MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shigella boydii CDC 3083-94 chromosome

Total Repeats: 21560

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18501	NC_010658	A	9	9	4009815	4009823	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18502	NC_010658	GCT	2	6	4012684	4012689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18503	NC_010658	CGG	2	6	4012702	4012707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18504	NC_010658	CAC	2	6	4012748	4012753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18505	NC_010658	CT	3	6	4012773	4012778	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18506	NC_010658	CG	3	6	4012812	4012817	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18507	NC_010658	CAA	2	6	4012832	4012837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18508	NC_010658	GAA	2	6	4012885	4012890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18509	NC_010658	GCC	2	6	4012894	4012899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18510	NC_010658	GCC	2	6	4012980	4012985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18511	NC_010658	AAT	2	6	4013038	4013043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18512	NC_010658	CTG	2	6	4013240	4013245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18513	NC_010658	GCA	2	6	4013284	4013289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18514	NC_010658	GGCT	2	8	4013340	4013347	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
18515	NC_010658	GTT	2	6	4013377	4013382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18516	NC_010658	CGC	2	6	4013432	4013437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18517	NC_010658	AAT	2	6	4013526	4013531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18518	NC_010658	ACTT	2	8	4013647	4013654	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
18519	NC_010658	GCC	2	6	4013683	4013688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18520	NC_010658	GAA	2	6	4013731	4013736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18521	NC_010658	TTG	2	6	4016102	4016107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18522	NC_010658	TGG	2	6	4016545	4016550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18523	NC_010658	TCT	2	6	4016584	4016589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18524	NC_010658	CCAA	2	8	4016655	4016662	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18525	NC_010658	T	6	6	4017166	4017171	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18526	NC_010658	AAT	2	6	4017252	4017257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18527	NC_010658	CAC	2	6	4017369	4017374	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18528	NC_010658	AGG	2	6	4017392	4017397	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18529	NC_010658	CAT	2	6	4017442	4017447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18530	NC_010658	GCA	2	6	4017467	4017472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18531	NC_010658	G	6	6	4017501	4017506	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
18532	NC_010658	ATC	2	6	4017540	4017545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18533	NC_010658	CAA	2	6	4017589	4017594	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18534	NC_010658	GTC	2	6	4017630	4017635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18535	NC_010658	ACC	2	6	4017650	4017655	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18536	NC_010658	CTC	2	6	4017691	4017696	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18537	NC_010658	CAG	2	6	4017817	4017822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18538	NC_010658	C	6	6	4017831	4017836	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
18539	NC_010658	CTG	2	6	4017844	4017849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18540	NC_010658	GCC	2	6	4017884	4017889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18541	NC_010658	AGC	2	6	4017890	4017895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18542	NC_010658	TA	3	6	4018039	4018044	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18543	NC_010658	CAG	2	6	4018260	4018265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18544	NC_010658	AGC	2	6	4018316	4018321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18545	NC_010658	AGGA	2	8	4018354	4018361	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18546	NC_010658	CTG	2	6	4018369	4018374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18547	NC_010658	GCC	2	6	4018377	4018382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18548	NC_010658	GTT	2	6	4018392	4018397	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18549	NC_010658	TGC	2	6	4018412	4018417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18550	NC_010658	CTC	2	6	4018479	4018484	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18551	NC_010658	AAG	2	6	4018486	4018491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18552	NC_010658	A	6	6	4018511	4018516	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18553	NC_010658	GC	3	6	4019437	4019442	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18554	NC_010658	TGT	2	6	4019455	4019460	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18555	NC_010658	AAC	2	6	4019514	4019519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18556	NC_010658	TAA	2	6	4019542	4019547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18557	NC_010658	AG	3	6	4019608	4019613	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18558	NC_010658	AG	3	6	4019684	4019689	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18559	NC_010658	TTG	2	6	4019701	4019706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18560	NC_010658	ATA	2	6	4019729	4019734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18561	NC_010658	A	6	6	4019747	4019752	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18562	NC_010658	TTG	2	6	4019788	4019793	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18563	NC_010658	T	8	8	4019794	4019801	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18564	NC_010658	TTTA	2	8	4019805	4019812	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18565	NC_010658	TGA	2	6	4019823	4019828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18566	NC_010658	GAT	2	6	4019887	4019892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18567	NC_010658	TAAT	2	8	4019896	4019903	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18568	NC_010658	ATA	2	6	4019916	4019921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18569	NC_010658	TGTT	2	8	4019927	4019934	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
