MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shigella boydii CDC 3083-94 chromosome

Total Repeats: 21560

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19001	NC_010658	GCC	2	6	4106385	4106390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19002	NC_010658	GCA	2	6	4106398	4106403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19003	NC_010658	GCTTT	2	10	4106441	4106450	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
19004	NC_010658	TCCT	2	8	4107567	4107574	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19005	NC_010658	ACA	2	6	4107921	4107926	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19006	NC_010658	AT	3	6	4108868	4108873	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19007	NC_010658	T	7	7	4108886	4108892	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19008	NC_010658	A	7	7	4108968	4108974	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19009	NC_010658	TTGT	2	8	4108997	4109004	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
19010	NC_010658	ATT	2	6	4109022	4109027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19011	NC_010658	AG	3	6	4109045	4109050	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19012	NC_010658	TTGA	2	8	4110592	4110599	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
19013	NC_010658	A	7	7	4110625	4110631	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19014	NC_010658	ATT	2	6	4111740	4111745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19015	NC_010658	TG	3	6	4111748	4111753	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19016	NC_010658	TGTT	2	8	4114217	4114224	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
19017	NC_010658	TG	4	8	4114317	4114324	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19018	NC_010658	ATG	2	6	4114375	4114380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19019	NC_010658	TGTT	2	8	4114383	4114390	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
19020	NC_010658	CAA	2	6	4114403	4114408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19021	NC_010658	TTA	2	6	4114411	4114416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19022	NC_010658	CTAA	2	8	4114530	4114537	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
19023	NC_010658	TATT	2	8	4114548	4114555	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19024	NC_010658	T	6	6	4114584	4114589	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19025	NC_010658	A	6	6	4114922	4114927	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19026	NC_010658	TGC	2	6	4115453	4115458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19027	NC_010658	ATC	2	6	4115500	4115505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19028	NC_010658	ATG	2	6	4116499	4116504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19029	NC_010658	G	7	7	4118467	4118473	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
19030	NC_010658	TATT	2	8	4119459	4119466	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19031	NC_010658	GCG	2	6	4119494	4119499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19032	NC_010658	TGA	2	6	4120674	4120679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19033	NC_010658	CAT	2	6	4122919	4122924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19034	NC_010658	AGA	2	6	4122965	4122970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19035	NC_010658	GTG	2	6	4123063	4123068	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19036	NC_010658	A	6	6	4123345	4123350	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19037	NC_010658	T	7	7	4123365	4123371	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19038	NC_010658	TGT	2	6	4123436	4123441	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19039	NC_010658	TTAT	2	8	4123466	4123473	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19040	NC_010658	CGG	2	6	4123504	4123509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19041	NC_010658	CGG	2	6	4123610	4123615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19042	NC_010658	GCT	2	6	4123643	4123648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19043	NC_010658	TGCCC	2	10	4123682	4123691	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
19044	NC_010658	CAG	2	6	4123724	4123729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19045	NC_010658	AC	3	6	4123816	4123821	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19046	NC_010658	CGG	2	6	4123838	4123843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19047	NC_010658	GCG	3	9	4123917	4123925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19048	NC_010658	GAA	2	6	4123979	4123984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19049	NC_010658	GTG	2	6	4124035	4124040	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19050	NC_010658	GCT	2	6	4124041	4124046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19051	NC_010658	TGC	2	6	4124082	4124087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19052	NC_010658	GCC	2	6	4124098	4124103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19053	NC_010658	TGG	2	6	4124124	4124129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19054	NC_010658	CA	3	6	4124143	4124148	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19055	NC_010658	GCC	2	6	4124165	4124170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19056	NC_010658	GCG	2	6	4124181	4124186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19057	NC_010658	AGA	2	6	4124257	4124262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19058	NC_010658	GCA	2	6	4124269	4124274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19059	NC_010658	CGG	2	6	4124284	4124289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19060	NC_010658	GTCT	2	8	4124358	4124365	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
19061	NC_010658	GCCGC	2	10	4124411	4124420	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
