MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shewanella halifaxensis HAW-EB4 chromosome

Total Repeats: 16678

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_010334	TTA	2	6	4226312	4226317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13502	NC_010334	CCCG	2	8	4226322	4226329	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
13503	NC_010334	CTG	2	6	4226341	4226346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13504	NC_010334	CAT	2	6	4226356	4226361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13505	NC_010334	TGC	2	6	4226364	4226369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13506	NC_010334	A	6	6	4226381	4226386	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13507	NC_010334	ATTT	2	8	4226406	4226413	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13508	NC_010334	ATT	2	6	4226425	4226430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13509	NC_010334	CT	3	6	4227843	4227848	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13510	NC_010334	AAG	2	6	4227855	4227860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13511	NC_010334	TAAAG	2	10	4228190	4228199	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
13512	NC_010334	GGA	2	6	4228215	4228220	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13513	NC_010334	TA	3	6	4229081	4229086	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13514	NC_010334	ACA	2	6	4229127	4229132	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13515	NC_010334	TA	3	6	4229228	4229233	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13516	NC_010334	AGT	2	6	4229240	4229245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13517	NC_010334	ACC	2	6	4229338	4229343	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13518	NC_010334	TGCCTA	2	12	4229344	4229355	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
13519	NC_010334	TCA	2	6	4229363	4229368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13520	NC_010334	T	6	6	4229381	4229386	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13521	NC_010334	ATC	2	6	4229408	4229413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13522	NC_010334	CAA	2	6	4229418	4229423	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13523	NC_010334	ATT	2	6	4229442	4229447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13524	NC_010334	T	6	6	4229459	4229464	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13525	NC_010334	ATTG	2	8	4229487	4229494	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13526	NC_010334	AAT	2	6	4230114	4230119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13527	NC_010334	AAC	2	6	4230121	4230126	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13528	NC_010334	GA	3	6	4230163	4230168	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13529	NC_010334	ATT	2	6	4230174	4230179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13530	NC_010334	ATT	2	6	4230288	4230293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13531	NC_010334	CGA	2	6	4230490	4230495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13532	NC_010334	AGC	2	6	4230539	4230544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13533	NC_010334	TGAT	2	8	4233995	4234002	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13534	NC_010334	TC	3	6	4234008	4234013	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13535	NC_010334	GTTC	2	8	4234072	4234079	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13536	NC_010334	ATT	2	6	4234080	4234085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13537	NC_010334	AAAT	2	8	4234163	4234170	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13538	NC_010334	TCAGT	2	10	4234188	4234197	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
13539	NC_010334	TTCAG	2	10	4234200	4234209	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
13540	NC_010334	AG	3	6	4234493	4234498	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13541	NC_010334	T	6	6	4234574	4234579	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13542	NC_010334	ACTTT	2	10	4234727	4234736	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
13543	NC_010334	ACT	2	6	4235864	4235869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13544	NC_010334	AAT	2	6	4235895	4235900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13545	NC_010334	TAT	2	6	4235951	4235956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13546	NC_010334	GCTA	2	8	4236140	4236147	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13547	NC_010334	ATAG	2	8	4236163	4236170	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13548	NC_010334	C	6	6	4236244	4236249	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13549	NC_010334	CAA	2	6	4236271	4236276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13550	NC_010334	TTTTA	2	10	4236292	4236301	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
13551	NC_010334	T	6	6	4236742	4236747	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13552	NC_010334	T	6	6	4236814	4236819	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13553	NC_010334	AGCG	2	8	4236942	4236949	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13554	NC_010334	GCT	2	6	4236994	4236999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13555	NC_010334	TCC	2	6	4237010	4237015	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13556	NC_010334	GCA	2	6	4237061	4237066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13557	NC_010334	TAT	2	6	4237232	4237237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13558	NC_010334	CTC	2	6	4237252	4237257	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13559	NC_010334	TC	3	6	4237256	4237261	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13560	NC_010334	CAAA	2	8	4237347	4237354	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
13561	NC_010334	CAAA	2	8	4237362	4237369	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
