MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae CGSP14 chromosome

Total Repeats: 6709

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010582	TAA	2	6	45	50	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010582	AAT	2	6	54	59	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010582	TTC	2	6	60	65	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_010582	ATT	2	6	107	112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010582	CTAT	2	8	138	145	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_010582	AGG	2	6	183	188	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010582	T	6	6	1577	1582	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010582	T	6	6	1586	1591	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010582	T	6	6	1599	1604	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010582	A	6	6	1614	1619	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010582	TAT	2	6	1668	1673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010582	TAT	2	6	1677	1682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010582	ATAA	2	8	1699	1706	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010582	TTAG	2	8	3119	3126	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010582	TGAAA	2	10	3170	3179	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010582	TAA	2	6	4316	4321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010582	A	7	7	4341	4347	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010582	TCT	2	6	8468	8473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_010582	AAT	2	6	8496	8501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010582	TAA	2	6	8511	8516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010582	TTA	2	6	9160	9165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010582	GA	3	6	14333	14338	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010582	CT	3	6	14348	14353	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_010582	T	6	6	14353	14358	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010582	A	8	8	14940	14947	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010582	A	7	7	14950	14956	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010582	AGT	2	6	14965	14970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010582	AAC	2	6	15014	15019	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_010582	CGG	2	6	15060	15065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_010582	TGA	2	6	15118	15123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010582	A	7	7	15123	15129	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010582	A	7	7	15134	15140	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010582	A	6	6	15154	15159	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010582	GA	3	6	15208	15213	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010582	ACA	2	6	15270	15275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_010582	GTA	2	6	15282	15287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010582	A	6	6	15298	15303	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010582	TGAG	2	8	15328	15335	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010582	GGC	2	6	15383	15388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_010582	AGG	2	6	15418	15423	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010582	GCTT	2	8	15425	15432	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_010582	CCTG	2	8	15473	15480	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
43	NC_010582	TGG	2	6	15602	15607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010582	CGA	2	6	15626	15631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_010582	GCA	2	6	15700	15705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_010582	CGC	2	6	15747	15752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_010582	GTGA	2	8	15753	15760	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010582	TGT	2	6	15786	15791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010582	AGA	2	6	15795	15800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010582	CAG	2	6	15869	15874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_010582	AGCG	2	8	15924	15931	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_010582	TAG	2	6	15976	15981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010582	AT	3	6	16052	16057	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010582	GGA	2	6	16058	16063	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010582	CT	3	6	16083	16088	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_010582	GAA	2	6	16322	16327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010582	GGT	2	6	16396	16401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010582	GTC	2	6	16410	16415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_010582	TCGTG	2	10	16419	16428	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
60	NC_010582	CAT	2	6	16478	16483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_010582	TAA	2	6	16513	16518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010582	GGA	2	6	16522	16527	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010582	ATC	2	6	16546	16551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_010582	AC	3	6	16573	16578	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_010582	CGC	2	6	16712	16717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_010582	AC	3	6	16742	16747	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_010582	CAC	2	6	16757	16762	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_010582	AGCC	2	8	16804	16811	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
69	NC_010582	GAT	2	6	16827	16832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010582	CCT	2	6	16883	16888	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_010582	TAAGGA	2	12	16892	16903	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010582	AGG	2	6	16982	16987	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010582	GA	3	6	17020	17025	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010582	GTA	2	6	17097	17102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010582	TAA	2	6	17104	17109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010582	GTTAA	2	10	17140	17149	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010582	CGA	2	6	17185	17190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_010582	ACG	2	6	17203	17208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_010582	GTAA	2	8	17226	17233	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010582	GAT	2	6	17236	17241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010582	GTA	2	6	17273	17278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010582	GAG	2	6	17306	17311	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010582	TAG	2	6	17374	17379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010582	GCGA	2	8	17382	17389	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
