MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shewanella halifaxensis HAW-EB4 chromosome

Total Repeats: 16678

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_010334	TA	3	6	2007078	2007083	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6502	NC_010334	CT	3	6	2007904	2007909	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6503	NC_010334	T	6	6	2008001	2008006	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6504	NC_010334	GCT	2	6	2008125	2008130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6505	NC_010334	TTG	2	6	2008134	2008139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6506	NC_010334	TTG	2	6	2008143	2008148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6507	NC_010334	GTA	2	6	2008244	2008249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6508	NC_010334	AAT	2	6	2010259	2010264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6509	NC_010334	TAGC	2	8	2010280	2010287	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6510	NC_010334	AAATAA	2	12	2010357	2010368	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6511	NC_010334	AGT	2	6	2011919	2011924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6512	NC_010334	AGA	2	6	2011938	2011943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6513	NC_010334	AAGCTT	2	12	2011980	2011991	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6514	NC_010334	CAA	2	6	2012093	2012098	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6515	NC_010334	CAA	2	6	2013247	2013252	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6516	NC_010334	AGT	2	6	2013260	2013265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6517	NC_010334	TGC	2	6	2013296	2013301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6518	NC_010334	CAG	2	6	2013307	2013312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6519	NC_010334	AT	3	6	2013391	2013396	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6520	NC_010334	CAAT	2	8	2013563	2013570	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6521	NC_010334	CTC	2	6	2013628	2013633	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6522	NC_010334	CCT	2	6	2013658	2013663	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6523	NC_010334	TTGC	2	8	2013707	2013714	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6524	NC_010334	GTT	2	6	2013732	2013737	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6525	NC_010334	CTAC	2	8	2013817	2013824	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6526	NC_010334	CTT	2	6	2013914	2013919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6527	NC_010334	CGGGTA	2	12	2015714	2015725	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
6528	NC_010334	GCG	2	6	2015747	2015752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6529	NC_010334	CTA	2	6	2015866	2015871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6530	NC_010334	A	7	7	2016572	2016578	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6531	NC_010334	T	8	8	2016595	2016602	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6532	NC_010334	CAAA	2	8	2018110	2018117	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6533	NC_010334	ATC	2	6	2018173	2018178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6534	NC_010334	A	6	6	2018182	2018187	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6535	NC_010334	TGATAT	2	12	2018189	2018200	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6536	NC_010334	TGT	2	6	2018914	2018919	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6537	NC_010334	A	6	6	2018926	2018931	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6538	NC_010334	T	6	6	2018949	2018954	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6539	NC_010334	A	8	8	2019021	2019028	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6540	NC_010334	TAT	2	6	2019840	2019845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6541	NC_010334	AAAG	2	8	2019894	2019901	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6542	NC_010334	AG	3	6	2019918	2019923	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6543	NC_010334	AG	3	6	2019939	2019944	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6544	NC_010334	T	6	6	2020863	2020868	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6545	NC_010334	TGA	2	6	2020881	2020886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6546	NC_010334	A	8	8	2020915	2020922	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6547	NC_010334	AAAT	2	8	2020951	2020958	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6548	NC_010334	CAA	2	6	2020968	2020973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6549	NC_010334	GAAG	3	12	2020977	2020988	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6550	NC_010334	AAT	2	6	2021127	2021132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6551	NC_010334	TGG	2	6	2021162	2021167	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6552	NC_010334	TTG	2	6	2021168	2021173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6553	NC_010334	TGC	2	6	2021261	2021266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6554	NC_010334	AAAC	2	8	2021312	2021319	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6555	NC_010334	T	7	7	2021331	2021337	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6556	NC_010334	GAA	2	6	2021357	2021362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6557	NC_010334	AGA	2	6	2021426	2021431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6558	NC_010334	AATA	2	8	2021435	2021442	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6559	NC_010334	T	7	7	2023668	2023674	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6560	NC_010334	TGC	2	6	2023705	2023710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6561	NC_010334	CAA	2	6	2023728	2023733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6562	NC_010334	GAT	2	6	2023742	2023747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6563	NC_010334	GAA	2	6	2023762	2023767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6564	NC_010334	TAG	2	6	2023818	2023823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6565	NC_010334	TAT	2	6	2029051	2029056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6566	NC_010334	AGTT	2	8	2029105	2029112	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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6569	NC_010334	CAC	2	6	2029490	2029495	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6570	NC_010334	CAC	2	6	2029624	2029629	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6571	NC_010334	CAC	2	6	2029758	2029763	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6572	NC_010334	TAA	2	6	2029828	2029833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6573	NC_010334	CAC	2	6	2029895	2029900	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6574	NC_010334	CAC	2	6	2030029	2030034	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6575	NC_010334	CAC	2	6	2030163	2030168	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6576	NC_010334	TAA	2	6	2030233	2030238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6578	NC_010334	AAT	2	6	2030351	2030356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6579	NC_010334	CTT	2	6	2030506	2030511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6580	NC_010334	AAT	2	6	2030552	2030557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6581	NC_010334	TA	3	6	2030882	2030887	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6582	NC_010334	AAGT	2	8	2030963	2030970	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6583	NC_010334	ATG	2	6	2031027	2031032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6588	NC_010334	AT	3	6	2031178	2031183	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6589	NC_010334	TGT	2	6	2031216	2031221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6593	NC_010334	CCT	2	6	2032473	2032478	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6594	NC_010334	T	6	6	2032478	2032483	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6595	NC_010334	GTAA	2	8	2034672	2034679	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6596	NC_010334	T	7	7	2034695	2034701	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6599	NC_010334	G	6	6	2036793	2036798	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6600	NC_010334	T	6	6	2036839	2036844	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6601	NC_010334	T	6	6	2036882	2036887	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6602	NC_010334	A	7	7	2036903	2036909	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6603	NC_010334	CAAA	2	8	2040361	2040368	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6604	NC_010334	TGT	2	6	2040435	2040440	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6605	NC_010334	TA	3	6	2040457	2040462	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6606	NC_010334	ATT	2	6	2040899	2040904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6608	NC_010334	AT	3	6	2040951	2040956	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6609	NC_010334	GCT	2	6	2041055	2041060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6610	NC_010334	TAAT	2	8	2041076	2041083	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6611	NC_010334	A	6	6	2041118	2041123	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6612	NC_010334	AAG	2	6	2041132	2041137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6613	NC_010334	TGCT	2	8	2042454	2042461	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6614	NC_010334	AAT	2	6	2042499	2042504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6615	NC_010334	TTA	2	6	2042539	2042544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6617	NC_010334	GTT	2	6	2043245	2043250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6618	NC_010334	GAT	2	6	2043266	2043271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6619	NC_010334	ATT	2	6	2043325	2043330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6620	NC_010334	A	6	6	2043370	2043375	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6621	NC_010334	A	6	6	2043426	2043431	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6622	NC_010334	CTGA	2	8	2043438	2043445	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6623	NC_010334	TTTC	2	8	2043447	2043454	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6624	NC_010334	TAA	2	6	2043940	2043945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6626	NC_010334	TA	3	6	2044024	2044029	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6627	NC_010334	T	6	6	2044038	2044043	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6628	NC_010334	TAA	2	6	2044076	2044081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6629	NC_010334	A	7	7	2044080	2044086	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6630	NC_010334	AGTG	2	8	2044098	2044105	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6631	NC_010334	TTAAG	2	10	2044118	2044127	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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