MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shewanella halifaxensis HAW-EB4 chromosome

Total Repeats: 16678

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_010334	CGA	2	6	3475530	3475535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11002	NC_010334	T	6	6	3475643	3475648	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11003	NC_010334	CCA	2	6	3475673	3475678	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11004	NC_010334	T	6	6	3475699	3475704	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11005	NC_010334	AGTT	2	8	3475717	3475724	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11006	NC_010334	T	6	6	3475723	3475728	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11007	NC_010334	TAC	2	6	3475808	3475813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11008	NC_010334	GAA	2	6	3475884	3475889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11009	NC_010334	T	7	7	3475897	3475903	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11010	NC_010334	A	6	6	3475951	3475956	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11011	NC_010334	A	9	9	3475974	3475982	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11012	NC_010334	TAA	2	6	3476081	3476086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11013	NC_010334	AT	3	6	3476146	3476151	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11014	NC_010334	GTT	2	6	3476184	3476189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11015	NC_010334	TTC	2	6	3476241	3476246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11016	NC_010334	TCT	2	6	3476287	3476292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11017	NC_010334	TTGT	2	8	3476310	3476317	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11018	NC_010334	ATC	2	6	3476319	3476324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11019	NC_010334	GGT	2	6	3476330	3476335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11020	NC_010334	CAC	2	6	3476347	3476352	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11021	NC_010334	AC	3	6	3476357	3476362	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11022	NC_010334	TTC	2	6	3476366	3476371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11023	NC_010334	TCA	2	6	3476397	3476402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11024	NC_010334	AAG	2	6	3476436	3476441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11025	NC_010334	AAC	2	6	3476465	3476470	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11026	NC_010334	TA	3	6	3476555	3476560	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11027	NC_010334	GA	3	6	3476745	3476750	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11028	NC_010334	AAT	2	6	3476785	3476790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11029	NC_010334	ACC	2	6	3476817	3476822	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11030	NC_010334	CCT	2	6	3476833	3476838	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11031	NC_010334	G	6	6	3476879	3476884	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11032	NC_010334	CTA	2	6	3476893	3476898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11033	NC_010334	A	6	6	3476906	3476911	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11034	NC_010334	GCT	2	6	3476947	3476952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11035	NC_010334	CAC	2	6	3476953	3476958	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11036	NC_010334	TAA	2	6	3476983	3476988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11037	NC_010334	GAA	2	6	3477051	3477056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11038	NC_010334	GCT	2	6	3477121	3477126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11039	NC_010334	T	6	6	3477220	3477225	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11040	NC_010334	TCT	2	6	3477289	3477294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11041	NC_010334	CAA	2	6	3477332	3477337	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11042	NC_010334	GAA	2	6	3477392	3477397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11043	NC_010334	AGA	2	6	3477456	3477461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11044	NC_010334	TTG	2	6	3477852	3477857	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11045	NC_010334	AAACG	2	10	3479641	3479650	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
11046	NC_010334	TGC	2	6	3479669	3479674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11047	NC_010334	TTA	2	6	3479677	3479682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11048	NC_010334	GAAT	2	8	3479744	3479751	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11049	NC_010334	CGC	2	6	3482118	3482123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11050	NC_010334	TCCA	2	8	3482295	3482302	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11051	NC_010334	CAGG	2	8	3482310	3482317	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11052	NC_010334	T	6	6	3482371	3482376	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11053	NC_010334	TTA	2	6	3482384	3482389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11054	NC_010334	ATT	2	6	3484047	3484052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11055	NC_010334	TA	3	6	3484059	3484064	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11056	NC_010334	CAG	2	6	3484078	3484083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11057	NC_010334	CAG	2	6	3484098	3484103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11058	NC_010334	CAT	2	6	3484105	3484110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11059	NC_010334	AAT	2	6	3484136	3484141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11060	NC_010334	CTA	2	6	3484153	3484158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11061	NC_010334	ATG	2	6	3484219	3484224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11062	NC_010334	GCAT	2	8	3484301	3484308	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11063	NC_010334	TAT	2	6	3484336	3484341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11064	NC_010334	AGT	2	6	3484385	3484390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11065	