MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shewanella halifaxensis HAW-EB4 chromosome

Total Repeats: 16678

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_010334	G	6	6	2475989	2475994	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
8002	NC_010334	ACA	2	6	2476116	2476121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8003	NC_010334	AAC	2	6	2476136	2476141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8004	NC_010334	CTAT	2	8	2477935	2477942	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8005	NC_010334	A	6	6	2477955	2477960	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8006	NC_010334	TGC	2	6	2478043	2478048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8007	NC_010334	TAT	2	6	2479524	2479529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8008	NC_010334	CAAA	2	8	2479796	2479803	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
8009	NC_010334	GTT	2	6	2479808	2479813	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8010	NC_010334	TTA	2	6	2479906	2479911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8011	NC_010334	AGG	2	6	2479966	2479971	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8012	NC_010334	T	6	6	2481678	2481683	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8013	NC_010334	T	6	6	2481685	2481690	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8014	NC_010334	TAAT	2	8	2482516	2482523	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8015	NC_010334	ATGG	2	8	2482588	2482595	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8016	NC_010334	TCT	2	6	2482653	2482658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8017	NC_010334	TGTTT	2	10	2482668	2482677	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
8018	NC_010334	AG	3	6	2482738	2482743	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8019	NC_010334	ATC	2	6	2482775	2482780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8020	NC_010334	A	6	6	2482792	2482797	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8021	NC_010334	CCA	2	6	2482827	2482832	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8022	NC_010334	TAT	2	6	2485425	2485430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8023	NC_010334	CAT	2	6	2485515	2485520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8024	NC_010334	TAA	2	6	2485530	2485535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8025	NC_010334	TAAAA	2	10	2485538	2485547	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8026	NC_010334	TA	3	6	2485570	2485575	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8027	NC_010334	T	6	6	2485588	2485593	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8028	NC_010334	TGG	2	6	2486858	2486863	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8029	NC_010334	AGC	2	6	2486891	2486896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8030	NC_010334	TAA	2	6	2486905	2486910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8031	NC_010334	AAAT	2	8	2486938	2486945	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8032	NC_010334	GTC	2	6	2488441	2488446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8033	NC_010334	AATA	2	8	2488460	2488467	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8034	NC_010334	AG	3	6	2488472	2488477	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8035	NC_010334	T	6	6	2489550	2489555	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8036	NC_010334	ACT	2	6	2489624	2489629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8037	NC_010334	TCAT	2	8	2489656	2489663	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8038	NC_010334	TTGA	2	8	2489668	2489675	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8039	NC_010334	AATA	2	8	2489743	2489750	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8040	NC_010334	A	7	7	2489759	2489765	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8041	NC_010334	TAA	2	6	2489783	2489788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8042	NC_010334	TA	3	6	2489837	2489842	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8043	NC_010334	GAG	2	6	2489843	2489848	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8044	NC_010334	TA	3	6	2489928	2489933	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8045	NC_010334	GCT	2	6	2489987	2489992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8046	NC_010334	GTT	2	6	2490048	2490053	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8047	NC_010334	GCT	2	6	2490861	2490866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8048	NC_010334	TAAAA	2	10	2490892	2490901	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8049	NC_010334	AGC	2	6	2490970	2490975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8050	NC_010334	T	7	7	2492094	2492100	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8051	NC_010334	TAA	2	6	2492115	2492120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8052	NC_010334	AAT	2	6	2492243	2492248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8053	NC_010334	TAAG	2	8	2492261	2492268	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8054	NC_010334	TTAT	2	8	2492348	2492355	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8055	NC_010334	GAGT	2	8	2492381	2492388	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8056	NC_010334	ATAA	2	8	2492428	2492435	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8057	NC_010334	ATC	2	6	2492593	2492598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8058	NC_010334	CTA	2	6	2492623	2492628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8059	NC_010334	GAT	2	6	2492645	2492650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8060	NC_010334	AGAGC	2	10	2492729	2492738	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
8061	NC_010334	CAC	2	6	2492739	2492744	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8062	NC_010334	A	6	6	2492814	2492819	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8063	NC_010334	A	6	6	2492823	2492828	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8064	NC_010334	AGT	2	6	2492837	2492842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8065	NC_010334	AATTA	2	10	2492868	2492877	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8066	NC_010334	GTG	2	6	2492928	2492933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8067	NC_010334	AAT	2	6	2492935	2492940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8068	NC_010334	ACTA	2	8	2493509	2493516	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8069	NC_010334	TTAA	2	8	2493534	2493541	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8070	NC_010334	CTAA	2	8	2493546	2493553	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8071	NC_010334	TGT	2	6	2494755	2494760	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8072	NC_010334	GCTAA	2	10	2495210	2495219	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
8073	NC_010334	TTA	2	6	2495220	2495225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8074	NC_010334	T	6	6	2495234	2495239	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8075	NC_010334	GCTG	2	8	2495285	2495292	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8076	NC_010334	TTCAA	2	10	2495394	2495403	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
8077	NC_010334	GAC	2	6	2495412	2495417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8078	NC_010334	TGC	2	6	2495503	2495508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8079	NC_010334	TGAA	2	8	2495582	2495589	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8080	NC_010334	TAT	2	6	2495610	2495615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8081	NC_010334	CGC	2	6	2495645	2495650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8082	NC_010334	GCA	2	6	2495659	2495664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8083	NC_010334	T	6	6	2495799	2495804	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8084	NC_010334	TCA	2	6	2496539	2496544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8085	NC_010334	TTTG	2	8	2496555	2496562	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
