MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Synechococcus sp. PCC 7002 chromosome

Total Repeats: 7006

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_010475	A	7	7	2619292	2619298	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6002	NC_010475	AG	3	6	2619352	2619357	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6003	NC_010475	GA	3	6	2619376	2619381	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6004	NC_010475	TCAG	2	8	2619610	2619617	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6005	NC_010475	ATT	2	6	2619655	2619660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6006	NC_010475	T	7	7	2619659	2619665	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6007	NC_010475	AGA	2	6	2619893	2619898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6008	NC_010475	CTG	2	6	2625187	2625192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6009	NC_010475	GAT	2	6	2625198	2625203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6010	NC_010475	T	6	6	2625330	2625335	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6011	NC_010475	CTG	2	6	2625353	2625358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6012	NC_010475	TTG	2	6	2627466	2627471	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6013	NC_010475	GACA	2	8	2628178	2628185	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6014	NC_010475	CAT	2	6	2628188	2628193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6015	NC_010475	T	6	6	2628200	2628205	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6016	NC_010475	TTG	2	6	2629700	2629705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6017	NC_010475	TTTCTT	2	12	2629714	2629725	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6018	NC_010475	AAC	2	6	2629760	2629765	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6019	NC_010475	CCCT	2	8	2629771	2629778	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
6020	NC_010475	CAC	2	6	2629799	2629804	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6021	NC_010475	AAAAAT	2	12	2629840	2629851	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6022	NC_010475	GTT	2	6	2629866	2629871	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6023	NC_010475	C	6	6	2630226	2630231	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6024	NC_010475	TTCC	2	8	2631080	2631087	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6025	NC_010475	CGC	2	6	2631090	2631095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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6028	NC_010475	CAAA	2	8	2632423	2632430	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6029	NC_010475	CTAA	2	8	2633773	2633780	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6030	NC_010475	C	6	6	2633795	2633800	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6031	NC_010475	AT	3	6	2633822	2633827	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6032	NC_010475	AAC	2	6	2633835	2633840	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6033	NC_010475	ATG	2	6	2633862	2633867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6035	NC_010475	TTA	2	6	2634082	2634087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6037	NC_010475	TTC	2	6	2635848	2635853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6039	NC_010475	CTTT	2	8	2635942	2635949	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6040	NC_010475	ACA	2	6	2636593	2636598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6041	NC_010475	ATC	2	6	2636636	2636641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6042	NC_010475	TAG	2	6	2636658	2636663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6044	NC_010475	AAG	2	6	2636693	2636698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6045	NC_010475	TG	3	6	2636762	2636767	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6046	NC_010475	AAC	2	6	2638229	2638234	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6047	NC_010475	GA	3	6	2638376	2638381	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6048	NC_010475	CAA	2	6	2638387	2638392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6049	NC_010475	CAGA	2	8	2638467	2638474	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6050	NC_010475	CAAA	2	8	2638479	2638486	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6051	NC_010475	CTG	2	6	2638495	2638500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6052	NC_010475	T	6	6	2638956	2638961	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6053	NC_010475	TC	3	6	2639431	2639436	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6054	NC_010475	A	6	6	2639440	2639445	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6055	NC_010475	ACAA	2	8	2640732	2640739	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6056	NC_010475	ATC	2	6	2640794	2640799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6057	NC_010475	A	7	7	2641142	2641148	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6058	NC_010475	ATC	2	6	2641174	2641179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6059	NC_010475	CTA	2	6	2641189	2641194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6061	NC_010475	T	7	7	2642747	2642753	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6062	NC_010475	GGCG	2	8	2642797	2642804	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6063	NC_010475	TCC	2	6	2643215	2643220	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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6065	NC_010475	T	6	6	2644170	2644175	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6067	NC_010475	G	6	6	2644210	2644215	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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6069	NC_010475	TAC	2	6	2644267	2644272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6071	NC_010475	A	8	8	2646006	2646013	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6072	NC_010475	GCC	2	6	2646018	2646023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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6075	NC_010475	TTTA	2	8	2647389	2647396	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6076	NC_010475	CT	3	6	2647397	2647402	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6077	NC_010475	TTGGT	2	10	2648245	2648254	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
6078	NC_010475	TTTAC	2	10	2648290	2648299	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
6079	NC_010475	CA	3	6	2648305	2648310	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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6081	NC_010475	A	6	6	2650081	2650086	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6085	NC_010475	TTG	2	6	2654894	2654899	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6087	NC_010475	TGG	2	6	2655123	2655128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6093	NC_010475	TAGAG	2	10	2658976	2658985	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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6099	NC_010475	GCG	2	6	2665576	2665581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6100	NC_010475	ACG	2	6	2665585	2665590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6101	NC_010475	A	6	6	2665658	2665663	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6102	NC_010475	AGTCT	2	10	2665687	2665696	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
6103	NC_010475	CTG	2	6	2665740	2665745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6107	NC_010475	GTT	2	6	2668811	2668816	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6110	NC_010475	ATT	2	6	2670231	2670236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6112	NC_010475	G	6	6	2670254	2670259	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6113	NC_010475	ATT	2	6	2670864	2670869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6114	NC_010475	AGC	2	6	2670896	2670901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6118	NC_010475	A	8	8	2671805	2671812	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6119	NC_010475	TTTC	2	8	2671862	2671869	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6120	NC_010475	ATT	2	6	2672123	2672128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6121	NC_010475	GAAGGT	2	12	2674527	2674538	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
6122	NC_010475	A	6	6	2674554	2674559	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6123	NC_010475	T	6	6	2674888	2674893	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6124	NC_010475	GGT	2	6	2674929	2674934	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6125	NC_010475	A	6	6	2674965	2674970	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6126	NC_010475	TTCT	2	8	2678342	2678349	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6127	NC_010475	T	6	6	2678393	2678398	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6128	NC_010475	TC	5	10	2678402	2678411	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6129	NC_010475	TATT	2	8	2691662	2691669	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6130	NC_010475	TTC	2	6	2691792	2691797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6131	NC_010475	ATC	2	6	2691801	2691806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6133	NC_010475	CGT	2	6	2691838	2691843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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