MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shigella boydii CDC 3083-94 chromosome

Total Repeats: 21560

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_010658	CGC	2	6	2190915	2190920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10502	NC_010658	CTGC	2	8	2190966	2190973	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10503	NC_010658	TGC	2	6	2190998	2191003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10504	NC_010658	CCG	2	6	2191047	2191052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10505	NC_010658	AT	3	6	2191100	2191105	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10506	NC_010658	CTT	2	6	2191117	2191122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10507	NC_010658	GT	3	6	2191149	2191154	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10508	NC_010658	TCA	2	6	2191179	2191184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10509	NC_010658	CAT	2	6	2191200	2191205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10510	NC_010658	GCG	2	6	2191209	2191214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10511	NC_010658	GCA	2	6	2191225	2191230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10512	NC_010658	T	7	7	2191432	2191438	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10513	NC_010658	GCT	2	6	2191468	2191473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10514	NC_010658	CCAGTT	2	12	2191476	2191487	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
10515	NC_010658	TCT	2	6	2191547	2191552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10516	NC_010658	ATTT	2	8	2191564	2191571	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10517	NC_010658	CGA	2	6	2191598	2191603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10518	NC_010658	GTT	2	6	2191680	2191685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10519	NC_010658	CAG	2	6	2191687	2191692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10520	NC_010658	ACG	2	6	2191714	2191719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10521	NC_010658	TCT	2	6	2191798	2191803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10522	NC_010658	TTC	2	6	2191812	2191817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10523	NC_010658	ACA	2	6	2191970	2191975	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10524	NC_010658	GAG	2	6	2192028	2192033	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10525	NC_010658	CAG	2	6	2192078	2192083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10526	NC_010658	TCC	2	6	2192101	2192106	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10527	NC_010658	CATCAG	2	12	2192132	2192143	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
10528	NC_010658	ATC	2	6	2192314	2192319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10529	NC_010658	AGC	2	6	2192355	2192360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10530	NC_010658	AGC	2	6	2192459	2192464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10531	NC_010658	TAA	2	6	2192504	2192509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10532	NC_010658	AGA	2	6	2192525	2192530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10533	NC_010658	GTT	2	6	2192532	2192537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10534	NC_010658	CGC	2	6	2192547	2192552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10535	NC_010658	CAG	2	6	2192594	2192599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10536	NC_010658	CGG	2	6	2192800	2192805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10537	NC_010658	T	7	7	2193163	2193169	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10538	NC_010658	GGC	2	6	2193202	2193207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10539	NC_010658	TGC	2	6	2193210	2193215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10540	NC_010658	A	6	6	2200592	2200597	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10541	NC_010658	TTG	2	6	2202335	2202340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10542	NC_010658	CTC	2	6	2202377	2202382	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10543	NC_010658	GTGAA	2	10	2202403	2202412	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
10544	NC_010658	TCC	2	6	2203343	2203348	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10545	NC_010658	A	6	6	2207394	2207399	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10546	NC_010658	TTG	2	6	2207407	2207412	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10547	NC_010658	GCA	2	6	2208472	2208477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10548	NC_010658	CAG	2	6	2210453	2210458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10549	NC_010658	GCGA	2	8	2210553	2210560	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10550	NC_010658	CT	3	6	2210610	2210615	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10551	NC_010658	GAA	2	6	2210616	2210621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10552	NC_010658	AGC	2	6	2210628	2210633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10553	NC_010658	TTG	2	6	2210648	2210653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10554	NC_010658	AAC	2	6	2210664	2210669	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10555	NC_010658	AGG	2	6	2210728	2210733	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10556	NC_010658	GCT	2	6	2210743	2210748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10557	NC_010658	GGA	2	6	2210760	2210765	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10558	NC_010658	ACT	2	6	2210832	2210837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10559	NC_010658	TGG	2	6	2210842	2210847	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10560	NC_010658	ATGA	2	8	2211053	2211060	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10561	NC_010658	AAC	2	6	2211065	2211070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10562	NC_010658	CGG	2	6	2211083	2211088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10563	NC_010658	AG	3	6	2211152	2211157	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10564	NC_010658	GA	3	6	2211171	2211176	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10565	NC_010658	GCC	2	6	2211204	2211209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10566	NC_010658	ACA	2	6	2211212	2211217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10567	NC_010658	CCACT	2	10	2211234	2211243	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
10568	NC_010658	ACTTA	2	10	2211251	2211260	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
