MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shigella boydii CDC 3083-94 chromosome

Total Repeats: 21560

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_010658	TGA	2	6	3395849	3395854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16002	NC_010658	GGA	2	6	3395856	3395861	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16003	NC_010658	AAG	2	6	3395876	3395881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16004	NC_010658	TGG	2	6	3395918	3395923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16005	NC_010658	TATT	2	8	3395948	3395955	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16006	NC_010658	TTC	2	6	3395965	3395970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16007	NC_010658	TGG	2	6	3396041	3396046	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16008	NC_010658	GCT	2	6	3396078	3396083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16009	NC_010658	CTG	2	6	3396095	3396100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16010	NC_010658	TTC	2	6	3396124	3396129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16011	NC_010658	ACC	2	6	3396142	3396147	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16012	NC_010658	TTG	2	6	3396233	3396238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16013	NC_010658	TGG	2	6	3396245	3396250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16014	NC_010658	TGT	2	6	3396251	3396256	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16015	NC_010658	CTTC	2	8	3396265	3396272	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16016	NC_010658	GAA	2	6	3396380	3396385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16017	NC_010658	TGA	2	6	3396500	3396505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16018	NC_010658	CATTC	2	10	3396572	3396581	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
16019	NC_010658	GCCA	2	8	3396587	3396594	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16020	NC_010658	TTG	2	6	3396595	3396600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16021	NC_010658	GGCTG	2	10	3396644	3396653	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
16022	NC_010658	GGC	2	6	3396698	3396703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16023	NC_010658	GCGT	2	8	3396727	3396734	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
16024	NC_010658	ATCA	2	8	3396819	3396826	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16025	NC_010658	TGGG	2	8	3396844	3396851	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
16026	NC_010658	TGC	2	6	3396925	3396930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16027	NC_010658	AGA	2	6	3396932	3396937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16028	NC_010658	GTT	2	6	3397230	3397235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16029	NC_010658	TGC	2	6	3397247	3397252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16030	NC_010658	TGC	2	6	3397318	3397323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16031	NC_010658	GGC	2	6	3397325	3397330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16032	NC_010658	A	7	7	3397345	3397351	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16033	NC_010658	TGG	2	6	3397366	3397371	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16034	NC_010658	TTG	2	6	3397417	3397422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16035	NC_010658	GTT	2	6	3397461	3397466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16036	NC_010658	TGCGTC	2	12	3397492	3397503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16037	NC_010658	TGA	2	6	3397510	3397515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16038	NC_010658	CT	3	6	3397517	3397522	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16039	NC_010658	GCTA	2	8	3397547	3397554	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16040	NC_010658	GCAG	2	8	3397566	3397573	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16041	NC_010658	GC	3	6	3397576	3397581	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16042	NC_010658	TCT	2	6	3397639	3397644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16043	NC_010658	CCG	2	6	3397670	3397675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16044	NC_010658	TAT	2	6	3397724	3397729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16045	NC_010658	TAA	2	6	3397752	3397757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16046	NC_010658	TTC	2	6	3397762	3397767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16047	NC_010658	CACT	2	8	3397768	3397775	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
16048	NC_010658	ATT	2	6	3397837	3397842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16049	NC_010658	TAA	2	6	3397892	3397897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16050	NC_010658	TTA	2	6	3397908	3397913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16051	NC_010658	AGCGTT	2	12	3397914	3397925	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
16052	NC_010658	TAT	2	6	3398446	3398451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16053	NC_010658	ACT	2	6	3398504	3398509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16054	NC_010658	CGG	2	6	3399649	3399654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16055	NC_010658	CT	3	6	3399657	3399662	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16056	NC_010658	CGC	2	6	3399698	3399703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16057	NC_010658	GTT	2	6	3399773	3399778	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16058	NC_010658	TGT	2	6	3399781	3399786	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16059	NC_010658	TTG	2	6	3399792	3399797	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16060	NC_010658	CAG	2	6	3399911	3399916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16061	NC_010658	CTT	2	6	3400006	3400011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16062	NC_010658	GCT	2	6	3400042	3400047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16063	NC_010658	GCT	2	6	3400096	3400101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16064	NC_010658	TCT	3	9	3400107	3400115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16065	NC_010658	TGT	2	6	3400254	3400259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16066	NC_010658	TAA	2	6	3400296	3400301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16067	NC_010658	CGC	2	6	3400347	3400352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16068	NC_010658	ATC	2	6	3400360	3400365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16069	NC_010658	GCA	2	6	3400399	3400404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16070	NC_010658	CGG	2	6	3400446	3400451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16071	NC_010658	TACGC	2	10	3400589	3400598	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
