MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shigella boydii CDC 3083-94 chromosome

Total Repeats: 21560

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18001	NC_010658	TCGGT	2	10	3884476	3884485	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
18002	NC_010658	GTAC	2	8	3884688	3884695	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18003	NC_010658	GTCA	2	8	3884771	3884778	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18004	NC_010658	GGA	2	6	3884794	3884799	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18005	NC_010658	C	6	6	3884804	3884809	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
18006	NC_010658	AC	5	10	3884923	3884932	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18007	NC_010658	GCT	2	6	3884948	3884953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18008	NC_010658	TCGC	2	8	3884960	3884967	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18009	NC_010658	TCA	2	6	3885242	3885247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18010	NC_010658	GA	3	6	3885265	3885270	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18011	NC_010658	AAC	2	6	3885277	3885282	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18012	NC_010658	GTT	2	6	3885287	3885292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18013	NC_010658	TCAC	2	8	3885389	3885396	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
18014	NC_010658	CCG	2	6	3885440	3885445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18015	NC_010658	TG	3	6	3885536	3885541	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18016	NC_010658	CTT	2	6	3885558	3885563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18017	NC_010658	TAAGG	2	10	3885564	3885573	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
18018	NC_010658	CTAC	2	8	3885669	3885676	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
18019	NC_010658	GT	3	6	3885712	3885717	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18020	NC_010658	ACG	2	6	3885813	3885818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18021	NC_010658	GT	3	6	3885881	3885886	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18022	NC_010658	ATG	2	6	3885906	3885911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18023	NC_010658	TCC	2	6	3885932	3885937	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18024	NC_010658	CCGG	2	8	3885968	3885975	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18025	NC_010658	CAA	2	6	3885984	3885989	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18026	NC_010658	GAC	2	6	3886045	3886050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18027	NC_010658	GCA	2	6	3886057	3886062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18028	NC_010658	TTC	2	6	3886133	3886138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18029	NC_010658	GCC	2	6	3886376	3886381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18030	NC_010658	TCC	2	6	3886396	3886401	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18031	NC_010658	C	6	6	3886440	3886445	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
18032	NC_010658	TGCG	2	8	3886528	3886535	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
18033	NC_010658	GCT	2	6	3886586	3886591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18034	NC_010658	CTT	2	6	3886611	3886616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18035	NC_010658	TCC	2	6	3886660	3886665	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18036	NC_010658	CTT	2	6	3886695	3886700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18037	NC_010658	CTG	2	6	3886754	3886759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18038	NC_010658	TCG	2	6	3886829	3886834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18039	NC_010658	CAA	2	6	3886857	3886862	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18040	NC_010658	AGT	2	6	3886954	3886959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18041	NC_010658	AGC	2	6	3887020	3887025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18042	NC_010658	GCT	2	6	3887028	3887033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18043	NC_010658	GCC	2	6	3887068	3887073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18044	NC_010658	CA	3	6	3887222	3887227	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18045	NC_010658	CGTTT	2	10	3887259	3887268	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
18046	NC_010658	T	6	6	3887266	3887271	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18047	NC_010658	GCG	2	6	3887276	3887281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18048	NC_010658	ATA	2	6	3887292	3887297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18049	NC_010658	T	8	8	3887323	3887330	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18050	NC_010658	CGT	2	6	3887374	3887379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18051	NC_010658	GTT	2	6	3887387	3887392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18052	NC_010658	GTG	2	6	3887401	3887406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18053	NC_010658	AAT	2	6	3887451	3887456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18054	NC_010658	TGG	2	6	3887546	3887551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18055	NC_010658	AGG	2	6	3887559	3887564	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18056	NC_010658	AAAAAG	2	12	3887568	3887579	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18057	NC_010658	ACT	2	6	3891749	3891754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18058	NC_010658	AAC	2	6	3891759	3891764	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18059	NC_010658	GCT	2	6	3891874	3891879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18060	NC_010658	CAT	2	6	3891887	3891892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18061	NC_010658	CGA	2	6	3891929	3891934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18062	NC_010658	GC	3	6	3891967	3891972	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18063	NC_010658	GC	3	6	3891974	3891979	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18064	NC_010658	TCA	2	6	3891991	3891996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18065	NC_010658	CTG	2	6	3892079	3892084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18066	NC_010658	AGC	2	6	3892109	3892114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18067	NC_010658	CTG	2	6	3892121	3892126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18068	NC_010658	TTC	2	6	3892206	3892211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18069	NC_010658	CAC	2	6	3892268	3892273	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18070	NC_010658	GTCG	2	8	3892361	3892368	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