19062	NC_010658	CGC	2	6	4124439	4124444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19063	NC_010658	GCG	2	6	4124445	4124450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19064	NC_010658	GGC	2	6	4124455	4124460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19065	NC_010658	GCA	2	6	4124472	4124477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19066	NC_010658	GAT	2	6	4124504	4124509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19067	NC_010658	TGG	2	6	4124526	4124531	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19068	NC_010658	GCCG	2	8	4124547	4124554	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19069	NC_010658	CCGTTA	2	12	4124560	4124571	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
19070	NC_010658	CGGG	2	8	4124581	4124588	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
19071	NC_010658	CATCAC	2	12	4124647	4124658	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
19072	NC_010658	CCG	2	6	4124671	4124676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19073	NC_010658	TGC	2	6	4124682	4124687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19074	NC_010658	GTG	2	6	4124717	4124722	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19075	NC_010658	GCA	2	6	4124755	4124760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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19077	NC_010658	GGCT	2	8	4124852	4124859	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
19078	NC_010658	AC	3	6	4124880	4124885	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19079	NC_010658	TGG	2	6	4124889	4124894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19080	NC_010658	CAG	2	6	4125058	4125063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19081	NC_010658	TACAGC	2	12	4125083	4125094	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
19082	NC_010658	ACC	2	6	4125095	4125100	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19083	NC_010658	CAC	2	6	4125121	4125126	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19084	NC_010658	GAT	2	6	4125332	4125337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19085	NC_010658	CACC	2	8	4125343	4125350	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
19086	NC_010658	GGC	2	6	4125471	4125476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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19089	NC_010658	CGG	2	6	4125697	4125702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19090	NC_010658	GTG	2	6	4125719	4125724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19091	NC_010658	CCG	2	6	4125728	4125733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19092	NC_010658	GTGA	2	8	4125785	4125792	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
19093	NC_010658	GCC	2	6	4125798	4125803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19094	NC_010658	GCTG	2	8	4125804	4125811	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
19095	NC_010658	CTG	2	6	4125980	4125985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19096	NC_010658	CAT	2	6	4126001	4126006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19097	NC_010658	GCA	2	6	4126009	4126014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19098	NC_010658	GCA	2	6	4126033	4126038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19099	NC_010658	ATG	2	6	4126041	4126046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19100	NC_010658	TAT	2	6	4126079	4126084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19101	NC_010658	AT	3	6	4126102	4126107	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19102	NC_010658	G	6	6	4126132	4126137	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
19103	NC_010658	A	6	6	4126210	4126215	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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19105	NC_010658	AATA	2	8	4126274	4126281	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19106	NC_010658	TGG	2	6	4126285	4126290	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19107	NC_010658	AAG	2	6	4126301	4126306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19108	NC_010658	ATGATA	2	12	4126344	4126355	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19109	NC_010658	AG	4	8	4126393	4126400	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19110	NC_010658	ATG	2	6	4126464	4126469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19111	NC_010658	GAATG	2	10	4126519	4126528	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
19112	NC_010658	A	7	7	4126531	4126537	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19113	NC_010658	AGT	2	6	4126544	4126549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19114	NC_010658	ATA	2	6	4126566	4126571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19115	NC_010658	TGT	2	6	4126656	4126661	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19116	NC_010658	ATA	2	6	4126714	4126719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19117	NC_010658	TG	3	6	4126755	4126760	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19118	NC_010658	AT	3	6	4126794	4126799	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19119	NC_010658	TAAT	2	8	4126810	4126817	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19120	NC_010658	A	7	7	4126826	4126832	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19121	NC_010658	T	8	8	4126837	4126844	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19122	NC_010658	ATG	2	6	4126910	4126915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19123	NC_010658	ATATA	2	10	4126920	4126929	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
19124	NC_010658	A	6	6	4126941	4126946	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19125	NC_010658	ATC	2	6	4126992	4126997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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19127	NC_010658	TGA	2	6	4127020	4127025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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