NC_010334	AAT	2	6	3484426	3484431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11066	NC_010334	GTC	2	6	3484527	3484532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11067	NC_010334	ATT	2	6	3484721	3484726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11068	NC_010334	CCAT	2	8	3484728	3484735	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11069	NC_010334	A	6	6	3484778	3484783	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11070	NC_010334	TC	3	6	3484841	3484846	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11071	NC_010334	TCA	2	6	3486503	3486508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11072	NC_010334	AGTT	2	8	3486531	3486538	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11073	NC_010334	GAC	2	6	3486574	3486579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11074	NC_010334	CCTA	2	8	3486680	3486687	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11075	NC_010334	ATC	2	6	3486718	3486723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11076	NC_010334	TGA	2	6	3489078	3489083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11077	NC_010334	AATT	2	8	3489141	3489148	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11078	NC_010334	GGA	2	6	3489163	3489168	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11079	NC_010334	TAT	2	6	3492039	3492044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11080	NC_010334	TAT	2	6	3492050	3492055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11081	NC_010334	TAGCT	2	10	3492062	3492071	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
11082	NC_010334	G	7	7	3492083	3492089	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11083	NC_010334	A	7	7	3492122	3492128	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11084	NC_010334	TCT	2	6	3494055	3494060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11085	NC_010334	TGA	2	6	3494069	3494074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11086	NC_010334	TAA	2	6	3494087	3494092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11087	NC_010334	A	6	6	3494101	3494106	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11088	NC_010334	GGC	2	6	3496211	3496216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11089	NC_010334	TGT	2	6	3497386	3497391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11090	NC_010334	TGC	2	6	3497484	3497489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11091	NC_010334	TTTG	2	8	3497499	3497506	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11092	NC_010334	CAA	2	6	3497539	3497544	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11093	NC_010334	ATG	2	6	3499135	3499140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11094	NC_010334	CTG	2	6	3499183	3499188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11095	NC_010334	TTG	2	6	3499220	3499225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11096	NC_010334	AGG	2	6	3499260	3499265	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11097	NC_010334	AGT	2	6	3500495	3500500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11098	NC_010334	CAC	2	6	3500596	3500601	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11099	NC_010334	AAGC	2	8	3500623	3500630	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11100	NC_010334	AGG	2	6	3500753	3500758	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11101	NC_010334	CAAT	2	8	3500796	3500803	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11102	NC_010334	AAAT	3	12	3500804	3500815	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11103	NC_010334	ACA	2	6	3500823	3500828	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11104	NC_010334	AAT	2	6	3500835	3500840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11105	NC_010334	CAG	3	9	3500923	3500931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11106	NC_010334	TTAA	2	8	3501666	3501673	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11107	NC_010334	AACT	2	8	3501717	3501724	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11108	NC_010334	AT	3	6	3501757	3501762	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11109	NC_010334	AAT	2	6	3501781	3501786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11110	NC_010334	TAA	2	6	3501787	3501792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11111	NC_010334	AAT	2	6	3501803	3501808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11112	NC_010334	ATT	2	6	3502343	3502348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11113	NC_010334	ATG	2	6	3506437	3506442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11114	NC_010334	TAA	2	6	3508001	3508006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11115	NC_010334	CTG	2	6	3508093	3508098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11116	NC_010334	A	6	6	3509006	3509011	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11117	NC_010334	T	6	6	3509028	3509033	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11118	NC_010334	TAC	2	6	3509711	3509716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11119	NC_010334	ACA	2	6	3509726	3509731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11120	NC_010334	GCT	2	6	3509738	3509743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11121	NC_010334	GC	3	6	3509768	3509773	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11122	NC_010334	CATT	2	8	3509876	3509883	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11123	NC_010334	ACA	2	6	3509958	3509963	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11124	NC_010334	AGATGA	2	12	3510030	3510041	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11125	NC_010334	AT	3	6	3510048	3510053	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11126	NC_010334	AGC	2	6	3510073	3510078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11127	NC_010334	ACC	2	6	3510092	3510097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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11129	NC_010334	TTAA	2	8	3510214	3510221	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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