MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shewanella halifaxensis HAW-EB4 chromosome

Total Repeats: 16678

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_010334	GA	3	6	952726	952731	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_010334	CA	3	6	952766	952771	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3003	NC_010334	AGAGG	2	10	952835	952844	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_010334	GTTA	2	8	952853	952860	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_010334	TTA	3	9	952858	952866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_010334	TCC	3	9	952987	952995	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3007	NC_010334	ATT	2	6	952997	953002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_010334	AG	3	6	953017	953022	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_010334	TGT	2	6	953026	953031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_010334	TGC	2	6	954433	954438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3011	NC_010334	TAAT	2	8	954499	954506	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_010334	A	7	7	960494	960500	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_010334	T	7	7	960518	960524	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_010334	TGT	2	6	960678	960683	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_010334	TGC	2	6	960699	960704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3016	NC_010334	TAA	2	6	960728	960733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_010334	TCA	2	6	960863	960868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3018	NC_010334	GCAA	2	8	960915	960922	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3019	NC_010334	TAT	2	6	962197	962202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_010334	A	6	6	962210	962215	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_010334	CTT	2	6	962248	962253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3022	NC_010334	TTTCT	2	10	962255	962264	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
3023	NC_010334	GTTCA	2	10	963692	963701	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3024	NC_010334	GTGCT	2	10	963742	963751	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3025	NC_010334	TA	3	6	966171	966176	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_010334	GCT	2	6	966194	966199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3027	NC_010334	GCA	2	6	966204	966209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3028	NC_010334	TCT	2	6	968022	968027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3029	NC_010334	AAG	2	6	968090	968095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_010334	T	6	6	968124	968129	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_010334	ACA	2	6	968282	968287	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3032	NC_010334	GCC	2	6	968327	968332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3033	NC_010334	CCT	2	6	968349	968354	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3034	NC_010334	GAT	2	6	968546	968551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_010334	AGG	2	6	968618	968623	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_010334	ATTC	2	8	969610	969617	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3037	NC_010334	TGC	2	6	969662	969667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3038	NC_010334	C	6	6	969730	969735	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3039	NC_010334	GTA	2	6	969790	969795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_010334	TTG	2	6	969798	969803	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_010334	A	6	6	969827	969832	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_010334	A	6	6	969840	969845	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_010334	ATT	2	6	969930	969935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_010334	GCT	2	6	969981	969986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3045	NC_010334	AGTG	2	8	969991	969998	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_010334	TGTGA	2	10	970041	970050	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_010334	CAAA	2	8	970073	970080	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3048	NC_010334	AAT	2	6	970096	970101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_010334	T	7	7	970130	970136	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_010334	GGC	2	6	970165	970170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3051	NC_010334	ACTTTA	2	12	970182	970193	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3052	NC_010334	TGC	2	6	970243	970248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3053	NC_010334	TGGT	2	8	970259	970266	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_010334	TGG	2	6	970337	970342	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_010334	CGTCT	2	10	970371	970380	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
3056	NC_010334	GAC	2	6	970449	970454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3057	NC_010334	TGC	2	6	970508	970513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3058	NC_010334	ATG	2	6	970540	970545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_010334	ATA	2	6	970583	970588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_010334	ATA	2	6	970595	970600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_010334	TAA	2	6	970609	970614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_010334	CT	3	6	971650	971655	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3063	NC_010334	T	6	6	971658	971663	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_010334	TCA	2	6	971737	971742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3065	NC_010334	GA	3	6	971761	971766	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_010334	GTT	2	6	975473	975478	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_010334	AAC	2	6	975504	975509	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3068	NC_010334	ACA	2	6	975551	975556	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3069	NC_010334	GCC	2	6	975581	975586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3070	NC_010334	CGA	2	6	975588	975593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3071	NC_010334	GTG	2	6	975746	975751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3072	NC_010334	TTA	2	6	975771	975776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_010334	AG	4	8	975778	975785	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_010334	TCTG	2	8	975791	975798	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3075	NC_010334	A	9	9	975821	975829	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3076	NC_010334	ATG	2	6	975883	975888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3077	NC_010334	ATT	2	6	975981	975986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3078	NC_010334	AGC	2	6	976012	976017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3079	NC_010334	AGC	2	6	976047	976052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3080	NC_010334	ATA	2	6	976056	976061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3081	NC_010334	ATC	2	6	976071	976076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3082	NC_010334	GAA	2	6	977653	977658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3083	NC_010334	TCG	2	6	977824	977829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3084	NC_010334	GGC	2	6	977831	977836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3085	NC_010334	GTT	2	6	977908	977913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3086	NC_010334	AAC	2	6	977951	977956	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3087	NC_010334	A	8	8	977985	977992	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3088	NC_010334	CTAA	2	8	978001	978008	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3089	NC_010334	CTTTT	2	10	978021	978030	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
