MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shewanella halifaxensis HAW-EB4 chromosome

Total Repeats: 16678

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_010334	ATT	2	6	3130646	3130651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10002	NC_010334	ATCC	2	8	3130730	3130737	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10003	NC_010334	ATC	2	6	3130761	3130766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10004	NC_010334	TC	4	8	3130765	3130772	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10005	NC_010334	ATT	2	6	3130808	3130813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10006	NC_010334	TTAC	2	8	3130820	3130827	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10007	NC_010334	GATT	2	8	3130857	3130864	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10008	NC_010334	TAT	2	6	3131943	3131948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10009	NC_010334	A	6	6	3132074	3132079	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10010	NC_010334	AAC	2	6	3132085	3132090	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10011	NC_010334	TCAT	2	8	3132171	3132178	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10012	NC_010334	CAG	2	6	3132194	3132199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10013	NC_010334	TAAA	2	8	3132220	3132227	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10014	NC_010334	TTA	2	6	3132255	3132260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10015	NC_010334	CTT	2	6	3132291	3132296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10016	NC_010334	AT	3	6	3132300	3132305	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10017	NC_010334	AAG	2	6	3132318	3132323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10018	NC_010334	TAT	2	6	3132345	3132350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10019	NC_010334	T	6	6	3135133	3135138	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10020	NC_010334	CCA	2	6	3136704	3136709	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10021	NC_010334	TAT	3	9	3136713	3136721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10022	NC_010334	GGC	2	6	3136724	3136729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10023	NC_010334	TGAC	2	8	3136742	3136749	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10024	NC_010334	TAGC	2	8	3136753	3136760	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10025	NC_010334	GC	3	6	3138461	3138466	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10026	NC_010334	AAT	2	6	3138477	3138482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10027	NC_010334	AAT	2	6	3138552	3138557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10028	NC_010334	AGAC	2	8	3138617	3138624	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10029	NC_010334	AAT	2	6	3138672	3138677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10030	NC_010334	CTA	2	6	3138716	3138721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10031	NC_010334	AC	3	6	3138756	3138761	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10032	NC_010334	TAAGA	2	10	3139750	3139759	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
10033	NC_010334	CAT	2	6	3139787	3139792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10034	NC_010334	TAAAA	2	10	3139793	3139802	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10035	NC_010334	CTA	2	6	3141350	3141355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10036	NC_010334	ATA	2	6	3141410	3141415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10037	NC_010334	CAA	2	6	3141487	3141492	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10038	NC_010334	GTT	2	6	3141496	3141501	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10039	NC_010334	TAA	2	6	3141512	3141517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10040	NC_010334	CAG	2	6	3141544	3141549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10041	NC_010334	AACT	2	8	3141563	3141570	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10042	NC_010334	CAT	2	6	3141686	3141691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10043	NC_010334	ATAA	2	8	3141731	3141738	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10044	NC_010334	GCC	2	6	3141862	3141867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10045	NC_010334	C	6	6	3141866	3141871	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10046	NC_010334	GTT	2	6	3141897	3141902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10047	NC_010334	GTC	2	6	3141962	3141967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10048	NC_010334	AATTA	2	10	3142005	3142014	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10049	NC_010334	TTC	2	6	3142185	3142190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10050	NC_010334	CTAACA	2	12	3143775	3143786	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10051	NC_010334	GTT	2	6	3143866	3143871	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10052	NC_010334	ATG	2	6	3143895	3143900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10053	NC_010334	ATT	2	6	3143956	3143961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10054	NC_010334	GAC	2	6	3143983	3143988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10055	NC_010334	CAAA	2	8	3144009	3144016	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
10056	NC_010334	GA	3	6	3144158	3144163	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10057	NC_010334	CAG	2	6	3144187	3144192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10058	NC_010334	AT	3	6	3144193	3144198	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10059	NC_010334	CG	3	6	3144236	3144241	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10060	NC_010334	TTAA	2	8	3146589	3146596	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10061	NC_010334	TAAA	2	8	3147882	3147889	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10062	NC_010334	CAG	2	6	3147938	3147943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10063	NC_010334	TTA	2	6	3148016	3148021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10066	NC_010334	T	6	6	3151558	3151563	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10067	NC_010334	TATC	2	8	3151565	3151572	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10068	NC_010334	ATA	2	6	3151965	3151970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10069	NC_010334	ATA	2	6	3151986	3151991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10070	NC_010334	TAT	2	6	3152071	3152076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10073	NC_010334	CAA	2	6	3152154	3152159	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10074	NC_010334	ATG	2	6	3152195	3152200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10075	NC_010334	TA	3	6	3152217	3152222	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10079	NC_010334	CAAA	2	8	3152987	3152994	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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10082	NC_010334	ATCT	2	8	3153080	3153087	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10083	NC_010334	ATA	2	6	3153125	3153130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10091	NC_010334	T	6	6	3153527	3153532	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10093	NC_010334	TA	3	6	3155656	3155661	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10094	NC_010334	TA	3	6	3156083	3156088	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10095	NC_010334	AGGT	2	8	3156091	3156098	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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10103	NC_010334	CAT	2	6	3162209	3162214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10104	NC_010334	AT	3	6	3162213	3162218	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10105	NC_010334	A	7	7	3162315	3162321	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10108	NC_010334	TGT	2	6	3162500	3162505	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10109	NC_010334	ATA	2	6	3162555	3162560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10110	NC_010334	AAAT	2	8	3162562	3162569	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10111	NC_010334	ATG	2	6	3165253	3165258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10112	NC_010334	TGA	2	6	3165259	3165264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10113	NC_010334	TCA	2	6	3165298	3165303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10114	NC_010334	T	6	6	3165329	3165334	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10115	NC_010334	ATTAA	2	10	3167702	3167711	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10116	NC_010334	A	6	6	3167716	3167721	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10117	NC_010334	AGC	2	6	3167905	3167910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10125	NC_010334	TTA	2	6	3171007	3171012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10127	NC_010334	GTG	2	6	3171079	3171084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10128	NC_010334	A	8	8	3171117	3171124	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10130	NC_010334	A	6	6	3172277	3172282	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10131	NC_010334	T	7	7	3172301	3172307	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10132	NC_010334	T	6	6	3174835	3174840	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10247	NC_010334	GTTTT	2	10	3212786	3212795	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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10253	NC_010334	A	6	6	3217754	3217759	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10254	NC_010334	GCT	2	6	3217770	3217775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10256	NC_010334	A	6	6	3217832	3217837	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10257	NC_010334	AG	3	6	3217967	3217972	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10258	NC_010334	T	6	6	3217996	3218001	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10260	NC_010334	CATC	2	8	3218044	3218051	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10261	NC_010334	GTA	2	6	3218058	3218063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10264	NC_010334	ATT	2	6	3218212	3218217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10383	NC_010334	AAAG	2	8	3272324	3272331	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10384	NC_010334	GTT	2	6	3272429	3272434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10386	NC_010334	GGA	2	6	3272537	3272542	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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