MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shigella boydii CDC 3083-94 chromosome

Total Repeats: 21560

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_010658	TTA	2	6	1390129	1390134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6502	NC_010658	CAA	2	6	1390274	1390279	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6503	NC_010658	CAC	2	6	1390370	1390375	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6504	NC_010658	TCGG	2	8	1390390	1390397	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6505	NC_010658	AGGGTG	2	12	1390413	1390424	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6506	NC_010658	CGG	2	6	1390427	1390432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6507	NC_010658	AAT	2	6	1390447	1390452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6508	NC_010658	GCA	2	6	1390462	1390467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6509	NC_010658	CAG	2	6	1392443	1392448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6510	NC_010658	GCGA	2	8	1392543	1392550	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6511	NC_010658	CT	3	6	1392600	1392605	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6512	NC_010658	GAA	2	6	1392606	1392611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6513	NC_010658	AGC	2	6	1392618	1392623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6514	NC_010658	TTG	2	6	1392638	1392643	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6515	NC_010658	AAC	2	6	1392654	1392659	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6516	NC_010658	AGG	2	6	1392718	1392723	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6517	NC_010658	GCT	2	6	1392733	1392738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6518	NC_010658	GGA	2	6	1392750	1392755	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6519	NC_010658	ACT	2	6	1392822	1392827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6520	NC_010658	TGG	2	6	1392832	1392837	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6521	NC_010658	AGG	2	6	1393265	1393270	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6522	NC_010658	TGGT	2	8	1398659	1398666	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6523	NC_010658	CTATAA	2	12	1398718	1398729	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6524	NC_010658	AAC	2	6	1398737	1398742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6525	NC_010658	GAG	2	6	1398748	1398753	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6526	NC_010658	GCG	2	6	1398819	1398824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6527	NC_010658	GAT	2	6	1399160	1399165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6528	NC_010658	CAGG	2	8	1399224	1399231	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6529	NC_010658	TGC	2	6	1400644	1400649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6530	NC_010658	TAA	2	6	1400660	1400665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6531	NC_010658	CAGT	2	8	1400730	1400737	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6532	NC_010658	AGG	2	6	1400741	1400746	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6533	NC_010658	CCTC	2	8	1400760	1400767	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
6534	NC_010658	ATC	2	6	1400784	1400789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6535	NC_010658	CAT	2	6	1400792	1400797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6536	NC_010658	GCC	2	6	1400841	1400846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6537	NC_010658	TGA	2	6	1400918	1400923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6538	NC_010658	AAC	2	6	1400924	1400929	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6539	NC_010658	TTC	2	6	1402364	1402369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6540	NC_010658	GTTT	2	8	1402377	1402384	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6541	NC_010658	CAT	2	6	1402418	1402423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6542	NC_010658	TGCA	2	8	1402431	1402438	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6543	NC_010658	A	6	6	1402500	1402505	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6544	NC_010658	CAT	2	6	1402674	1402679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6545	NC_010658	GGC	2	6	1402687	1402692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6546	NC_010658	CGT	2	6	1402727	1402732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6547	NC_010658	AAC	2	6	1402739	1402744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6548	NC_010658	TCT	2	6	1402851	1402856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6549	NC_010658	TAAT	2	8	1402868	1402875	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6550	NC_010658	TGG	3	9	1402931	1402939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6551	NC_010658	GGT	2	6	1402945	1402950	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6552	NC_010658	G	6	6	1403060	1403065	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6553	NC_010658	GTT	2	6	1403078	1403083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6554	NC_010658	CT	3	6	1403111	1403116	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6555	NC_010658	GCTC	2	8	1403163	1403170	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6556	NC_010658	TCA	2	6	1403200	1403205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6557	NC_010658	GGC	2	6	1403995	1404000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6558	NC_010658	GGC	2	6	1404068	1404073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6559	NC_010658	TA	3	6	1404089	1404094	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6560	NC_010658	AT	3	6	1404163	1404168	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6561	NC_010658	AAT	2	6	1408279	1408284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6562	NC_010658	TGCGC	2	10	1408291	1408300	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
