MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi B str. SPB7 chromosome

Total Repeats: 10339

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_010102	CTA	2	6	2211257	2211262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4502	NC_010102	CTGC	2	8	2212218	2212225	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4503	NC_010102	A	6	6	2213915	2213920	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4504	NC_010102	TGTA	2	8	2213965	2213972	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4505	NC_010102	AGG	2	6	2214012	2214017	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4506	NC_010102	TCAC	2	8	2214054	2214061	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4507	NC_010102	CGG	2	6	2214259	2214264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4508	NC_010102	CTT	2	6	2214270	2214275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4509	NC_010102	A	8	8	2216011	2216018	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4510	NC_010102	TTTTCA	2	12	2216038	2216049	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4511	NC_010102	ACC	2	6	2216576	2216581	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4512	NC_010102	AAGT	2	8	2216595	2216602	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4513	NC_010102	AT	3	6	2216615	2216620	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4514	NC_010102	T	8	8	2216839	2216846	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4515	NC_010102	T	6	6	2216909	2216914	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4516	NC_010102	ATG	2	6	2217829	2217834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4517	NC_010102	A	6	6	2218038	2218043	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4518	NC_010102	ATCT	2	8	2218622	2218629	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4519	NC_010102	TA	3	6	2218739	2218744	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4520	NC_010102	CCTG	2	8	2218760	2218767	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4521	NC_010102	ATT	2	6	2218828	2218833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4522	NC_010102	TAA	2	6	2218836	2218841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4523	NC_010102	CA	3	6	2218848	2218853	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4524	NC_010102	TTAA	2	8	2218858	2218865	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4525	NC_010102	AAC	2	6	2218876	2218881	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4526	NC_010102	AGC	2	6	2224647	2224652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4527	NC_010102	ACC	2	6	2224690	2224695	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4528	NC_010102	CTCG	2	8	2224709	2224716	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4529	NC_010102	AATT	2	8	2225236	2225243	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4530	NC_010102	AAT	2	6	2225244	2225249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4531	NC_010102	TGT	2	6	2225685	2225690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4532	NC_010102	TGTT	2	8	2225759	2225766	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4533	NC_010102	CGTC	2	8	2225780	2225787	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4534	NC_010102	T	6	6	2229017	2229022	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4535	NC_010102	GGC	2	6	2229036	2229041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4536	NC_010102	ACT	2	6	2230526	2230531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4537	NC_010102	GCG	2	6	2230639	2230644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4538	NC_010102	ATTA	2	8	2236002	2236009	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4539	NC_010102	AT	3	6	2236015	2236020	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4540	NC_010102	ATT	2	6	2237369	2237374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4541	NC_010102	CCAT	2	8	2237428	2237435	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4542	NC_010102	ACTC	2	8	2237533	2237540	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4543	NC_010102	AATC	2	8	2238862	2238869	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4544	NC_010102	GATT	2	8	2238870	2238877	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4545	NC_010102	TAGCG	2	10	2243483	2243492	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4546	NC_010102	A	6	6	2249272	2249277	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4547	NC_010102	CGG	2	6	2249890	2249895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4548	NC_010102	A	7	7	2250095	2250101	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4549	NC_010102	TG	3	6	2250855	2250860	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4550	NC_010102	TTA	2	6	2252596	2252601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4551	NC_010102	TTC	2	6	2253629	2253634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4552	NC_010102	TGG	2	6	2253643	2253648	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4553	NC_010102	TA	3	6	2253775	2253780	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4554	NC_010102	AT	4	8	2253849	2253856	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4555	NC_010102	AAT	2	6	2253900	2253905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4556	NC_010102	GCT	2	6	2253965	2253970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4557	NC_010102	CGA	2	6	2254911	2254916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4558	NC_010102	CT	3	6	2254961	2254966	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4559	NC_010102	GTC	2	6	2257334	2257339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4560	NC_010102	ATT	2	6	2257340	2257345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4561	NC_010102	T	7	7	2257408	2257414	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4562	NC_010102	GAT	2	6	2257421	