8086	NC_010334	AAATTA	2	12	2496630	2496641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8087	NC_010334	TAAT	2	8	2496690	2496697	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8088	NC_010334	GAC	2	6	2496734	2496739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8089	NC_010334	A	6	6	2496766	2496771	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8090	NC_010334	CTG	2	6	2496813	2496818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8091	NC_010334	A	6	6	2496819	2496824	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8092	NC_010334	TAACT	2	10	2496849	2496858	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
8093	NC_010334	GAA	2	6	2496860	2496865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8094	NC_010334	T	7	7	2498299	2498305	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8095	NC_010334	GT	3	6	2498364	2498369	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8096	NC_010334	CTA	2	6	2498383	2498388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8097	NC_010334	T	6	6	2498427	2498432	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8098	NC_010334	TTG	2	6	2498780	2498785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8099	NC_010334	CAT	2	6	2498792	2498797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8100	NC_010334	A	6	6	2498805	2498810	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8101	NC_010334	CTA	2	6	2498840	2498845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8102	NC_010334	ACA	2	6	2498906	2498911	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8103	NC_010334	CTCA	2	8	2499018	2499025	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8104	NC_010334	ATT	2	6	2499043	2499048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8105	NC_010334	CTT	2	6	2499078	2499083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8106	NC_010334	ATTA	2	8	2499158	2499165	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8107	NC_010334	TA	3	6	2499168	2499173	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8108	NC_010334	TGA	2	6	2499194	2499199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8109	NC_010334	TGAT	2	8	2499300	2499307	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8110	NC_010334	T	6	6	2499348	2499353	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8111	NC_010334	TTGA	2	8	2499430	2499437	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8112	NC_010334	GC	3	6	2499451	2499456	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8113	NC_010334	TAA	2	6	2499630	2499635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8114	NC_010334	CAG	2	6	2499663	2499668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8115	NC_010334	TCA	2	6	2499671	2499676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8116	NC_010334	CA	3	6	2499675	2499680	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8117	NC_010334	TGT	2	6	2499694	2499699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8118	NC_010334	GTT	2	6	2499707	2499712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8119	NC_010334	ATA	2	6	2499750	2499755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8120	NC_010334	GCTT	2	8	2499771	2499778	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8121	NC_010334	ACTG	2	8	2499836	2499843	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8122	NC_010334	TAT	2	6	2499897	2499902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8123	NC_010334	AAT	2	6	2499938	2499943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8124	NC_010334	TAG	2	6	2500008	2500013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8125	NC_010334	AG	3	6	2500012	2500017	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8126	NC_010334	GAAG	2	8	2500037	2500044	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8127	NC_010334	AAT	2	6	2500103	2500108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8128	NC_010334	GAT	2	6	2500114	2500119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8129	NC_010334	TGC	2	6	2500123	2500128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8130	NC_010334	AAGCA	2	10	2500199	2500208	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
8131	NC_010334	ACTTA	2	10	2500279	2500288	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
8132	NC_010334	TACT	2	8	2500376	2500383	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8133	NC_010334	TGA	2	6	2500389	2500394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8134	NC_010334	ATT	2	6	2500495	2500500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8135	NC_010334	TAA	2	6	2500528	2500533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8136	NC_010334	T	6	6	2500543	2500548	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8137	NC_010334	A	8	8	2500579	2500586	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8138	NC_010334	TCGATA	2	12	2500605	2500616	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8139	NC_010334	CAT	2	6	2500646	2500651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8141	NC_010334	GAG	2	6	2500736	2500741	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8142	NC_010334	AGCA	2	8	2500880	2500887	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8143	NC_010334	A	6	6	2500945	2500950	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8144	NC_010334	A	7	7	2500986	2500992	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8145	NC_010334	A	6	6	2502064	2502069	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8146	NC_010334	GTA	2	6	2502078	2502083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8148	NC_010334	T	7	7	2502157	2502163	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8149	NC_010334	T	6	6	2503139	2503144	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8150	NC_010334	TAA	2	6	2503146	2503151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8151	NC_010334	TA	3	6	2503237	2503242	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8152	NC_010334	ATT	2	6	2503250	2503255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8153	NC_010334	TCTTT	2	10	2503258	2503267	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
8154	NC_010334	A	6	6	2503290	2503295	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8155	NC_010334	CTG	2	6	2504894	2504899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8157	NC_010334	TAA	2	6	2505004	2505009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8158	NC_010334	TAA	2	6	2505021	2505026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8159	NC_010334	ATT	2	6	2505049	2505054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8160	NC_010334	TGA	2	6	2505094	2505099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8161	NC_010334	T	6	6	2505127	2505132	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8162	NC_010334	CT	3	6	2505142	2505147	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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8167	NC_010334	GTG	2	6	2505482	2505487	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8168	NC_010334	CAT	2	6	2505560	2505565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8170	NC_010334	TCT	2	6	2505697	2505702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8195	NC_010334	ATCCCT	2	12	2511053	2511064	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
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8261	NC_010334	TTTA	2	8	2549932	2549939	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8397	NC_010334	CTAA	2	8	2607087	2607094	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8398	NC_010334	AGTA	2	8	2607132	2607139	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8399	NC_010334	TTG	2	6	2607146	2607151	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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