MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shewanella halifaxensis HAW-EB4 chromosome

Total Repeats: 16678

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_010334	GCT	2	6	4717897	4717902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15002	NC_010334	CTT	2	6	4717922	4717927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15003	NC_010334	TCC	2	6	4717971	4717976	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15004	NC_010334	CTT	2	6	4718006	4718011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15005	NC_010334	CA	3	6	4718012	4718017	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15006	NC_010334	CTG	2	6	4718065	4718070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15007	NC_010334	ATC	2	6	4718115	4718120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15008	NC_010334	TCG	2	6	4718140	4718145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15009	NC_010334	CCA	2	6	4718164	4718169	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15010	NC_010334	CCT	2	6	4718220	4718225	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15011	NC_010334	CCG	2	6	4718314	4718319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15012	NC_010334	GCC	2	6	4718379	4718384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15013	NC_010334	T	8	8	4718425	4718432	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15014	NC_010334	CTT	2	6	4718434	4718439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15015	NC_010334	TCAT	2	8	4718505	4718512	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15016	NC_010334	CA	3	6	4718574	4718579	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15017	NC_010334	AGC	2	6	4718640	4718645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15018	NC_010334	GAG	2	6	4718669	4718674	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15019	NC_010334	GGC	2	6	4718696	4718701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15020	NC_010334	AAG	2	6	4718718	4718723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15021	NC_010334	GAT	2	6	4718734	4718739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15022	NC_010334	CAT	2	6	4718755	4718760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15023	NC_010334	AAAG	2	8	4718837	4718844	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15024	NC_010334	CTG	2	6	4718903	4718908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15025	NC_010334	GAAA	2	8	4718966	4718973	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15026	NC_010334	T	6	6	4718981	4718986	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15027	NC_010334	TCA	2	6	4719136	4719141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15028	NC_010334	AAAG	2	8	4719245	4719252	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15029	NC_010334	TA	4	8	4719259	4719266	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15030	NC_010334	CTA	2	6	4719321	4719326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15031	NC_010334	TA	3	6	4719325	4719330	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15032	NC_010334	GAA	2	6	4719331	4719336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15033	NC_010334	CT	3	6	4719342	4719347	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15034	NC_010334	CAA	2	6	4719382	4719387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15035	NC_010334	TTC	2	6	4719581	4719586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15036	NC_010334	TAT	2	6	4719597	4719602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15037	NC_010334	TTG	2	6	4720140	4720145	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15038	NC_010334	TAA	2	6	4720147	4720152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15039	NC_010334	CTTT	2	8	4723210	4723217	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
15040	NC_010334	T	6	6	4723240	4723245	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15041	NC_010334	A	7	7	4723276	4723282	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15042	NC_010334	AGA	2	6	4723366	4723371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15043	NC_010334	AG	3	6	4723375	4723380	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15044	NC_010334	AC	4	8	4723383	4723390	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15045	NC_010334	CAG	2	6	4723415	4723420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15046	NC_010334	CA	3	6	4723445	4723450	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15047	NC_010334	AGC	2	6	4723505	4723510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15048	NC_010334	ATAA	2	8	4723581	4723588	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15049	NC_010334	TAA	2	6	4723632	4723637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15050	NC_010334	A	6	6	4725905	4725910	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15051	NC_010334	ATC	2	6	4726006	4726011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15052	NC_010334	CGATG	2	10	4726029	4726038	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
15053	NC_010334	CGT	2	6	4726099	4726104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15054	NC_010334	TA	3	6	4726642	4726647	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15055	NC_010334	CAA	2	6	4726668	4726673	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15056	NC_010334	CGCCC	2	10	4726706	4726715	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
15057	NC_010334	TAA	2	6	4726730	4726735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15058	NC_010334	CAC	2	6	4726838	4726843	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15059	NC_010334	A	7	7	4728149	4728155	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15060	NC_010334	T	7	7	4728170	4728176	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15061	NC_010334	TTAT	2	8	4728184	4728191	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15062	NC_010334	TTTAA	2	10	4729152	4729161	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15063	NC_010334	ATA	2	6	4729174	4729179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15064	NC_010334	A	6	6	4729201	4729206	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15065	NC_010334	CAT	2	6	4729237	4729242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15066	NC_010334	T	7	7	4732037	4732043	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15070	NC_010334	CTTGT	2	10	4733599	4733608	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
15071	NC_010334	TTTC	2	8	4733675	4733682	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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15074	NC_010334	GAT	2	6	4733880	4733885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15079	NC_010334	TGT	2	6	4736301	4736306	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15081	NC_010334	A	6	6	4736330	4736335	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15082	NC_010334	TC	3	6	4736375	4736380	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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15099	NC_010334	CTAG	2	8	4744768	4744775	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15100	NC_010334	ATTT	2	8	4744869	4744876	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15101	NC_010334	T	6	6	4745694	4745699	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15102	NC_010334	TTG	2	6	4748854	4748859	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15103	NC_010334	TAT	2	6	4748875	4748880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15105	NC_010334	AAT	2	6	4750522	4750527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15109	NC_010334	ACTA	2	8	4750698	4750705	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15110	NC_010334	AAT	2	6	4750715	4750720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15111	NC_010334	TA	3	6	4751063	4751068	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15112	NC_010334	CCA	2	6	4751130	4751135	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15113	NC_010334	ATAA	2	8	4753579	4753586	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15114	NC_010334	AGCA	2	8	4753619	4753626	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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15119	NC_010334	T	7	7	4757894	4757900	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15120	NC_010334	ATA	2	6	4757946	4757951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15121	NC_010334	TA	4	8	4757950	4757957	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15122	NC_010334	CTAA	2	8	4757980	4757987	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15123	NC_010334	ATC	2	6	4757988	4757993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15127	NC_010334	ATCA	2	8	4764463	4764470	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15128	NC_010334	A	6	6	4764596	4764601	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15129	NC_010334	TAA	3	9	4776887	4776895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15131	NC_010334	AAT	2	6	4776913	4776918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15262	NC_010334	CAAA	2	8	4827785	4827792	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
15263	NC_010334	GCA	2	6	4829437	4829442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15264	NC_010334	TTAAA	2	10	4829539	4829548	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15272	NC_010334	TTA	2	6	4829808	4829813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15295	NC_010334	A	6	6	4836581	4836586	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15389	NC_010334	GATA	2	8	4885785	4885792	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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15391	NC_010334	CA	3	6	4885812	4885817	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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