MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shewanella halifaxensis HAW-EB4 chromosome

Total Repeats: 16678

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_010334	GTA	2	6	4919171	4919176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15502	NC_010334	CATCTG	2	12	4919303	4919314	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
15503	NC_010334	ATT	2	6	4919330	4919335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15504	NC_010334	ATC	2	6	4920560	4920565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15505	NC_010334	AAC	2	6	4920611	4920616	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15506	NC_010334	TAC	2	6	4920656	4920661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15507	NC_010334	CAA	2	6	4920728	4920733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15508	NC_010334	CAC	2	6	4920748	4920753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15509	NC_010334	CAA	2	6	4920761	4920766	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15510	NC_010334	ATTT	2	8	4920773	4920780	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15511	NC_010334	AAT	2	6	4920805	4920810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15512	NC_010334	AAT	2	6	4920827	4920832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15513	NC_010334	AAT	2	6	4920908	4920913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15514	NC_010334	TCA	2	6	4920957	4920962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15515	NC_010334	T	7	7	4924463	4924469	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15516	NC_010334	GCT	2	6	4924743	4924748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15517	NC_010334	AGAA	2	8	4924752	4924759	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15518	NC_010334	T	7	7	4925887	4925893	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15519	NC_010334	ATA	2	6	4925921	4925926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15520	NC_010334	GTA	2	6	4925930	4925935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15521	NC_010334	CTAT	2	8	4929358	4929365	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15522	NC_010334	GCA	2	6	4929367	4929372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15523	NC_010334	TTTG	2	8	4929427	4929434	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
15524	NC_010334	A	7	7	4929482	4929488	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15525	NC_010334	CGA	2	6	4929546	4929551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15526	NC_010334	C	6	6	4929555	4929560	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
15527	NC_010334	A	6	6	4929581	4929586	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15528	NC_010334	TAA	2	6	4929619	4929624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15529	NC_010334	ACCA	2	8	4929635	4929642	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15530	NC_010334	GTT	2	6	4929645	4929650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15531	NC_010334	AAC	2	6	4929666	4929671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15532	NC_010334	T	6	6	4930486	4930491	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15533	NC_010334	AGAAT	2	10	4930493	4930502	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
15534	NC_010334	TAT	2	6	4930558	4930563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15535	NC_010334	AGTA	2	8	4930630	4930637	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15536	NC_010334	GT	3	6	4930647	4930652	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15537	NC_010334	ACAGT	2	10	4930690	4930699	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
15538	NC_010334	CTAA	2	8	4930826	4930833	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15539	NC_010334	GCCTA	2	10	4930835	4930844	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
15540	NC_010334	TCA	2	6	4930874	4930879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15541	NC_010334	ACA	2	6	4930892	4930897	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15542	NC_010334	GC	3	6	4930931	4930936	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15543	NC_010334	TATAA	2	10	4931340	4931349	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
15544	NC_010334	TTA	2	6	4931360	4931365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15545	NC_010334	CTT	2	6	4931408	4931413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15546	NC_010334	CA	3	6	4931767	4931772	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15547	NC_010334	TTAC	2	8	4931870	4931877	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15548	NC_010334	CT	3	6	4931880	4931885	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15549	NC_010334	TGA	2	6	4931940	4931945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15550	NC_010334	TAAC	2	8	4931955	4931962	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15551	NC_010334	ATA	2	6	4931969	4931974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15552	NC_010334	TTA	2	6	4931976	4931981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15553	NC_010334	TGC	2	6	4932019	4932024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15554	NC_010334	TCA	2	6	4932068	4932073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15555	NC_010334	A	6	6	4932105	4932110	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15556	NC_010334	GAC	2	6	4932172	4932177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15557	NC_010334	AGT	2	6	4932199	4932204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15558	NC_010334	T	6	6	4932211	4932216	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15559	NC_010334	GAA	2	6	4932243	4932248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15560	NC_010334	AAT	2	6	4932261	4932266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15561	NC_010334	ACT	2	6	4932295	4932300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15562	NC_010334	GAACT	2	10	4932322	4932331	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
