MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shigella boydii CDC 3083-94 chromosome

Total Repeats: 21560

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_010658	TAT	2	6	2410880	2410885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11502	NC_010658	TCGC	2	8	2410909	2410916	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11503	NC_010658	ACC	2	6	2410921	2410926	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11504	NC_010658	CGC	2	6	2410949	2410954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11505	NC_010658	GCT	2	6	2411016	2411021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11506	NC_010658	CAT	2	6	2411039	2411044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11507	NC_010658	ATG	2	6	2411048	2411053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11508	NC_010658	CCG	2	6	2411095	2411100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11509	NC_010658	GCG	2	6	2411134	2411139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11510	NC_010658	GCACC	2	10	2411168	2411177	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
11511	NC_010658	ATC	2	6	2411178	2411183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11512	NC_010658	CCA	2	6	2411314	2411319	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11513	NC_010658	TTG	2	6	2411373	2411378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11514	NC_010658	TCA	2	6	2411486	2411491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11515	NC_010658	TGC	2	6	2411498	2411503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11516	NC_010658	CGC	2	6	2411721	2411726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11517	NC_010658	CTG	2	6	2411750	2411755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11518	NC_010658	TGT	2	6	2411759	2411764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11519	NC_010658	CGC	2	6	2411780	2411785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11520	NC_010658	TCA	2	6	2411803	2411808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11521	NC_010658	TA	3	6	2411849	2411854	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11522	NC_010658	T	6	6	2413594	2413599	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11523	NC_010658	CTT	2	6	2413619	2413624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11524	NC_010658	GAG	2	6	2413626	2413631	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11525	NC_010658	GGC	2	6	2413689	2413694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11526	NC_010658	AAC	2	6	2413713	2413718	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11527	NC_010658	CGG	2	6	2413727	2413732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11528	NC_010658	CAG	2	6	2413736	2413741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11529	NC_010658	CTTC	2	8	2413747	2413754	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11530	NC_010658	CTGG	2	8	2413782	2413789	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11531	NC_010658	CTG	2	6	2413845	2413850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11532	NC_010658	TG	3	6	2413870	2413875	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11533	NC_010658	ATCA	2	8	2413908	2413915	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11534	NC_010658	CAT	2	6	2414022	2414027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11535	NC_010658	TA	3	6	2414030	2414035	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11536	NC_010658	TCTT	2	8	2414073	2414080	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11537	NC_010658	TTA	2	6	2414117	2414122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11538	NC_010658	TGA	2	6	2414125	2414130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11539	NC_010658	ATA	2	6	2414131	2414136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11540	NC_010658	TAA	2	6	2414158	2414163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11541	NC_010658	AAT	2	6	2414207	2414212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11542	NC_010658	T	7	7	2414212	2414218	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11543	NC_010658	ATA	2	6	2414219	2414224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11544	NC_010658	AAC	2	6	2414274	2414279	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11545	NC_010658	CAA	2	6	2414291	2414296	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11546	NC_010658	TA	3	6	2414312	2414317	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11547	NC_010658	TGA	2	6	2414346	2414351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11548	NC_010658	TAA	2	6	2414393	2414398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11549	NC_010658	TCCT	2	8	2414533	2414540	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11550	NC_010658	TA	4	8	2414617	2414624	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11551	NC_010658	AGC	2	6	2414633	2414638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11552	NC_010658	TAC	2	6	2414645	2414650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11553	NC_010658	GCG	2	6	2417089	2417094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11554	NC_010658	AC	3	6	2417130	2417135	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11555	NC_010658	GTA	2	6	2418585	2418590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11556	NC_010658	GCG	2	6	2418687	2418692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11557	NC_010658	AAC	2	6	2418764	2418769	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11558	NC_010658	TGA	2	6	2418893	2418898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11559	NC_010658	GAT	2	6	2419070	2419075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11560	NC_010658	TACA	2	8	2419089	2419096	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11561	NC_010658	CCA	2	6	2419185	2419190	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11562	NC_010658	TCG	2	6	2419201	2419206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11563	NC_010658	TTA	2	6	2419246	2419251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11564	NC_010658	GGT	2	6	2419267	2419272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11565	NC_010658	GCA	2	6	2419297	2419302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11566	