MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Synechococcus sp. PCC 7002 plasmid pAQ7

Total Repeats: 541

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010474	AGGT	2	8	1361	1368	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010474	ACCT	2	8	1373	1380	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_010474	T	6	6	1380	1385	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010474	A	6	6	1431	1436	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010474	A	6	6	2547	2552	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010474	A	8	8	2600	2607	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010474	AAT	2	6	6230	6235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010474	T	6	6	6286	6291	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010474	TAG	2	6	7354	7359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010474	ATT	2	6	7374	7379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010474	CAT	2	6	7382	7387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_010474	AAAC	2	8	7435	7442	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_010474	CAA	2	6	7513	7518	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_010474	AAT	2	6	7519	7524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010474	TTG	2	6	7526	7531	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010474	GTT	2	6	7539	7544	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010474	ACGG	2	8	7581	7588	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_010474	T	6	6	7595	7600	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010474	TGAT	2	8	7625	7632	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010474	ACAACC	2	12	10518	10529	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_010474	ATT	2	6	10873	10878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010474	CTG	2	6	10907	10912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_010474	ATT	2	6	11003	11008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010474	A	6	6	11038	11043	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010474	ATT	2	6	11063	11068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010474	TAA	2	6	11125	11130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010474	TAT	2	6	11145	11150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010474	A	8	8	11177	11184	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010474	GGA	2	6	11225	11230	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010474	A	6	6	11238	11243	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010474	GAC	2	6	11249	11254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_010474	A	6	6	11333	11338	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010474	TAT	2	6	11514	11519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010474	T	6	6	11591	11596	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010474	T	6	6	11691	11696	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010474	AGG	2	6	11712	11717	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010474	T	6	6	11718	11723	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010474	GA	3	6	11729	11734	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010474	A	6	6	12391	12396	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010474	AT	3	6	12409	12414	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010474	CAC	2	6	12416	12421	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_010474	CAA	2	6	12460	12465	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_010474	CTA	2	6	12482	12487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_010474	AGTT	2	8	12503	12510	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010474	TCC	2	6	14252	14257	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_010474	TAC	2	6	14325	14330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_010474	GTG	2	6	14367	14372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010474	AT	3	6	14403	14408	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010474	GAA	2	6	14447	14452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010474	ATG	2	6	14456	14461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010474	GA	3	6	14469	14474	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010474	A	7	7	14604	14610	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010474	A	7	7	14638	14644	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010474	T	6	6	14669	14674	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010474	TGC	2	6	14708	14713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_010474	GATG	2	8	14733	14740	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010474	ATG	3	9	14738	14746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010474	GGA	2	6	14768	14773	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010474	TGTT	2	8	14777	14784	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010474	AATT	2	8	14809	14816	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010474	TGG	2	6	14825	14830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010474	A	6	6	18395	18400	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010474	TACC	2	8	21514	21521	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_010474	TCT	2	6	21608	21613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_010474	GGTTG	2	10	21702	21711	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010474	GGT	2	6	21715	21720	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010474	GCTT	2	8	22000	22007	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_010474	CAC	2	6	22065	22070	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_010474	ATG	2	6	22200	22205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010474	GGA	2	6	22246	22251	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010474	ATTT	2	8	23300	23307	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010474	ATT	2	6	23327	23332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010474	AT	3	6	23345	23350	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010474	A	6	6	23360	23365	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010474	AATT	2	8	23373	23380	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010474	TTAA	2	8	25864	25871	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010474	AGA	2	6	25873	25878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010474	A	6	6	25878	25883	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010474	GTT	2	6	32238	32243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010474	AGC	2	6	32267	32272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_010474	TAG	2	6	32300	32305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010474	TGAT	2	8	32317	32324	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010474	A	6	6	32413	32418	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010474	CT	3	6	33863	33868	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_010474	ACT	2	6	33944	33949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_010474	TC	3	6	33954	33959	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_010474	TTTA	2	8	33985	33992	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010474	AGTT	2	8	34055	34062	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010474	AAT	2	6	34076	34081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010474	A	6	6	34093	34098	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_010474	TA	3	6	35041	35046	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010474	TTAA	2	8	35069	35076	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010474	TAT	2	6	35103	35108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010474	TGT	2	6	35115	35120	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010474	TAG	2	6	36048	36053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_010474	A	6	6	36114	36119	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010474	GTC	2	6	36618	36623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_010474	AAT	2	6	36628	36633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_010474	AATTG	2	10	37882	37891	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010474	T	7	7	37907	37913	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_010474	C	6	6	37966	37971	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
