MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shigella boydii CDC 3083-94 chromosome

Total Repeats: 21560

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_010658	CGAG	2	8	2313040	2313047	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11002	NC_010658	TCA	2	6	2313094	2313099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11003	NC_010658	T	6	6	2313219	2313224	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11004	NC_010658	TGT	2	6	2313263	2313268	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11005	NC_010658	TCG	2	6	2313340	2313345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11006	NC_010658	TGA	2	6	2313370	2313375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11007	NC_010658	AAC	2	6	2313378	2313383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11008	NC_010658	ATA	2	6	2313414	2313419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11009	NC_010658	TAT	2	6	2313422	2313427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11010	NC_010658	CAT	2	6	2313462	2313467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11011	NC_010658	CG	3	6	2313617	2313622	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11012	NC_010658	ATG	2	6	2313645	2313650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11013	NC_010658	A	7	7	2313651	2313657	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11014	NC_010658	TGC	2	6	2313674	2313679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11015	NC_010658	AATAAA	2	12	2313681	2313692	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11016	NC_010658	TTATCT	2	12	2313703	2313714	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11017	NC_010658	TGC	2	6	2313792	2313797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11018	NC_010658	CAG	2	6	2313832	2313837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11019	NC_010658	ACA	2	6	2313844	2313849	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11020	NC_010658	AAT	2	6	2313862	2313867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11021	NC_010658	ATA	2	6	2320307	2320312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11022	NC_010658	TCA	2	6	2322374	2322379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11023	NC_010658	CT	3	6	2323122	2323127	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11024	NC_010658	GCG	2	6	2326555	2326560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11025	NC_010658	CAT	2	6	2326581	2326586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11026	NC_010658	TTA	2	6	2326640	2326645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11027	NC_010658	CT	3	6	2327501	2327506	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11028	NC_010658	CTT	2	6	2327533	2327538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11029	NC_010658	ACATC	2	10	2327551	2327560	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
11030	NC_010658	TTAT	2	8	2327583	2327590	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11031	NC_010658	GGT	2	6	2327644	2327649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11032	NC_010658	GCG	2	6	2329006	2329011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11033	NC_010658	AT	3	6	2329050	2329055	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11034	NC_010658	TCA	2	6	2329110	2329115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11035	NC_010658	GCC	2	6	2329116	2329121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11036	NC_010658	AGA	2	6	2330804	2330809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11037	NC_010658	CTC	2	6	2330815	2330820	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11038	NC_010658	A	6	6	2330849	2330854	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11039	NC_010658	T	6	6	2331929	2331934	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11040	NC_010658	CATA	2	8	2333553	2333560	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11041	NC_010658	A	6	6	2333608	2333613	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11042	NC_010658	TA	3	6	2333633	2333638	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11043	NC_010658	TGTA	2	8	2333658	2333665	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11044	NC_010658	ATC	2	6	2333671	2333676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11045	NC_010658	AGG	2	6	2333705	2333710	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11046	NC_010658	CGC	2	6	2333857	2333862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11047	NC_010658	A	6	6	2333904	2333909	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11048	NC_010658	AGT	2	6	2333959	2333964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11049	NC_010658	CGG	2	6	2333974	2333979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11050	NC_010658	TCT	2	6	2333989	2333994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11051	NC_010658	T	6	6	2335726	2335731	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11052	NC_010658	ACC	2	6	2336264	2336269	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11053	NC_010658	AT	3	6	2336303	2336308	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11054	NC_010658	TCAT	2	8	2336451	2336458	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11055	NC_010658	ATT	2	6	2336463	2336468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11056	NC_010658	T	6	6	2336530	2336535	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11057	NC_010658	CAA	2	6	2336536	2336541	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11058	NC_010658	TA	3	6	2337571	2337576	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11059	NC_010658	ATAA	2	8	2337624	2337631	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11060	NC_010658	AT	3	6	2337647	2337652	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11061	NC_010658	GTTTT	2	10	2337675	2337684	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
11062	NC_010658	AGG	2	6	2338358	2338363	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11063	NC_010658	GTTTT	2	10	2338366	2338375	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