85	NC_010582	AGA	2	6	17460	17465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010582	AG	3	6	17488	17493	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010582	CGG	2	6	17544	17549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_010582	GGA	2	6	17576	17581	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010582	GGGAG	2	10	17657	17666	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010582	ACA	2	6	17694	17699	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_010582	ATG	2	6	17761	17766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010582	GGA	2	6	17894	17899	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010582	TC	3	6	17980	17985	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_010582	ACC	2	6	18160	18165	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_010582	AAT	2	6	18180	18185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_010582	AGC	2	6	18240	18245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_010582	ATTC	2	8	18247	18254	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_010582	TG	3	6	18369	18374	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_010582	GAG	2	6	18390	18395	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010582	GA	3	6	18520	18525	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_010582	ACA	2	6	18546	18551	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_010582	CTAA	2	8	18601	18608	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_010582	GTCT	2	8	18626	18633	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_010582	TAG	2	6	18703	18708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010582	GA	3	6	18816	18821	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_010582	CT	3	6	18932	18937	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_010582	GAT	2	6	18950	18955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010582	CGG	2	6	19040	19045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_010582	GA	3	6	19137	19142	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_010582	TAGG	2	8	19253	19260	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010582	TAC	2	6	19307	19312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_010582	CCT	2	6	19395	19400	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_010582	GGT	2	6	19531	19536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_010582	TCG	2	6	19646	19651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_010582	CGT	2	6	19726	19731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_010582	AGGGA	2	10	19864	19873	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010582	TA	3	6	19930	19935	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010582	GA	3	6	19950	19955	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010582	GAAGTG	2	12	19975	19986	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_010582	ACTAAT	2	12	20005	20016	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_010582	AGT	2	6	20184	20189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_010582	GTA	2	6	20251	20256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_010582	ATG	2	6	20274	20279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010582	T	6	6	20333	20338	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_010582	TAA	3	9	20345	20353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010582	TGA	2	6	20816	20821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_010582	AAG	2	6	20879	20884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_010582	GAA	2	6	20899	20904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_010582	T	6	6	20991	20996	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_010582	TTA	3	9	21046	21054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_010582	GAG	2	6	21102	21107	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_010582	TCC	2	6	21131	21136	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_010582	TCTTGT	2	12	21240	21251	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_010582	GAA	2	6	21311	21316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_010582	CTTT	2	8	21347	21354	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_010582	T	6	6	21352	21357	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_010582	TGA	2	6	21405	21410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_010582	ATT	2	6	21412	21417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_010582	TTG	2	6	21647	21652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_010582	GAT	2	6	21700	21705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_010582	AAG	2	6	22065	22070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_010582	T	6	6	22085	22090	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_010582	ATA	2	6	22110	22115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_010582	TA	3	6	22118	22123	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_010582	TTG	2	6	22246	22251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146	NC_010582	T	6	6	22298	22303	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_010582	A	6	6	22320	22325	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_010582	ATA	2	6	22627	22632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_010582	T	6	6	22661	22666	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_010582	TCT	2	6	22699	22704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_010582	T	6	6	22719	22724	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_010582	TAA	2	6	22729	22734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_010582	AAG	2	6	24149	24154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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155	NC_010582	TTG	2	6	24165	24170	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
156	NC_010582	CTTTT	2	10	24187	24196	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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160	NC_010582	ATA	2	6	24796	24801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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164	NC_010582	T	7	7	24880	24886	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_010582	AATA	2	8	24899	24906	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_010582	AAT	2	6	24913	24918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_010582	ATA	2	6	24931	24936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_010582	A	6	6	25934	25939	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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172	NC_010582	CTT	2	6	30179	30184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
173	NC_010582	TTGA	2	8	30191	30198	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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176	NC_010582	T	6	6	31285	31290	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
177	NC_010582	AATA	2	8	31294	31301	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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181	NC_010582	ATT	2	6	31769	31774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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289	NC_010582	AAG	2	6	74817	74822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
290	NC_010582	A	6	6	74827	74832	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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436	NC_010582	ATT	2	6	114773	114778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
437	NC_010582	TAT	2	6	115796	115801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
438	NC_010582	GTAT	2	8	115825	115832	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
439	NC_010582	ATA	2	6	115855	115860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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442	NC_010582	AAT	2	6	116003	116008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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444	NC_010582	A	6	6	116118	116123	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
445	NC_010582	A	6	6	116532	116537	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
446	NC_010582	TTA	2	6	116544	116549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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451	NC_010582	A	6	6	116617	116622	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
452	NC_010582	ATT	2	6	116627	116632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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454	NC_010582	TAA	2	6	118862	118867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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483	NC_010582	A	7	7	122212	122218	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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486	NC_010582	TGAA	2	8	122286	122293	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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