MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Synechococcus sp. PCC 7002 chromosome

Total Repeats: 7006

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_010475	ATG	2	6	452443	452448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_010475	TTG	2	6	452503	452508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_010475	TAA	2	6	452577	452582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_010475	AGA	2	6	453072	453077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_010475	AAAT	2	8	453104	453111	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_010475	ACT	2	6	453218	453223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_010475	ATT	2	6	456197	456202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_010475	A	7	7	456273	456279	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_010475	GAA	2	6	456307	456312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_010475	ATT	2	6	458487	458492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_010475	GAAT	2	8	460699	460706	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_010475	GCG	2	6	460714	460719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1013	NC_010475	A	7	7	463375	463381	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_010475	CAT	2	6	463552	463557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1015	NC_010475	TCA	2	6	463561	463566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_010475	GGA	2	6	463575	463580	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_010475	ATAA	2	8	464730	464737	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_010475	AC	3	6	464946	464951	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1019	NC_010475	GGTTG	2	10	466073	466082	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_010475	A	6	6	466095	466100	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_010475	ATTTT	2	10	466120	466129	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_010475	A	6	6	466157	466162	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_010475	CAC	2	6	466246	466251	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1024	NC_010475	CTT	2	6	466325	466330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_010475	AATT	2	8	466336	466343	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_010475	ATT	3	9	466381	466389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_010475	AGC	2	6	466685	466690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_010475	AAT	2	6	466691	466696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_010475	T	6	6	466720	466725	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_010475	T	6	6	466761	466766	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_010475	AAT	2	6	466773	466778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_010475	GAG	2	6	466867	466872	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_010475	A	6	6	467018	467023	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_010475	AGA	2	6	467053	467058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_010475	A	7	7	468548	468554	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_010475	TG	3	6	469012	469017	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_010475	CTA	2	6	469065	469070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1038	NC_010475	TGA	2	6	469112	469117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_010475	CCCGTC	2	12	470014	470025	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
1040	NC_010475	TTG	3	9	470035	470043	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_010475	GA	3	6	473486	473491	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_010475	AGCA	2	8	473541	473548	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1043	NC_010475	GT	3	6	473591	473596	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_010475	CAT	2	6	473610	473615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1045	NC_010475	CAC	2	6	473620	473625	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1046	NC_010475	ATC	2	6	473736	473741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_010475	GGGA	2	8	473776	473783	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_010475	TAATG	2	10	473810	473819	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_010475	A	6	6	477724	477729	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_010475	TTG	2	6	477931	477936	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_010475	ATCA	2	8	478648	478655	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1052	NC_010475	TGT	2	6	478676	478681	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_010475	GAG	2	6	478682	478687	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_010475	GAAAA	2	10	481916	481925	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_010475	TAT	2	6	481939	481944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_010475	GGC	2	6	481958	481963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_010475	GAA	2	6	485549	485554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_010475	ATTTT	2	10	489976	489985	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_010475	AGC	2	6	490025	490030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_010475	GCA	2	6	491738	491743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_010475	AC	3	6	491760	491765	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1062	NC_010475	G	6	6	492578	492583	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_010475	CAT	2	6	492589	492594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_010475	T	7	7	492603	492609	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_010475	CAA	2	6	492627	492632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_010475	CAA	2	6	494406	494411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_010475	AAT	2	6	494423	494428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_010475	GAT	2	6	494453	494458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_010475	T	6	6	494524	494529	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_010475	TCA	2	6	494557	494562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1071	NC_010475	T	6	6	496302	496307	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_010475	CAA	2	6	496316	496321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1073	NC_010475	TG	3	6	497246	497251	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_010475	AAT	2	6	497288	497293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_010475	CAA	2	6	497295	497300	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1076	NC_010475	CAA	2	6	497316	497321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1077	NC_010475	GA	3	6	497335	497340	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_010475	TGA	2	6	497465	497470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_010475	A	6	6	498381	498386	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_010475	CTC	2	6	499368	499373	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1081	NC_010475	GTA	2	6	499395	499400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_010475	CTG	2	6	500896	500901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1083	NC_010475	AGCT	2	8	500979	500986	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1084	NC_010475	A	7	7	501138	501144	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_010475	T	6	6	501177	501182	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_010475	CGA	2	6	501192	501197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1087	NC_010475	TTGA	2	8	501220	501227	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_010475	GTT	2	6	501236	501241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_010475	CCT	2	6	502380	502385	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1090	NC_010475	TCC	2	6	502392	502397	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1091	NC_010475	TTTTC	2	10	502611	502620	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1092	NC_010475	ATTT	2	8	502707	502714	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_010475	AACC	2	8	502842	502849	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1094	NC_010475	GCG	2	6	502903	502908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1095	NC_010475	ACCC	2	8	502931	502938	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1096	NC_010475	T	6	6	502981	502986	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_010475	TGTA	2	8	503011	503018	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_010475	CAA	2	6	503061	503066	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1099	NC_010475	CCA	2	6	503067	503072	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1100	NC_010475	T	6	6	503103	503108	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_010475	CTG	2	6	503355	503360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_010475	GGCT	2	8	503381	503388	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1103	NC_010475	T	6	6	503485	503490	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_010475	AATC	2	8	503513	503520	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1105	NC_010475	GTCTT	2	10	503584	503593	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1106	NC_010475	T	8	8	503633	503640	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_010475	C	6	6	503672	503677	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1108	NC_010475	GTCA	2	8	504030	504037	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1109	NC_010475	TCA	2	6	504053	504058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_010475	TCA	2	6	504063	504068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_010475	AGC	2	6	504098	504103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1112	NC_010475	T	6	6	504319	504324	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_010475	GTGCC	2	10	504328	504337	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1114	NC_010475	TTC	2	6	505636	505641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1115	NC_010475	GCT	2	6	505654	505659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1116	NC_010475	ATACA	2	10	505731	505740	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1117	NC_010475	AAG	2	6	507467	507472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_010475	GGA	2	6	510083	510088	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_010475	TGT	2	6	510107	510112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_010475	T	6	6	510145	510150	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_010475	ATG	2	6	510899	510904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_010475	A	8	8	510949	510956	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_010475	ACA	2	6	511188	511193	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1124	NC_010475	GAA	2	6	514030	514035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_010475	ATC	2	6	514036	514041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1126	NC_010475	AAGC	2	8	514043	514050	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1127	NC_010475	GGC	2	6	514065	514070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_010475	T	6	6	514075	514080	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_010475	AGA	2	6	514583	514588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_010475	AAC	2	6	514597	514602	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1131	NC_010475	GCAC	2	8	515870	515877	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1132	NC_010475	CGA	2	6	515890	515895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1133	NC_010475	T	6	6	515938	515943	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_010475	CAC	2	6	516029	516034	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1135	NC_010475	CCG	2	6	516066	516071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1136	NC_010475	A	7	7	516082	516088	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_010475	ATC	2	6	516093	516098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1415	NC_010475	GTT	2	6	632316	632321	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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