16072	NC_010658	ATT	2	6	3400605	3400610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16073	NC_010658	ATT	2	6	3400629	3400634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16074	NC_010658	CCG	2	6	3400635	3400640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16075	NC_010658	CCAG	2	8	3400645	3400652	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16076	NC_010658	CTC	2	6	3400673	3400678	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16077	NC_010658	GCC	2	6	3400683	3400688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16078	NC_010658	GCT	2	6	3400811	3400816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16079	NC_010658	CCG	2	6	3400832	3400837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16080	NC_010658	TTGAT	2	10	3402792	3402801	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
16081	NC_010658	GGCG	2	8	3402816	3402823	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
16082	NC_010658	CGG	2	6	3402875	3402880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16083	NC_010658	GA	3	6	3402894	3402899	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16084	NC_010658	ACAA	2	8	3402910	3402917	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
16085	NC_010658	ACC	2	6	3403063	3403068	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16086	NC_010658	GCC	2	6	3403077	3403082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16087	NC_010658	GTG	2	6	3403124	3403129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16088	NC_010658	ACC	2	6	3403308	3403313	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16089	NC_010658	GCC	2	6	3403322	3403327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16090	NC_010658	TCA	2	6	3403342	3403347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16091	NC_010658	TC	3	6	3403394	3403399	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16092	NC_010658	AC	3	6	3403481	3403486	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16093	NC_010658	CGT	3	9	3403499	3403507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16095	NC_010658	C	6	6	3403685	3403690	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
16096	NC_010658	ACG	2	6	3403734	3403739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16097	NC_010658	TGA	2	6	3403814	3403819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16098	NC_010658	CCG	2	6	3403842	3403847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16099	NC_010658	ACC	2	6	3403929	3403934	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16100	NC_010658	CCT	2	6	3404011	3404016	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16101	NC_010658	CTC	2	6	3404048	3404053	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16102	NC_010658	AGG	2	6	3404065	3404070	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16103	NC_010658	CCA	2	6	3404092	3404097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16104	NC_010658	GGT	2	6	3404152	3404157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16105	NC_010658	CAT	2	6	3404347	3404352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16106	NC_010658	GCC	2	6	3404422	3404427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16107	NC_010658	TAA	2	6	3404547	3404552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16108	NC_010658	CAGC	2	8	3404560	3404567	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16109	NC_010658	TC	3	6	3404676	3404681	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16110	NC_010658	ACC	2	6	3404706	3404711	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16111	NC_010658	TTG	2	6	3404778	3404783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16112	NC_010658	TCA	2	6	3404805	3404810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16113	NC_010658	C	6	6	3404904	3404909	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
16114	NC_010658	CAA	2	6	3405145	3405150	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16115	NC_010658	CTTT	2	8	3405238	3405245	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
16116	NC_010658	ATG	2	6	3405248	3405253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16117	NC_010658	GCT	2	6	3405254	3405259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16118	NC_010658	GTT	2	6	3405344	3405349	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16119	NC_010658	ACG	2	6	3405359	3405364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16120	NC_010658	GT	3	6	3405381	3405386	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16121	NC_010658	TCGGT	2	10	3405590	3405599	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
16122	NC_010658	GTAC	2	8	3405802	3405809	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16123	NC_010658	GTCA	2	8	3405885	3405892	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16124	NC_010658	GGA	2	6	3405908	3405913	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16125	NC_010658	C	6	6	3405918	3405923	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
16126	NC_010658	AC	5	10	3406037	3406046	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16127	NC_010658	GCT	2	6	3406062	3406067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16128	NC_010658	TCGC	2	8	3406074	3406081	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
16129	NC_010658	TCA	2	6	3406356	3406361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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16244	NC_010658	GCT	2	6	3444349	3444354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16247	NC_010658	CTTA	2	8	3444943	3444950	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16248	NC_010658	TAA	2	6	3445376	3445381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16249	NC_010658	CA	3	6	3445390	3445395	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16250	NC_010658	A	8	8	3447226	3447233	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16251	NC_010658	ATG	2	6	3447282	3447287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16252	NC_010658	TAA	2	6	3447348	3447353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16253	NC_010658	A	7	7	3447352	3447358	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16254	NC_010658	CCG	2	6	3447359	3447364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16255	NC_010658	GGC	2	6	3447373	3447378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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16257	NC_010658	TACA	2	8	3448284	3448291	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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16388	NC_010658	GC	3	6	3493665	3493670	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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