	6	4229425	4229430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19616	NC_010658	A	6	6	4229502	4229507	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19617	NC_010658	AAT	2	6	4229603	4229608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19618	NC_010658	ATA	2	6	4229648	4229653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19619	NC_010658	TGACC	2	10	4229691	4229700	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
19620	NC_010658	TCA	2	6	4229714	4229719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19621	NC_010658	ATA	2	6	4230985	4230990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19622	NC_010658	CCG	2	6	4230996	4231001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19623	NC_010658	TTA	2	6	4231008	4231013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19624	NC_010658	GCC	2	6	4231984	4231989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19625	NC_010658	CAT	2	6	4232048	4232053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19626	NC_010658	GTA	2	6	4232130	4232135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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