MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shigella boydii CDC 3083-94 chromosome

Total Repeats: 21560

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_010658	ATG	2	6	2650717	2650722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12502	NC_010658	CAGG	2	8	2650752	2650759	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12503	NC_010658	T	6	6	2650792	2650797	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12504	NC_010658	CTT	2	6	2650833	2650838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12505	NC_010658	CGG	2	6	2650912	2650917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12506	NC_010658	CTG	2	6	2650923	2650928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12507	NC_010658	GAT	2	6	2650958	2650963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12508	NC_010658	CG	3	6	2650984	2650989	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12509	NC_010658	CTG	2	6	2651082	2651087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12510	NC_010658	TGG	2	6	2651109	2651114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12511	NC_010658	GCT	2	6	2651195	2651200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12512	NC_010658	ATT	2	6	2651229	2651234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12513	NC_010658	GCT	2	6	2651282	2651287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12514	NC_010658	GCT	2	6	2651348	2651353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12515	NC_010658	GGCGCG	2	12	2651361	2651372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12516	NC_010658	ATT	2	6	2651373	2651378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12517	NC_010658	A	6	6	2651404	2651409	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12518	NC_010658	GCA	2	6	2651445	2651450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12519	NC_010658	TCC	2	6	2651483	2651488	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12520	NC_010658	TGG	2	6	2651607	2651612	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12521	NC_010658	AC	3	6	2651674	2651679	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12522	NC_010658	GAT	2	6	2651709	2651714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12523	NC_010658	TGGC	2	8	2651770	2651777	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12524	NC_010658	TAC	2	6	2651900	2651905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12525	NC_010658	TGC	2	6	2651918	2651923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12526	NC_010658	CGCGC	2	10	2651951	2651960	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
12527	NC_010658	TCG	2	6	2651967	2651972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12528	NC_010658	TCT	2	6	2652059	2652064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12529	NC_010658	ACA	2	6	2652084	2652089	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12530	NC_010658	TAAA	2	8	2652110	2652117	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12531	NC_010658	GCG	2	6	2652236	2652241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12532	NC_010658	TGC	2	6	2652284	2652289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12533	NC_010658	GAC	2	6	2653298	2653303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12534	NC_010658	TGC	2	6	2653309	2653314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12535	NC_010658	TCGTT	2	10	2653333	2653342	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
12536	NC_010658	GCC	2	6	2653359	2653364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12537	NC_010658	CGC	2	6	2653381	2653386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12538	NC_010658	TGT	2	6	2653404	2653409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12539	NC_010658	ACGTTG	2	12	2653451	2653462	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
12540	NC_010658	TGG	2	6	2653530	2653535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12541	NC_010658	TTA	2	6	2653621	2653626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12542	NC_010658	CTC	2	6	2653672	2653677	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12543	NC_010658	GCT	2	6	2653681	2653686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12544	NC_010658	GTT	3	9	2653693	2653701	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12545	NC_010658	T	6	6	2653700	2653705	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12546	NC_010658	GCT	2	6	2653718	2653723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12547	NC_010658	TTA	2	6	2653740	2653745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12548	NC_010658	GCC	3	9	2653822	2653830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12549	NC_010658	GGC	2	6	2653909	2653914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12550	NC_010658	CGC	2	6	2654013	2654018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12551	NC_010658	GGC	2	6	2654035	2654040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12552	NC_010658	GCA	2	6	2654053	2654058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12553	NC_010658	TTG	2	6	2654142	2654147	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12554	NC_010658	GCC	2	6	2654228	2654233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12555	NC_010658	CTT	2	6	2654243	2654248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12556	NC_010658	GCC	2	6	2654268	2654273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12557	NC_010658	CTG	2	6	2654304	2654309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12558	NC_010658	CTG	2	6	2654322	2654327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12559	NC_010658	CGAG	2	8	2654395	2654402	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12560	NC_010658	CGC	2	6	2654489	2654494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12561	NC_010658	GAT	2	6	2654514	2654519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12562	NC_010658	TAA	2	6	2660160	2660165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12563	NC_010658	TTA	2	6	2660283	