MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Synechococcus sp. PCC 7002 chromosome

Total Repeats: 7006

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_010475	GCC	2	6	2150875	2150880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5002	NC_010475	CTG	2	6	2150958	2150963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5003	NC_010475	GCGA	2	8	2150993	2151000	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5004	NC_010475	AT	3	6	2151021	2151026	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_010475	AT	3	6	2151043	2151048	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_010475	T	6	6	2152524	2152529	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_010475	ACC	2	6	2153817	2153822	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5008	NC_010475	CAA	2	6	2153900	2153905	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5009	NC_010475	ATG	2	6	2153936	2153941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_010475	A	6	6	2154575	2154580	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_010475	TAATTC	2	12	2154586	2154597	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5012	NC_010475	T	8	8	2154607	2154614	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_010475	GGC	2	6	2154692	2154697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5014	NC_010475	AAG	2	6	2154721	2154726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_010475	AATC	2	8	2157033	2157040	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5016	NC_010475	GAA	2	6	2157053	2157058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_010475	AG	3	6	2157164	2157169	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_010475	C	6	6	2157172	2157177	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5019	NC_010475	A	6	6	2157229	2157234	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_010475	GAC	2	6	2157366	2157371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5021	NC_010475	T	6	6	2157375	2157380	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_010475	CAT	2	6	2157396	2157401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5023	NC_010475	T	6	6	2157420	2157425	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_010475	ATG	2	6	2157456	2157461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_010475	TGTGTT	2	12	2157465	2157476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_010475	T	6	6	2158215	2158220	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_010475	GCA	2	6	2159234	2159239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5028	NC_010475	GCC	2	6	2159241	2159246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5029	NC_010475	AAG	2	6	2159294	2159299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_010475	ATC	2	6	2159337	2159342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5031	NC_010475	ACGAG	2	10	2159391	2159400	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
5032	NC_010475	ATT	2	6	2161440	2161445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_010475	TAA	2	6	2161455	2161460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_010475	GT	3	6	2161468	2161473	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_010475	TTC	2	6	2161487	2161492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5036	NC_010475	AATC	2	8	2162293	2162300	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5037	NC_010475	A	7	7	2163508	2163514	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_010475	AAT	2	6	2163538	2163543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_010475	ATA	2	6	2163565	2163570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_010475	TTTC	2	8	2164186	2164193	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5041	NC_010475	A	6	6	2164205	2164210	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_010475	TAC	2	6	2164241	2164246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5043	NC_010475	GGGA	2	8	2164272	2164279	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_010475	TC	3	6	2164565	2164570	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5045	NC_010475	AAT	2	6	2164712	2164717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_010475	CAG	2	6	2165000	2165005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5047	NC_010475	A	6	6	2165554	2165559	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_010475	GAA	2	6	2166370	2166375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_010475	A	6	6	2166379	2166384	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_010475	TG	3	6	2166427	2166432	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_010475	TGA	2	6	2166488	2166493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_010475	ATA	2	6	2167602	2167607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_010475	A	6	6	2167614	2167619	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_010475	CAG	2	6	2167669	2167674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5055	NC_010475	TAA	2	6	2167675	2167680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_010475	GATC	2	8	2169556	2169563	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5057	NC_010475	TC	3	6	2170779	2170784	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5058	NC_010475	TGA	2	6	2170792	2170797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_010475	ATTTT	2	10	2170798	2170807	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_010475	TCG	2	6	2171531	2171536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5061	NC_010475	TCC	2	6	2171602	2171607	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5062	NC_010475	AGG	2	6	2173817	2173822	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_010475	GCG	2	6	2173830	2173835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5064	NC_010475	GAA	2	6	2175710	2175715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_010475	GGT	2	6	2175722	2175727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5066	NC_010475	ACC	2	6	2175742	2175747	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5067	NC_010475	CAT	2	6	2175778	2175783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5068	NC_010475	AAC	2	6	2177162	2177167	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5069	NC_010475	AAAT	2	8	2177175	2177182	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_010475	TC	3	6	2177229	2177234	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5071	NC_010475	GGT	2	6	2177296	2177301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5072	NC_010475	T	6	6	2177329	2177334	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5073	NC_010475	TAT	2	6	2177411	2177416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_010475	TTC	2	6	2177447	2177452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5075	NC_010475	AC	4	8	2177460	2177467	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5076	NC_010475	TTA	2	6	2177598	2177603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5077	NC_010475	A	6	6	2177628	2177633	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5078	NC_010475	C	8	8	2177671	2177678	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5079	NC_010475	TCGT	2	8	2177774	2177781	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5080	NC_010475	AAAAT	2	10	2178291	2178300	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5081	NC_010475	CAA	2	6	2178336	2178341	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5082	NC_010475	GAAC	2	8	2181722	2181729	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5083	NC_010475	T	6	6	2181772	2181777	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5084	NC_010475	TGA	2	6	2181985	2181990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5085	NC_010475	CTGT	2	8	2182053	2182060	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5086	NC_010475	CTTTT	2	10	2182070	2182079	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