NC_010658	CAG	2	6	2421278	2421283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11567	NC_010658	GCGA	2	8	2421378	2421385	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11568	NC_010658	CT	3	6	2421435	2421440	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11569	NC_010658	GAA	2	6	2421441	2421446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11570	NC_010658	AGC	2	6	2421453	2421458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11571	NC_010658	TTG	2	6	2421473	2421478	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11572	NC_010658	AAC	2	6	2421489	2421494	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11573	NC_010658	AGG	2	6	2421553	2421558	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11574	NC_010658	GCT	2	6	2421568	2421573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11575	NC_010658	GGA	2	6	2421585	2421590	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11576	NC_010658	ACT	2	6	2421657	2421662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11577	NC_010658	TGG	2	6	2421667	2421672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11578	NC_010658	ACT	2	6	2421774	2421779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11579	NC_010658	CCA	2	6	2421822	2421827	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11580	NC_010658	CCACTA	2	12	2421829	2421840	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
11581	NC_010658	CAG	2	6	2421851	2421856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11582	NC_010658	TTAT	2	8	2424602	2424609	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11583	NC_010658	GA	3	6	2424630	2424635	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11584	NC_010658	TAAAT	2	10	2424679	2424688	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11585	NC_010658	CA	3	6	2424700	2424705	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11586	NC_010658	TTA	2	6	2424706	2424711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11587	NC_010658	A	6	6	2424824	2424829	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11588	NC_010658	TCA	2	6	2429078	2429083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11589	NC_010658	TGC	2	6	2430181	2430186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11590	NC_010658	GCA	2	6	2430229	2430234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11591	NC_010658	CCG	2	6	2430240	2430245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11592	NC_010658	AAT	2	6	2430258	2430263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11593	NC_010658	ACG	2	6	2430305	2430310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11594	NC_010658	GC	3	6	2430462	2430467	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11595	NC_010658	GGA	2	6	2430508	2430513	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11596	NC_010658	GC	3	6	2430581	2430586	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11597	NC_010658	CGGA	2	8	2430630	2430637	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11598	NC_010658	TGGC	2	8	2430646	2430653	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11599	NC_010658	AAG	2	6	2430767	2430772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11600	NC_010658	T	6	6	2431278	2431283	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11601	NC_010658	AAT	2	6	2431364	2431369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11602	NC_010658	CAC	2	6	2431481	2431486	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11603	NC_010658	AGG	2	6	2431504	2431509	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11604	NC_010658	CAT	2	6	2431554	2431559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11605	NC_010658	GCA	2	6	2431579	2431584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11606	NC_010658	CAG	2	6	2438142	2438147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11607	NC_010658	GCGA	2	8	2438242	2438249	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11608	NC_010658	CT	3	6	2438299	2438304	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11609	NC_010658	GAA	2	6	2438305	2438310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11610	NC_010658	AGC	2	6	2438317	2438322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11611	NC_010658	TTG	2	6	2438337	2438342	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11612	NC_010658	AAC	2	6	2438353	2438358	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11613	NC_010658	AGG	2	6	2438417	2438422	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11614	NC_010658	GCT	2	6	2438432	2438437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11615	NC_010658	GGA	2	6	2438449	2438454	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11616	NC_010658	AATGG	2	10	2438701	2438710	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
11617	NC_010658	ATT	2	6	2444404	2444409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11618	NC_010658	ATG	2	6	2444424	2444429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11619	NC_010658	TAC	2	6	2445775	2445780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11620	NC_010658	A	8	8	2445781	2445788	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11621	NC_010658	ACTA	2	8	2446149	2446156	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11622	NC_010658	GTT	2	6	2446166	2446171	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11623	NC_010658	T	6	6	2446678	2446683	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11624	NC_010658	TGA	2	6	2446690	2446695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11625	NC_010658	TTA	3	9	2447624	2447632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11626	NC_010658	AT	3	6	2447675	2447680	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11628	NC_010658	TTCA	2	8	2447769	2447776	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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11997	NC_010658	TGT	2	6	2550107	2550112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11998	NC_010658	TAA	2	6	2550141	2550146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11999	NC_010658	CTC	2	6	2550199	2550204	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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