2660288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12564	NC_010658	GCC	3	9	2660306	2660314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12565	NC_010658	ATG	3	9	2660377	2660385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12566	NC_010658	CAA	2	6	2660401	2660406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12567	NC_010658	ATT	2	6	2660431	2660436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12568	NC_010658	AGT	2	6	2660460	2660465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12569	NC_010658	CTGG	2	8	2660537	2660544	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12570	NC_010658	ATG	2	6	2660581	2660586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12571	NC_010658	AAC	2	6	2660590	2660595	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12572	NC_010658	ATC	3	9	2660629	2660637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12573	NC_010658	CGA	2	6	2660684	2660689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12574	NC_010658	CAT	2	6	2660718	2660723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12575	NC_010658	T	6	6	2660723	2660728	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12576	NC_010658	TCAG	2	8	2660739	2660746	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12577	NC_010658	ATC	2	6	2660761	2660766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12578	NC_010658	TTA	2	6	2660937	2660942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12579	NC_010658	TTG	2	6	2661018	2661023	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12580	NC_010658	CT	3	6	2661043	2661048	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12581	NC_010658	CTA	2	6	2661069	2661074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12582	NC_010658	ATCGC	2	10	2661088	2661097	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
12583	NC_010658	GCA	2	6	2661155	2661160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12584	NC_010658	AGC	2	6	2661181	2661186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12585	NC_010658	TATC	2	8	2661215	2661222	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12586	NC_010658	CAG	2	6	2661249	2661254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12587	NC_010658	AACCGG	2	12	2661302	2661313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12588	NC_010658	ACGCG	2	10	2661351	2661360	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
12589	NC_010658	TCT	2	6	2661404	2661409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12590	NC_010658	GGC	2	6	2661492	2661497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12591	NC_010658	GTT	2	6	2661500	2661505	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12592	NC_010658	CTG	2	6	2661549	2661554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12593	NC_010658	CGG	2	6	2661587	2661592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12594	NC_010658	GCC	2	6	2661627	2661632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12595	NC_010658	GCC	2	6	2661719	2661724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12596	NC_010658	A	6	6	2661775	2661780	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12597	NC_010658	GC	3	6	2661783	2661788	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12598	NC_010658	CCGA	2	8	2661816	2661823	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12599	NC_010658	GAGC	2	8	2661888	2661895	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12600	NC_010658	CTG	2	6	2661900	2661905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12601	NC_010658	TGC	2	6	2662006	2662011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12602	NC_010658	CGA	2	6	2662015	2662020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12603	NC_010658	GAA	3	9	2662035	2662043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12604	NC_010658	TTG	2	6	2662084	2662089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12605	NC_010658	GCG	2	6	2662104	2662109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12606	NC_010658	CAC	2	6	2662130	2662135	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12607	NC_010658	GCT	2	6	2662136	2662141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12608	NC_010658	AGCC	2	8	2662923	2662930	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12609	NC_010658	GTC	2	6	2662956	2662961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12610	NC_010658	G	6	6	2662970	2662975	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
12611	NC_010658	TGG	2	6	2662991	2662996	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12612	NC_010658	GTCAG	2	10	2663020	2663029	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
12613	NC_010658	TCG	2	6	2664530	2664535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12614	NC_010658	A	6	6	2665667	2665672	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12615	NC_010658	GGC	2	6	2665748	2665753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12616	NC_010658	GAA	2	6	2667295	2667300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12617	NC_010658	CGC	2	6	2667773	2667778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12618	NC_010658	ATG	2	6	2668555	2668560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12619	NC_010658	GCA	2	6	2668571	2668576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12620	NC_010658	CGGT	2	8	2668585	2668592	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12621	NC_010658	TAT	2	6	2669888	2669893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12622	NC_010658	TAT	2	6	2669900	2669905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12623	NC_010658	A	8	8	2669926	2669933	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12624	NC_010658	ATT	2	6	2669957	2669962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12625	NC_010658	A	7	7	2670625	2670631	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12626	NC_010658	CCT	2	6	2670645	2670650	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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