MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shigella boydii CDC 3083-94 plasmid pBS512_33

Total Repeats: 96

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010657	TGA	2	6	7	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010657	CAA	2	6	91	96	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_010657	ATA	2	6	730	735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010657	ATTA	2	8	3103	3110	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010657	CAGC	2	8	3632	3639	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_010657	CCG	2	6	4410	4415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_010657	AAC	2	6	4461	4466	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_010657	ACA	2	6	4482	4487	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_010657	ATCG	2	8	4511	4518	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_010657	ACA	2	6	4641	4646	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_010657	GCCCT	2	10	4733	4742	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
12	NC_010657	A	6	6	4780	4785	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010657	T	7	7	4796	4802	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010657	CAT	2	6	5724	5729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_010657	CAC	2	6	5768	5773	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_010657	AC	3	6	5792	5797	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_010657	TAT	2	6	6485	6490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010657	AC	3	6	6492	6497	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_010657	GAT	2	6	6505	6510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010657	GT	3	6	6529	6534	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010657	AC	3	6	6541	6546	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_010657	AC	3	6	6888	6893	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_010657	AAT	2	6	7172	7177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010657	AT	5	10	7505	7514	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010657	ACT	2	6	7519	7524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_010657	A	7	7	7526	7532	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010657	TA	3	6	7550	7555	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010657	TAT	3	9	7575	7583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010657	AGC	2	6	7618	7623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_010657	CAT	2	6	7650	7655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_010657	ATT	2	6	7658	7663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010657	CTGT	2	8	8390	8397	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_010657	ACA	2	6	9748	9753	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_010657	CAAT	2	8	9754	9761	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_010657	TCT	2	6	9780	9785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_010657	AAC	2	6	9859	9864	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_010657	AGAA	2	8	9885	9892	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010657	A	6	6	10067	10072	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010657	TGCG	2	8	10151	10158	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
40	NC_010657	GAT	2	6	10199	10204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010657	GAT	2	6	10231	10236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010657	CAT	2	6	10260	10265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_010657	ATC	2	6	10301	10306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_010657	A	7	7	10307	10313	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010657	TTAACT	2	12	10365	10376	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_010657	AAAT	2	8	10382	10389	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010657	ATA	2	6	10390	10395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010657	CTCA	2	8	10445	10452	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_010657	GCG	2	6	10478	10483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_010657	AG	3	6	10508	10513	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010657	AAG	2	6	10561	10566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010657	TTCG	2	8	10588	10595	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_010657	A	6	6	10626	10631	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010657	AC	3	6	10676	10681	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_010657	GAA	2	6	10690	10695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010657	ACT	2	6	10713	10718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_010657	ACA	2	6	10731	10736	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_010657	CAA	2	6	10745	10750	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_010657	GCT	2	6	10752	10757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_010657	A	6	6	10816	10821	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010657	GGC	2	6	10938	10943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_010657	TC	3	6	11630	11635	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_010657	CCCG	2	8	11685	11692	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
64	NC_010657	GT	3	6	11751	11756	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010657	GT	3	6	11791	11796	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010657	TGC	2	6	11899	11904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_010657	TGC	2	6	13979	13984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_010657	AAAGTG	2	12	15390	15401	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010657	AAC	2	6	15415	15420	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_010657	A	6	6	15603	15608	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010657	CGA	2	6	16031	16036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_010657	CAAT	2	8	16069	16076	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_010657	TGCCTG	2	12	16141	16152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_010657	CTG	2	6	17956	17961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_010657	CAA	2	6	17966	17971	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_010657	GAGG	2	8	17977	17984	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010657	ATG	2	6	18000	18005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010657	TCA	2	6	18025	18030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_010657	TGA	2	6	18040	18045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010657	TGAG	2	8	18054	18061	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010657	CAA	2	6	18062	18067	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_010657	ATT	2	6	18074	18079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010657	T	9	9	18534	18542	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010657	ATA	2	6	18560	18565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010657	TTG	2	6	18596	18601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010657	AC	3	6	18649	18654	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_010657	GATT	2	8	18663	18670	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010657	CGC	2	6	31531	31536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_010657	AAC	2	6	31572	31577	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_010657	AAG	2	6	31624	31629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_010657	GGC	2	6	32869	32874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_010657	AGG	2	6	32884	32889	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010657	ATTT	2	8	32905	32912	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010657	GTT	2	6	32967	32972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010657	CA	3	6	33029	33034	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_010657	TAA	2	6	33044	33049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.