3090	NC_010334	T	6	6	978034	978039	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3091	NC_010334	TAT	2	6	979170	979175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3092	NC_010334	GAT	2	6	979182	979187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_010334	T	6	6	979203	979208	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_010334	A	6	6	979247	979252	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3095	NC_010334	TGA	2	6	979273	979278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_010334	TAT	2	6	979325	979330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3097	NC_010334	T	6	6	981672	981677	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3098	NC_010334	TAA	2	6	981707	981712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3099	NC_010334	CAA	2	6	981713	981718	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3100	NC_010334	GGCT	2	8	981719	981726	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3101	NC_010334	AT	3	6	981902	981907	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_010334	A	7	7	981949	981955	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_010334	ATTA	2	8	982737	982744	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_010334	TAA	2	6	982775	982780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_010334	AC	3	6	982856	982861	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3106	NC_010334	TAG	2	6	982931	982936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3107	NC_010334	CTG	2	6	983006	983011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3108	NC_010334	TG	3	6	983010	983015	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_010334	CAA	2	6	983086	983091	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3110	NC_010334	AAATG	2	10	983124	983133	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_010334	CGA	2	6	983148	983153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3112	NC_010334	AGG	2	6	983240	983245	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_010334	TAA	2	6	983263	983268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_010334	T	6	6	983765	983770	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_010334	T	6	6	983775	983780	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_010334	AGA	2	6	983833	983838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_010334	GTA	2	6	983853	983858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_010334	ATG	2	6	983881	983886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3119	NC_010334	GTTG	2	8	983942	983949	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_010334	T	6	6	983982	983987	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_010334	TGG	2	6	983989	983994	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_010334	CAAT	2	8	984037	984044	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3123	NC_010334	AGTT	2	8	984066	984073	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_010334	GTTA	2	8	984088	984095	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_010334	TCTG	2	8	984111	984118	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3126	NC_010334	GTCA	2	8	984120	984127	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3127	NC_010334	GAGC	2	8	986707	986714	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3128	NC_010334	ATA	2	6	986717	986722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3129	NC_010334	T	6	6	986748	986753	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3130	NC_010334	TTAA	2	8	987260	987267	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3131	NC_010334	T	6	6	987280	987285	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3132	NC_010334	AGTG	2	8	987314	987321	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3133	NC_010334	TTAGCG	2	12	987398	987409	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3134	NC_010334	AT	3	6	987481	987486	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3135	NC_010334	GAG	2	6	987507	987512	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3136	NC_010334	CAT	2	6	987522	987527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3137	NC_010334	ATT	2	6	987538	987543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3138	NC_010334	TTA	2	6	988303	988308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3260	NC_010334	TGGTG	2	10	1025980	1025989	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
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3263	NC_010334	T	7	7	1027654	1027660	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3264	NC_010334	TCC	2	6	1027744	1027749	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3268	NC_010334	GAG	2	6	1029224	1029229	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3403	NC_010334	TTA	2	6	1061699	1061704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3404	NC_010334	ATC	2	6	1061758	1061763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3405	NC_010334	ATTG	2	8	1061895	1061902	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3406	NC_010334	TCA	2	6	1061917	1061922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3409	NC_010334	CTT	2	6	1067183	1067188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3410	NC_010334	CAT	2	6	1067312	1067317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3416	NC_010334	CAA	2	6	1070161	1070166	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3417	NC_010334	AGTT	2	8	1070168	1070175	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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3432	NC_010334	GTTT	2	8	1072377	1072384	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3433	NC_010334	TCT	3	9	1072443	1072451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3435	NC_010334	GGAA	2	8	1073435	1073442	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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3442	NC_010334	TAAT	2	8	1073651	1073658	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3443	NC_010334	T	6	6	1074492	1074497	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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