102	NC_010474	TTGA	2	8	39698	39705	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_010474	CCCTCT	2	12	39727	39738	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_010474	CGAC	2	8	39790	39797	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
105	NC_010474	T	6	6	39876	39881	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_010474	GAG	2	6	39882	39887	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_010474	ATT	2	6	39909	39914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010474	ATT	2	6	39935	39940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010474	CAG	2	6	39992	39997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_010474	T	6	6	40038	40043	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010474	CG	3	6	40092	40097	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
112	NC_010474	TGG	2	6	40790	40795	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_010474	CAA	2	6	42764	42769	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_010474	ATT	2	6	42772	42777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_010474	TTTC	2	8	42799	42806	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_010474	TTA	2	6	42824	42829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010474	TCA	2	6	42841	42846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_010474	TCC	2	6	42902	42907	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_010474	CAA	2	6	42908	42913	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_010474	CCA	2	6	42922	42927	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_010474	TCA	2	6	42988	42993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_010474	TTC	2	6	43006	43011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_010474	TTA	2	6	43042	43047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010474	CAA	2	6	43404	43409	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_010474	CTTT	2	8	43410	43417	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_010474	GAT	2	6	44199	44204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_010474	TAAA	2	8	44223	44230	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_010474	AAAT	2	8	46435	46442	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_010474	TCA	2	6	46477	46482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_010474	AGG	2	6	46485	46490	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_010474	ACCA	2	8	46825	46832	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_010474	CTG	2	6	46847	46852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_010474	ACC	2	6	46878	46883	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_010474	TGC	2	6	46900	46905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_010474	AAG	2	6	47145	47150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_010474	GAT	2	6	47194	47199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_010474	A	7	7	47242	47248	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_010474	CAA	2	6	47267	47272	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_010474	GGT	2	6	47321	47326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
140	NC_010474	GCA	2	6	47330	47335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_010474	ATC	2	6	47391	47396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_010474	G	6	6	47403	47408	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
143	NC_010474	CGC	2	6	47444	47449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
144	NC_010474	TGG	2	6	47451	47456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
145	NC_010474	A	6	6	47484	47489	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_010474	TTG	2	6	48395	48400	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
147	NC_010474	T	7	7	48422	48428	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_010474	GCG	2	6	48431	48436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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150	NC_010474	TGG	2	6	48483	48488	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
151	NC_010474	TGG	2	6	48502	48507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
152	NC_010474	GTG	2	6	48515	48520	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
153	NC_010474	AAC	2	6	48536	48541	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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155	NC_010474	TTA	2	6	48682	48687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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157	NC_010474	T	7	7	48746	48752	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_010474	CGC	2	6	48769	48774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
159	NC_010474	GCGG	2	8	48857	48864	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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165	NC_010474	T	7	7	49763	49769	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_010474	CAG	2	6	49905	49910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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184	NC_010474	T	7	7	53933	53939	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
185	NC_010474	A	7	7	54044	54050	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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196	NC_010474	TCA	2	6	61166	61171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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277	NC_010474	TAA	2	6	86496	86501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
278	NC_010474	TCA	2	6	86531	86536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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282	NC_010474	AC	3	6	86744	86749	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
283	NC_010474	GGA	2	6	86769	86774	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
284	NC_010474	AATCC	2	10	86802	86811	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
285	NC_010474	A	6	6	86863	86868	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
286	NC_010474	GGC	2	6	86872	86877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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288	NC_010474	TTC	2	6	88697	88702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
289	NC_010474	TTG	2	6	88937	88942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
290	NC_010474	CCGA	2	8	88947	88954	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
291	NC_010474	TTAT	2	8	89029	89036	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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293	NC_010474	CTGAC	2	10	89137	89146	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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295	NC_010474	TAG	2	6	89193	89198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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