10569	NC_010658	CCA	2	6	2211283	2211288	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10570	NC_010658	AGG	2	6	2211302	2211307	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10571	NC_010658	AGC	2	6	2211335	2211340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10572	NC_010658	CAG	2	6	2211342	2211347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10573	NC_010658	CCA	2	6	2211351	2211356	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10574	NC_010658	CAGC	2	8	2211424	2211431	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10575	NC_010658	GTT	2	6	2211582	2211587	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10576	NC_010658	GCC	2	6	2211704	2211709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10577	NC_010658	TTG	2	6	2211758	2211763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10578	NC_010658	CAA	2	6	2211892	2211897	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10579	NC_010658	TTTGC	2	10	2211943	2211952	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
10580	NC_010658	ATA	2	6	2211955	2211960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10581	NC_010658	ACGG	2	8	2211998	2212005	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10582	NC_010658	AG	3	6	2212039	2212044	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10583	NC_010658	CCCT	2	8	2212146	2212153	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
10584	NC_010658	TTG	2	6	2212175	2212180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10585	NC_010658	TGG	2	6	2212191	2212196	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10586	NC_010658	AGA	2	6	2212224	2212229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10587	NC_010658	A	6	6	2212298	2212303	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10588	NC_010658	TCC	2	6	2212636	2212641	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10589	NC_010658	GCT	2	6	2212666	2212671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10590	NC_010658	TGC	2	6	2212674	2212679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10591	NC_010658	GGC	2	6	2212690	2212695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10592	NC_010658	GCC	2	6	2212700	2212705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10593	NC_010658	CAA	2	6	2212753	2212758	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10594	NC_010658	GTT	2	6	2214518	2214523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10595	NC_010658	CG	3	6	2215297	2215302	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10596	NC_010658	TG	3	6	2215337	2215342	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10597	NC_010658	AGA	2	6	2215403	2215408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10598	NC_010658	TGC	2	6	2216151	2216156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10599	NC_010658	CAG	2	6	2216172	2216177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10600	NC_010658	TTC	2	6	2216188	2216193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10601	NC_010658	ATC	2	6	2216200	2216205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10602	NC_010658	AT	3	6	2216218	2216223	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10603	NC_010658	CAA	2	6	2216237	2216242	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10604	NC_010658	A	8	8	2216294	2216301	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10605	NC_010658	AAAG	2	8	2216328	2216335	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10606	NC_010658	TATT	2	8	2216343	2216350	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10607	NC_010658	GTT	2	6	2216355	2216360	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10608	NC_010658	AACTC	2	10	2217649	2217658	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
10609	NC_010658	ACA	2	6	2217662	2217667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10610	NC_010658	GGCT	2	8	2217685	2217692	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10611	NC_010658	CAC	2	6	2218814	2218819	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10612	NC_010658	GTTGC	2	10	2218820	2218829	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
10613	NC_010658	ATT	2	6	2218870	2218875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10614	NC_010658	AC	3	6	2218905	2218910	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10615	NC_010658	CA	3	6	2218955	2218960	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10616	NC_010658	TC	3	6	2218967	2218972	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10617	NC_010658	ATT	2	6	2218975	2218980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10618	NC_010658	GCG	2	6	2219756	2219761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10619	NC_010658	TAT	2	6	2219789	2219794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10620	NC_010658	GC	3	6	2219796	2219801	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10621	NC_010658	AT	3	6	2221668	2221673	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10622	NC_010658	TAA	2	6	2221680	2221685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10623	NC_010658	AAT	2	6	2221686	2221691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10624	NC_010658	TAA	2	6	2221727	2221732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10625	NC_010658	CGAT	2	8	2221736	2221743	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10626	NC_010658	TTAA	2	8	2221774	2221781	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10627	NC_010658	GGA	2	6	2221792	2221797	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10628	NC_010658	A	6	6	2221803	2221808	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10630	NC_010658	ATCTC	2	10	2221959	2221968	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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10637	NC_010658	T	6	6	2225268	2225273	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10638	NC_010658	CTAT	2	8	2225279	2225286	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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10749	NC_010658	ACCT	2	8	2248185	2248192	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10750	NC_010658	ATC	2	6	2250839	2250844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10752	NC_010658	GATA	2	8	2250917	2250924	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10753	NC_010658	ATC	2	6	2250928	2250933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10755	NC_010658	CAA	2	6	2254563	2254568	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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