5087	NC_010475	ATT	2	6	2182110	2182115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5088	NC_010475	TGC	2	6	2183227	2183232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5089	NC_010475	T	6	6	2184251	2184256	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5090	NC_010475	AG	3	6	2184326	2184331	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5091	NC_010475	AC	3	6	2184334	2184339	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5092	NC_010475	GCT	2	6	2184347	2184352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5093	NC_010475	CTT	2	6	2184370	2184375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5094	NC_010475	ACT	2	6	2185673	2185678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5095	NC_010475	TCC	2	6	2185694	2185699	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5096	NC_010475	TCGC	2	8	2185710	2185717	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5097	NC_010475	C	7	7	2185790	2185796	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5098	NC_010475	TAC	2	6	2185873	2185878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5099	NC_010475	T	6	6	2189313	2189318	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_010475	A	8	8	2190495	2190502	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_010475	A	8	8	2190735	2190742	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5102	NC_010475	GCT	2	6	2190749	2190754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5103	NC_010475	TAG	2	6	2190811	2190816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_010475	G	7	7	2193247	2193253	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_010475	CCG	2	6	2193297	2193302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5106	NC_010475	ATG	2	6	2193456	2193461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_010475	T	6	6	2193521	2193526	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5108	NC_010475	GTTT	2	8	2193546	2193553	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_010475	T	7	7	2193551	2193557	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5110	NC_010475	TTC	2	6	2193567	2193572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5111	NC_010475	A	6	6	2195700	2195705	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_010475	CAGG	2	8	2195734	2195741	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5113	NC_010475	AGT	2	6	2195746	2195751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_010475	TTTGT	2	10	2195754	2195763	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_010475	TAA	2	6	2195845	2195850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5116	NC_010475	TCA	2	6	2195872	2195877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5117	NC_010475	ATTA	2	8	2195883	2195890	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_010475	T	6	6	2195924	2195929	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_010475	GAT	2	6	2195938	2195943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_010475	C	6	6	2195959	2195964	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5121	NC_010475	ATT	2	6	2196019	2196024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_010475	A	7	7	2196043	2196049	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_010475	CCAA	2	8	2196057	2196064	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5124	NC_010475	ATC	2	6	2196077	2196082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5125	NC_010475	CAGC	2	8	2196135	2196142	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5126	NC_010475	TAT	2	6	2196174	2196179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5127	NC_010475	TATT	2	8	2198997	2199004	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5128	NC_010475	T	9	9	2199013	2199021	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5129	NC_010475	A	6	6	2199052	2199057	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5130	NC_010475	T	7	7	2200197	2200203	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5131	NC_010475	AT	3	6	2200273	2200278	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5132	NC_010475	TAAG	2	8	2200289	2200296	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5133	NC_010475	ATCT	2	8	2200303	2200310	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5134	NC_010475	TTC	2	6	2200358	2200363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5136	NC_010475	A	8	8	2200438	2200445	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5137	NC_010475	A	6	6	2200459	2200464	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5138	NC_010475	T	6	6	2200505	2200510	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5262	NC_010475	CCT	2	6	2260224	2260229	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5263	NC_010475	A	7	7	2260261	2260267	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5265	NC_010475	A	6	6	2266351	2266356	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5266	NC_010475	TGAT	2	8	2266947	2266954	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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5268	NC_010475	CTG	2	6	2266992	2266997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5396	NC_010475	TTCG	2	8	2321053	2321060	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5397	NC_010475	TAT	2	6	2322173	2322178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5401	NC_010475	GAT	2	6	2323475	2323480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5402	NC_010475	CGA	2	6	2323492	2323497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5403	NC_010475	AAT	2	6	2324631	2324636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5404	NC_010475	T	6	6	2324647	2324652	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5405	NC_010475	AGA	2	6	2324714	2324719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5406	NC_010475	ACC	2	6	2324785	2324790	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5407	NC_010475	T	6	6	2325781	2325786	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5408	NC_010475	TATT	2	8	2325810	2325817	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5423	NC_010475	T	6	6	2336296	2336301	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5424	NC_010475	TTACT	2	10	2336304	2336313	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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5429	NC_010475	GA	3	6	2338453	2338458	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5430	NC_010475	A	6	6	2338495	2338500	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5431	NC_010475	T	6	6	2339618	2339623	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5435	NC_010475	C	6	6	2342016	2342021	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5436	NC_010475	GGT	2	6	2342036	2342041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5438	NC_010475	TAA	2	6	2342281	2342286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5439	NC_010475	ACTA	2	8	2344211	2344218	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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