MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Synechococcus sp. PCC 7002 plasmid pAQ3

Total Repeats: 28

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010477	A	6	6	5291	5296	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010477	TGCC	2	8	7665	7672	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_010477	AGCGT	2	10	8879	8888	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4	NC_010477	A	6	6	9482	9487	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010477	T	7	7	9502	9508	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010477	TAAAAA	2	12	9594	9605	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010477	A	7	7	9601	9607	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010477	TGT	2	6	9613	9618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010477	T	8	8	9635	9642	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010477	CTG	2	6	9650	9655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_010477	C	6	6	13063	13068	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
12	NC_010477	T	7	7	13310	13316	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010477	A	7	7	13378	13384	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010477	CTA	2	6	13391	13396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_010477	TGG	2	6	13412	13417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010477	CTAT	2	8	13436	13443	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_010477	CGC	2	6	13462	13467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_010477	TA	3	6	13470	13475	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010477	TAA	2	6	13535	13540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010477	TCAA	2	8	13554	13561	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_010477	TAA	2	6	13627	13632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010477	GCT	2	6	13633	13638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_010477	CG	5	10	14415	14424	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_010477	GAGG	2	8	14426	14433	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010477	CCT	2	6	14451	14456	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_010477	CTC	2	6	14996	15001	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_010477	TTTA	2	8	15945	15952	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010477	ATA	2	6	15979	15984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.