6563	NC_010658	TATG	2	8	1408329	1408336	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6564	NC_010658	CGC	2	6	1408353	1408358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6565	NC_010658	TGA	2	6	1409418	1409423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6566	NC_010658	TTC	2	6	1409424	1409429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6567	NC_010658	A	6	6	1409457	1409462	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6568	NC_010658	CAG	2	6	1409489	1409494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6569	NC_010658	ACA	2	6	1409523	1409528	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6570	NC_010658	GGC	2	6	1410209	1410214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6571	NC_010658	CGC	3	9	1410224	1410232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6572	NC_010658	ATGG	2	8	1411105	1411112	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6573	NC_010658	GCG	2	6	1411471	1411476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6574	NC_010658	T	8	8	1411488	1411495	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6575	NC_010658	ATT	2	6	1411524	1411529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6576	NC_010658	A	6	6	1411563	1411568	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6577	NC_010658	AGT	2	6	1411624	1411629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6578	NC_010658	ATG	2	6	1411787	1411792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6579	NC_010658	A	6	6	1412063	1412068	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6580	NC_010658	GTGAT	2	10	1412109	1412118	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
6581	NC_010658	GGA	2	6	1412195	1412200	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6582	NC_010658	TCT	2	6	1412250	1412255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6583	NC_010658	CTG	2	6	1412260	1412265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6584	NC_010658	TGGC	2	8	1412298	1412305	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6585	NC_010658	AATCTG	2	12	1412380	1412391	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6586	NC_010658	ACA	2	6	1412394	1412399	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6587	NC_010658	T	6	6	1413361	1413366	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6588	NC_010658	AAT	2	6	1413447	1413452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6589	NC_010658	CAC	2	6	1413564	1413569	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6590	NC_010658	AGG	2	6	1413587	1413592	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6591	NC_010658	CAT	2	6	1413637	1413642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6592	NC_010658	GCA	2	6	1413662	1413667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6593	NC_010658	GCG	2	6	1413688	1413693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6594	NC_010658	GC	3	6	1413734	1413739	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6595	NC_010658	CGG	2	6	1413744	1413749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6596	NC_010658	CGGG	2	8	1413771	1413778	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6597	NC_010658	CT	3	6	1413820	1413825	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6598	NC_010658	GC	3	6	1413855	1413860	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6599	NC_010658	ACC	2	6	1413892	1413897	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6600	NC_010658	AACC	2	8	1414006	1414013	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6601	NC_010658	TGTT	2	8	1414022	1414029	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6602	NC_010658	CGAT	2	8	1414073	1414080	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6603	NC_010658	G	6	6	1414291	1414296	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6604	NC_010658	AAT	2	6	1414445	1414450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6605	NC_010658	GCG	2	6	1415391	1415396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6606	NC_010658	GCATC	2	10	1415444	1415453	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
6607	NC_010658	TCCG	2	8	1416490	1416497	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6608	NC_010658	ACA	2	6	1416539	1416544	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6609	NC_010658	TGGCC	2	10	1416563	1416572	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
6610	NC_010658	T	7	7	1416598	1416604	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6611	NC_010658	AGC	2	6	1416616	1416621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6612	NC_010658	TTG	2	6	1419157	1419162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6613	NC_010658	ATC	2	6	1419196	1419201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6614	NC_010658	T	6	6	1419215	1419220	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6615	NC_010658	ACC	2	6	1421421	1421426	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6616	NC_010658	ACA	2	6	1421430	1421435	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6617	NC_010658	TTC	2	6	1423181	1423186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6618	NC_010658	T	7	7	1423214	1423220	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6619	NC_010658	GTT	2	6	1423228	1423233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6620	NC_010658	TA	3	6	1423294	1423299	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6621	NC_010658	TAA	2	6	1423364	1423369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6622	NC_010658	TAA	2	6	1423373	1423378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6623	NC_010658	AAC	2	6	1423677	1423682	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6624	NC_010658	GCA	2	6	1424058	1424063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6625	NC_010658	AAG	2	6	1424170	1424175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6626	NC_010658	CAG	2	6	1424264	1424269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6627	NC_010658	GTG	2	6	1424289	1424294	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6628	NC_010658	GTG	2	6	1424362	1424367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6630	NC_010658	TGGGC	2	10	1424448	1424457	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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