MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shewanella halifaxensis HAW-EB4 chromosome

Total Repeats: 16678

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_010334	AG	3	6	3671873	3671878	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11502	NC_010334	A	7	7	3671900	3671906	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11503	NC_010334	TGG	2	6	3671956	3671961	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11504	NC_010334	TTTA	2	8	3672847	3672854	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11505	NC_010334	AAT	2	6	3672867	3672872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11506	NC_010334	TTA	2	6	3672967	3672972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11507	NC_010334	AG	3	6	3673167	3673172	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11508	NC_010334	AACC	2	8	3673203	3673210	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11509	NC_010334	T	6	6	3673238	3673243	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11510	NC_010334	TGA	2	6	3673246	3673251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11511	NC_010334	CA	3	6	3673291	3673296	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11512	NC_010334	AAT	2	6	3673326	3673331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11513	NC_010334	CTG	2	6	3673352	3673357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11514	NC_010334	ATA	2	6	3675139	3675144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11515	NC_010334	T	6	6	3675156	3675161	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11516	NC_010334	CTT	2	6	3675170	3675175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11517	NC_010334	A	6	6	3675183	3675188	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11518	NC_010334	T	6	6	3675228	3675233	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11519	NC_010334	AAT	2	6	3675302	3675307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11520	NC_010334	AGT	2	6	3675312	3675317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11521	NC_010334	TAA	2	6	3675995	3676000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11522	NC_010334	A	6	6	3678359	3678364	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11523	NC_010334	CAT	2	6	3678376	3678381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11524	NC_010334	CAT	2	6	3678447	3678452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11525	NC_010334	GAACT	2	10	3678477	3678486	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
11526	NC_010334	CTG	2	6	3678938	3678943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11527	NC_010334	TCT	2	6	3679104	3679109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11528	NC_010334	CTT	2	6	3679163	3679168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11529	NC_010334	ACT	2	6	3679256	3679261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11530	NC_010334	TGC	2	6	3679283	3679288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11531	NC_010334	AAC	2	6	3679289	3679294	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11532	NC_010334	GCAACA	2	12	3679339	3679350	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
11533	NC_010334	TAAC	2	8	3680765	3680772	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11534	NC_010334	GCA	2	6	3680814	3680819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11535	NC_010334	GCT	2	6	3680867	3680872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11536	NC_010334	CTTT	2	8	3680895	3680902	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11537	NC_010334	TTA	2	6	3680932	3680937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11538	NC_010334	ATCT	2	8	3680987	3680994	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11539	NC_010334	TATT	2	8	3680996	3681003	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11540	NC_010334	TAGAC	2	10	3681031	3681040	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
11541	NC_010334	ATG	2	6	3682292	3682297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11542	NC_010334	TC	3	6	3683660	3683665	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11543	NC_010334	TAG	2	6	3683708	3683713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11544	NC_010334	AT	3	6	3683736	3683741	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11545	NC_010334	GCA	2	6	3683801	3683806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11546	NC_010334	AAC	2	6	3683813	3683818	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11547	NC_010334	TAAT	2	8	3683854	3683861	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11548	NC_010334	GAA	2	6	3683878	3683883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11549	NC_010334	T	7	7	3683915	3683921	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11550	NC_010334	CCTA	2	8	3683962	3683969	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11551	NC_010334	CG	3	6	3683988	3683993	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11552	NC_010334	AAT	2	6	3684005	3684010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11553	NC_010334	TGA	2	6	3686338	3686343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11554	NC_010334	A	6	6	3686355	3686360	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11555	NC_010334	T	6	6	3686377	3686382	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11556	NC_010334	GCG	2	6	3688875	3688880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11557	NC_010334	GAT	2	6	3688882	3688887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11558	NC_010334	TTA	2	6	3688896	3688901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11559	NC_010334	TGCT	2	8	3688939	3688946	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11560	NC_010334	GAC	2	6	3689206	3689211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11561	NC_010334	ATC	2	6	3689249	3689254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11562	NC_010334	GGT	2	6	3689323	3689328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11563	NC_010334	AGA	2	6	3689365	3689370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11564	NC_010334	AGC	2	6	3689475	3689480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11565	NC_010334	TCACC	2	10	3689494	3689503	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
11566	NC_010334	TGC	2	6	3689528	3689533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11567	NC_010334	TTCC	2	8	3689646	3689653	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11568	NC_010334	CTT	2	6	3689661	3689666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11569	NC_010334	CAC	2	6	3689703	3689708	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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11571	NC_010334	GCC	2	6	3689721	3689726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11572	NC_010334	TGA	2	6	3689752	3689757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11573	NC_010334	TTTTG	2	10	3690689	3690698	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
11574	NC_010334	ATTC	2	8	3690719	3690726	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11575	NC_010334	T	6	6	3690811	3690816	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11578	NC_010334	CTT	2	6	3690991	3690996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11581	NC_010334	TTA	2	6	3691124	3691129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11584	NC_010334	CTT	2	6	3691254	3691259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11585	NC_010334	GTG	2	6	3691266	3691271	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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11590	NC_010334	ATTT	2	8	3691456	3691463	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11591	NC_010334	GTG	2	6	3691468	3691473	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11592	NC_010334	GCA	2	6	3691512	3691517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11593	NC_010334	TGA	2	6	3691534	3691539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11595	NC_010334	CT	3	6	3691696	3691701	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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11597	NC_010334	CAGC	2	8	3691754	3691761	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11598	NC_010334	CTG	2	6	3692204	3692209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11599	NC_010334	ACA	2	6	3692226	3692231	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11600	NC_010334	ACA	2	6	3692249	3692254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11601	NC_010334	AAT	2	6	3692264	3692269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11602	NC_010334	AGC	2	6	3694556	3694561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11603	NC_010334	CAA	2	6	3696100	3696105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11604	NC_010334	GGA	2	6	3696184	3696189	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11605	NC_010334	TTC	2	6	3696221	3696226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11606	NC_010334	TCA	2	6	3696269	3696274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11607	NC_010334	CCTTA	2	10	3697735	3697744	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
11608	NC_010334	A	6	6	3697753	3697758	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11609	NC_010334	GC	3	6	3697761	3697766	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11610	NC_010334	A	6	6	3698649	3698654	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11611	NC_010334	GCC	2	6	3698689	3698694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11612	NC_010334	CT	3	6	3699007	3699012	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11613	NC_010334	TTA	2	6	3699029	3699034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11614	NC_010334	CAAT	2	8	3699070	3699077	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11615	NC_010334	AAC	2	6	3699103	3699108	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11616	NC_010334	TC	3	6	3699347	3699352	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11617	NC_010334	A	6	6	3699362	3699367	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11618	NC_010334	CTG	2	6	3699385	3699390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11619	NC_010334	ATTTT	2	10	3699398	3699407	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
11620	NC_010334	T	6	6	3699404	3699409	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11621	NC_010334	CAA	2	6	3700276	3700281	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11622	NC_010334	AACTA	2	10	3700300	3700309	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
11623	NC_010334	TAA	2	6	3700349	3700354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11624	NC_010334	TAA	2	6	3700372	3700377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11625	NC_010334	CTG	2	6	3701735	3701740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11627	NC_010334	TGA	2	6	3701769	3701774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11629	NC_010334	CAT	2	6	3701830	3701835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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