15563	NC_010334	ACT	2	6	4933240	4933245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15564	NC_010334	TAG	2	6	4933275	4933280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15565	NC_010334	TAA	2	6	4933292	4933297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15566	NC_010334	AGC	2	6	4933314	4933319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15567	NC_010334	TTG	2	6	4933710	4933715	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15568	NC_010334	GTA	2	6	4933766	4933771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15569	NC_010334	ATA	2	6	4934763	4934768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15570	NC_010334	AC	3	6	4934921	4934926	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15571	NC_010334	TAA	2	6	4936526	4936531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15572	NC_010334	TA	3	6	4936548	4936553	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15573	NC_010334	ACC	2	6	4936650	4936655	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15574	NC_010334	TAA	2	6	4936734	4936739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15575	NC_010334	CAC	2	6	4936914	4936919	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15576	NC_010334	A	7	7	4937044	4937050	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15577	NC_010334	TGTGAA	2	12	4937457	4937468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15578	NC_010334	ACA	2	6	4937524	4937529	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15579	NC_010334	TCAA	2	8	4937653	4937660	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15580	NC_010334	A	6	6	4937687	4937692	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15581	NC_010334	CTC	2	6	4937706	4937711	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15582	NC_010334	ATG	2	6	4937722	4937727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15583	NC_010334	AAGG	2	8	4937761	4937768	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15584	NC_010334	TA	3	6	4937837	4937842	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15585	NC_010334	AG	3	6	4937843	4937848	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15586	NC_010334	AGAGG	2	10	4937884	4937893	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
15587	NC_010334	GTG	2	6	4937929	4937934	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15588	NC_010334	GAG	2	6	4937936	4937941	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15589	NC_010334	CTC	2	6	4937950	4937955	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15590	NC_010334	TGGT	2	8	4938008	4938015	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15591	NC_010334	GAAC	2	8	4938016	4938023	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
15592	NC_010334	TGA	2	6	4938046	4938051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15593	NC_010334	A	6	6	4938069	4938074	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15594	NC_010334	TAC	2	6	4938175	4938180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15595	NC_010334	TCC	2	6	4938645	4938650	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15596	NC_010334	TAA	2	6	4938697	4938702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15597	NC_010334	CT	3	6	4938825	4938830	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15598	NC_010334	C	6	6	4938852	4938857	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
15599	NC_010334	ATTA	2	8	4938867	4938874	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15600	NC_010334	T	6	6	4938876	4938881	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15601	NC_010334	T	6	6	4938985	4938990	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15602	NC_010334	TCA	3	9	4939130	4939138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15603	NC_010334	T	6	6	4939153	4939158	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15604	NC_010334	ATT	2	6	4939160	4939165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15605	NC_010334	TTA	2	6	4940413	4940418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15607	NC_010334	AAT	2	6	4941539	4941544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15608	NC_010334	AGC	2	6	4941553	4941558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15609	NC_010334	TCTAG	2	10	4941638	4941647	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
15610	NC_010334	T	8	8	4941650	4941657	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15611	NC_010334	TTA	2	6	4941677	4941682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15612	NC_010334	TA	3	6	4943701	4943706	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15613	NC_010334	TAC	2	6	4943731	4943736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15614	NC_010334	ACC	2	6	4946909	4946914	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15615	NC_010334	AACC	2	8	4946960	4946967	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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15617	NC_010334	ACC	2	6	4947555	4947560	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15618	NC_010334	CAG	2	6	4947675	4947680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15619	NC_010334	GTG	2	6	4947684	4947689	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15620	NC_010334	TA	3	6	4948001	4948006	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15621	NC_010334	TTAA	2	8	4948413	4948420	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15622	NC_010334	ACA	2	6	4948445	4948450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15623	NC_010334	ATT	2	6	4948513	4948518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15624	NC_010334	AGGT	2	8	4948525	4948532	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
15625	NC_010334	AT	3	6	4950172	4950177	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15626	NC_010334	CGT	2	6	4950207	4950212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15627	NC_010334	AT	3	6	4950251	4950256	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15628	NC_010334	AT	3	6	4950276	4950281	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15630	NC_010334	TAT	2	6	4951905	4951910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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