18071	NC_010658	CAG	2	6	3892376	3892381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18072	NC_010658	GTT	2	6	3892436	3892441	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18073	NC_010658	CAC	2	6	3892454	3892459	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18074	NC_010658	GC	3	6	3892492	3892497	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18075	NC_010658	GTT	2	6	3892523	3892528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18076	NC_010658	ACC	2	6	3892539	3892544	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18077	NC_010658	T	6	6	3892622	3892627	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18078	NC_010658	TTA	2	6	3892658	3892663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18079	NC_010658	TGT	2	6	3892672	3892677	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18080	NC_010658	CAC	2	6	3892700	3892705	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18081	NC_010658	ATC	2	6	3892716	3892721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18082	NC_010658	AGG	2	6	3892729	3892734	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18083	NC_010658	ATT	2	6	3892757	3892762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18084	NC_010658	CAA	2	6	3892798	3892803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18085	NC_010658	CCGC	2	8	3892815	3892822	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
18086	NC_010658	ACC	2	6	3892842	3892847	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18087	NC_010658	GCA	2	6	3892848	3892853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18088	NC_010658	CCG	2	6	3892879	3892884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18089	NC_010658	GGA	2	6	3892895	3892900	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18090	NC_010658	GA	3	6	3892899	3892904	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18091	NC_010658	CAG	2	6	3892937	3892942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18092	NC_010658	GAT	2	6	3892961	3892966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18093	NC_010658	GCC	2	6	3893004	3893009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18094	NC_010658	GCA	2	6	3893045	3893050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18095	NC_010658	GAC	2	6	3893111	3893116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18096	NC_010658	CGC	2	6	3893198	3893203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18097	NC_010658	CAT	2	6	3893214	3893219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18098	NC_010658	AGC	3	9	3893304	3893312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18099	NC_010658	CCA	2	6	3893318	3893323	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18100	NC_010658	CGA	2	6	3893342	3893347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18101	NC_010658	GCA	2	6	3893353	3893358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18102	NC_010658	CAG	2	6	3893535	3893540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18103	NC_010658	T	7	7	3893615	3893621	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18104	NC_010658	CATG	2	8	3893718	3893725	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18105	NC_010658	GAT	2	6	3893728	3893733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18106	NC_010658	GAT	2	6	3893768	3893773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18107	NC_010658	ATG	2	6	3893780	3893785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18108	NC_010658	T	6	6	3893830	3893835	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18109	NC_010658	TCA	2	6	3893864	3893869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18110	NC_010658	TCAC	2	8	3893960	3893967	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
18111	NC_010658	GCC	2	6	3893998	3894003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18112	NC_010658	AGCGC	2	10	3894018	3894027	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
18113	NC_010658	TCA	2	6	3894204	3894209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18114	NC_010658	GTAAA	2	10	3894264	3894273	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
18115	NC_010658	CAT	2	6	3894379	3894384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18116	NC_010658	TTTC	2	8	3894480	3894487	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
18117	NC_010658	TCGG	2	8	3894581	3894588	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
18118	NC_010658	ATG	2	6	3894599	3894604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18119	NC_010658	CCA	2	6	3894672	3894677	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18120	NC_010658	AATCCC	2	12	3894841	3894852	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
18121	NC_010658	TTTC	2	8	3894888	3894895	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
18122	NC_010658	TCA	2	6	3894948	3894953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18123	NC_010658	TGG	2	6	3894954	3894959	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18124	NC_010658	CCA	2	6	3894981	3894986	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18125	NC_010658	CTGA	2	8	3895562	3895569	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18126	NC_010658	AGG	2	6	3895668	3895673	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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