18570	NC_010658	TATGAC	2	12	4019991	4020002	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18571	NC_010658	CAAT	2	8	4020044	4020051	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18572	NC_010658	ATT	2	6	4020060	4020065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18573	NC_010658	T	6	6	4020064	4020069	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18574	NC_010658	GCA	2	6	4020084	4020089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18575	NC_010658	TCAC	2	8	4020102	4020109	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
18576	NC_010658	CAA	2	6	4021004	4021009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18577	NC_010658	TGG	2	6	4021087	4021092	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18578	NC_010658	TGA	2	6	4021123	4021128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18579	NC_010658	A	6	6	4021137	4021142	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18580	NC_010658	CTT	2	6	4021173	4021178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18581	NC_010658	GAG	2	6	4021198	4021203	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18582	NC_010658	TTCTC	2	10	4021972	4021981	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
18583	NC_010658	GTT	2	6	4022091	4022096	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18584	NC_010658	AGG	2	6	4022102	4022107	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18585	NC_010658	T	6	6	4023611	4023616	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18586	NC_010658	T	6	6	4026646	4026651	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18587	NC_010658	ATC	3	9	4026698	4026706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18588	NC_010658	GTTT	2	8	4031267	4031274	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
18589	NC_010658	A	7	7	4032014	4032020	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18590	NC_010658	GAA	2	6	4032039	4032044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18591	NC_010658	CGC	2	6	4032181	4032186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18592	NC_010658	GT	3	6	4035613	4035618	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18593	NC_010658	A	7	7	4035731	4035737	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18594	NC_010658	A	6	6	4039756	4039761	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18595	NC_010658	CCA	2	6	4039825	4039830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18596	NC_010658	CGC	2	6	4039854	4039859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18597	NC_010658	A	7	7	4039902	4039908	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18598	NC_010658	TAT	2	6	4039934	4039939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18599	NC_010658	AAGCG	2	10	4039963	4039972	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
18600	NC_010658	TG	3	6	4040004	4040009	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18601	NC_010658	GGC	2	6	4040158	4040163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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18603	NC_010658	TGC	2	6	4040205	4040210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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18605	NC_010658	TTG	2	6	4040368	4040373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18606	NC_010658	CGA	2	6	4040396	4040401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18607	NC_010658	GCA	2	6	4040470	4040475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18608	NC_010658	GAA	2	6	4040529	4040534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18609	NC_010658	GGA	2	6	4040565	4040570	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18610	NC_010658	AGA	2	6	4040612	4040617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18611	NC_010658	CAG	2	6	4040638	4040643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18612	NC_010658	G	6	6	4040785	4040790	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
18613	NC_010658	GGA	2	6	4040829	4040834	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18614	NC_010658	GGC	2	6	4040849	4040854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18615	NC_010658	GAA	2	6	4041092	4041097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18616	NC_010658	TGC	2	6	4041168	4041173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18617	NC_010658	GTC	2	6	4041180	4041185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18618	NC_010658	TTG	2	6	4041241	4041246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18619	NC_010658	CCGG	2	8	4041255	4041262	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18620	NC_010658	GGA	2	6	4041293	4041298	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18621	NC_010658	TCA	2	6	4041318	4041323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18622	NC_010658	AC	3	6	4041344	4041349	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18623	NC_010658	CGT	2	6	4041412	4041417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18624	NC_010658	AC	3	6	4041513	4041518	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18625	NC_010658	GTAG	2	8	4041554	4041561	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
18626	NC_010658	CCT	2	6	4041654	4041659	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18627	NC_010658	AAG	2	6	4041667	4041672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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18629	NC_010658	TGA	2	6	4041702	4041707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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