11064	NC_010658	CATC	2	8	2338405	2338412	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11065	NC_010658	T	6	6	2338438	2338443	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11066	NC_010658	CAT	2	6	2338451	2338456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11067	NC_010658	CA	3	6	2338457	2338462	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11068	NC_010658	T	6	6	2338481	2338486	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11069	NC_010658	AAT	2	6	2338504	2338509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11070	NC_010658	T	6	6	2338646	2338651	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11071	NC_010658	AT	3	6	2338653	2338658	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11072	NC_010658	A	6	6	2338693	2338698	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11073	NC_010658	ATTA	2	8	2339543	2339550	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11074	NC_010658	ATT	2	6	2339562	2339567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11075	NC_010658	AAC	2	6	2339585	2339590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11076	NC_010658	TTA	2	6	2341027	2341032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11077	NC_010658	CGC	2	6	2341069	2341074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11078	NC_010658	A	6	6	2341082	2341087	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11079	NC_010658	TCC	2	6	2341123	2341128	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11080	NC_010658	C	8	8	2342628	2342635	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11081	NC_010658	GGA	2	6	2342673	2342678	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11082	NC_010658	CTGC	2	8	2342708	2342715	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11083	NC_010658	A	8	8	2342812	2342819	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11084	NC_010658	CGC	2	6	2342897	2342902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11085	NC_010658	GCC	2	6	2342936	2342941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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11087	NC_010658	GCC	2	6	2342989	2342994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11088	NC_010658	CCGC	2	8	2343013	2343020	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
11089	NC_010658	A	7	7	2343196	2343202	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11092	NC_010658	ATT	2	6	2343284	2343289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11093	NC_010658	GCAG	2	8	2343321	2343328	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11094	NC_010658	CAA	2	6	2343345	2343350	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11095	NC_010658	GTTT	2	8	2343352	2343359	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11096	NC_010658	TAC	2	6	2343397	2343402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11097	NC_010658	T	6	6	2343409	2343414	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11098	NC_010658	GTC	2	6	2343475	2343480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11099	NC_010658	TCA	2	6	2343580	2343585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11100	NC_010658	A	6	6	2343633	2343638	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11101	NC_010658	GCTG	2	8	2343724	2343731	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11102	NC_010658	GTT	2	6	2343767	2343772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11103	NC_010658	ATG	2	6	2343798	2343803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11104	NC_010658	ATT	2	6	2343828	2343833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11105	NC_010658	GTTT	2	8	2343845	2343852	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11106	NC_010658	GCTG	2	8	2343868	2343875	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11107	NC_010658	TGGC	2	8	2343941	2343948	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11108	NC_010658	CGG	2	6	2343952	2343957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11109	NC_010658	T	7	7	2344102	2344108	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11110	NC_010658	CGG	2	6	2344111	2344116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11111	NC_010658	GGCT	2	8	2344153	2344160	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11112	NC_010658	GCC	2	6	2344174	2344179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11113	NC_010658	CTG	2	6	2344206	2344211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11114	NC_010658	ACCATC	2	12	2344248	2344259	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
11115	NC_010658	TGT	2	6	2344267	2344272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11116	NC_010658	CAT	2	6	2344502	2344507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11117	NC_010658	ACC	2	6	2344524	2344529	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11118	NC_010658	GAA	2	6	2344650	2344655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11119	NC_010658	ATT	2	6	2344668	2344673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11120	NC_010658	CAC	2	6	2344739	2344744	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11121	NC_010658	A	6	6	2344794	2344799	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11122	NC_010658	TGG	2	6	2344810	2344815	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11123	NC_010658	CG	3	6	2344821	2344826	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11124	NC_010658	TTA	2	6	2344838	2344843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11125	NC_010658	TGC	2	6	2344846	2344851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11126	NC_010658	CCG	2	6	2344884	2344889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11127	NC_010658	TCA	2	6	2345942	2345947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11128	NC_010658	CCA	2	6	2346369	2346374	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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11130	NC_010658	TAAA	2	8	2346449	2346456	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11388	NC_010658	GGC	2	6	2395582	2395587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11389	NC_010658	CCT	2	6	2395648	2395653	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11390	NC_010658	GC	3	6	2395659	2395664	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11391	NC_010658	CT	3	6	2395691	2395696	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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11395	NC_010658	T	7	7	2395894	2395900	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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