13562	NC_010334	CAA	2	6	4237379	4237384	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13563	NC_010334	ACC	2	6	4237493	4237498	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13564	NC_010334	CT	3	6	4237562	4237567	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13565	NC_010334	GTT	2	6	4237571	4237576	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13566	NC_010334	T	6	6	4237637	4237642	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13567	NC_010334	AT	3	6	4241086	4241091	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13568	NC_010334	GT	3	6	4241143	4241148	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13569	NC_010334	A	6	6	4241871	4241876	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13570	NC_010334	CTGT	2	8	4241932	4241939	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13571	NC_010334	ATGAG	2	10	4241988	4241997	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
13572	NC_010334	AT	3	6	4242003	4242008	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13573	NC_010334	TTTA	2	8	4242119	4242126	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13574	NC_010334	TA	3	6	4242151	4242156	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13575	NC_010334	TA	3	6	4242180	4242185	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13576	NC_010334	ATT	2	6	4242198	4242203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13577	NC_010334	TTA	2	6	4242282	4242287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13578	NC_010334	CAA	2	6	4242304	4242309	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13579	NC_010334	AT	3	6	4243252	4243257	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13580	NC_010334	T	7	7	4244287	4244293	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13581	NC_010334	GAC	2	6	4244339	4244344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13582	NC_010334	AT	3	6	4244463	4244468	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13583	NC_010334	CGA	2	6	4244475	4244480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13584	NC_010334	TA	4	8	4244612	4244619	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13585	NC_010334	ATACTA	3	18	4246647	4246664	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13586	NC_010334	TAT	2	6	4246788	4246793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13587	NC_010334	ATT	3	9	4246860	4246868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13588	NC_010334	AACA	2	8	4246938	4246945	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
13589	NC_010334	AATC	2	8	4246965	4246972	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13590	NC_010334	A	7	7	4249245	4249251	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13591	NC_010334	A	7	7	4249259	4249265	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13592	NC_010334	CCA	2	6	4249325	4249330	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13593	NC_010334	TCA	2	6	4249349	4249354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13594	NC_010334	AGC	2	6	4249377	4249382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13595	NC_010334	ATAG	2	8	4249424	4249431	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13596	NC_010334	CTG	2	6	4249944	4249949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13597	NC_010334	A	6	6	4249952	4249957	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13598	NC_010334	CT	3	6	4250006	4250011	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13599	NC_010334	AGC	2	6	4250066	4250071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13600	NC_010334	A	9	9	4250148	4250156	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13601	NC_010334	GAC	2	6	4250681	4250686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13602	NC_010334	TAAT	2	8	4250751	4250758	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13603	NC_010334	GTT	2	6	4250761	4250766	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13604	NC_010334	CT	3	6	4250787	4250792	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13605	NC_010334	T	6	6	4250808	4250813	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13606	NC_010334	ATTC	2	8	4250823	4250830	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13607	NC_010334	GCT	2	6	4250901	4250906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13608	NC_010334	GC	3	6	4250918	4250923	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13609	NC_010334	CTG	2	6	4250969	4250974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13610	NC_010334	AT	3	6	4251007	4251012	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13611	NC_010334	ATC	2	6	4252982	4252987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13612	NC_010334	T	7	7	4253020	4253026	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13613	NC_010334	CTC	2	6	4253073	4253078	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13614	NC_010334	TTGT	2	8	4253144	4253151	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
13615	NC_010334	TTG	2	6	4253155	4253160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13616	NC_010334	TTA	2	6	4253200	4253205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13617	NC_010334	TCCCC	2	10	4254046	4254055	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
13618	NC_010334	C	6	6	4254052	4254057	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13619	NC_010334	TAA	2	6	4254191	4254196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13620	NC_010334	A	6	6	4254195	4254200	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13621	NC_010334	CAAA	2	8	4254206	4254213	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
13622	NC_010334	TTAA	2	8	4256291	4256298	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13623	NC_010334	AAAC	2	8	4256307	4256314	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
13624	NC_010334	CTG	2	6	4256369	4256374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13625	NC_010334	TAA	2	6	4256380	4256385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13626	NC_010334	ACA	2	6	4256747	4256752	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13627	NC_010334	AAAG	2	8	4256804	4256811	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13628	NC_010334	CGA	2	6	4256865	4256870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13629	NC_010334	TACT	3	12	4256917	4256928	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13630	NC_010334	TAA	2	6	4261623	4261628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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