2257426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4563	NC_010102	TTC	2	6	2257576	2257581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4564	NC_010102	GAT	2	6	2260000	2260005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4565	NC_010102	CCTT	2	8	2260030	2260037	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4566	NC_010102	AGG	2	6	2260357	2260362	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4567	NC_010102	CAG	2	6	2260377	2260382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4568	NC_010102	AAG	2	6	2260399	2260404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4569	NC_010102	TGT	2	6	2264052	2264057	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4570	NC_010102	TGC	2	6	2265425	2265430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4571	NC_010102	GGC	2	6	2265959	2265964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4572	NC_010102	GCGCC	2	10	2266007	2266016	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
4573	NC_010102	GCA	2	6	2266022	2266027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4574	NC_010102	CTC	2	6	2269245	2269250	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4575	NC_010102	ATT	2	6	2269251	2269256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4576	NC_010102	CCG	2	6	2269303	2269308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4577	NC_010102	AGAAT	2	10	2269360	2269369	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4578	NC_010102	CCTT	2	8	2270167	2270174	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4579	NC_010102	CT	3	6	2272373	2272378	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4580	NC_010102	ATTT	2	8	2272402	2272409	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4581	NC_010102	GTT	2	6	2272446	2272451	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4582	NC_010102	A	6	6	2272548	2272553	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4583	NC_010102	GCC	2	6	2273915	2273920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4584	NC_010102	GCA	2	6	2273921	2273926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4585	NC_010102	CA	3	6	2278889	2278894	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4586	NC_010102	TCAT	2	8	2279801	2279808	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4587	NC_010102	A	6	6	2279815	2279820	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4588	NC_010102	ATG	2	6	2281446	2281451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4589	NC_010102	CCGT	2	8	2282398	2282405	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4590	NC_010102	T	7	7	2282431	2282437	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4591	NC_010102	GAT	2	6	2282468	2282473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4592	NC_010102	TTA	2	6	2282535	2282540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4593	NC_010102	CCATA	2	10	2282581	2282590	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
4594	NC_010102	GTT	2	6	2283630	2283635	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4595	NC_010102	AGCGC	2	10	2287908	2287917	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
4596	NC_010102	TTA	2	6	2289803	2289808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4597	NC_010102	ATT	2	6	2289833	2289838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4598	NC_010102	TA	3	6	2289843	2289848	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4599	NC_010102	TTTA	2	8	2289849	2289856	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4600	NC_010102	AATA	2	8	2289898	2289905	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4601	NC_010102	TCC	2	6	2289906	2289911	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4602	NC_010102	GCT	2	6	2290012	2290017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4603	NC_010102	CAACA	2	10	2290134	2290143	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
4604	NC_010102	CAG	2	6	2290153	2290158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4605	NC_010102	TGC	2	6	2290901	2290906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4606	NC_010102	CGC	2	6	2290961	2290966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4607	NC_010102	CGG	2	6	2291018	2291023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4608	NC_010102	CAG	2	6	2291073	2291078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4609	NC_010102	GCC	2	6	2291125	2291130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4610	NC_010102	CCG	2	6	2291138	2291143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4611	NC_010102	CCG	2	6	2291150	2291155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4612	NC_010102	CAG	2	6	2291196	2291201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4613	NC_010102	GCC	2	6	2291221	2291226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4614	NC_010102	C	7	7	2291246	2291252	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4615	NC_010102	AGC	2	6	2291253	2291258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4616	NC_010102	CCA	2	6	2291296	2291301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4617	NC_010102	CCA	2	6	2291380	2291385	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4618	NC_010102	CGC	2	6	2291386	2291391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4619	NC_010102	CAG	2	6	2291426	2291431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4620	NC_010102	CGGCG	2	10	2291432	2291441	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
4621	NC_010102	GCA	3	9	2291446	2291454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4622	NC_010102	CCA	2	6	2291458	2291463	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4623	NC_010102	ACC	2	6	2291475	2291480	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4624	NC_010102	T	6	6	2291491	2291496	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4625	NC_010102	CTCCGT	2	12	2291540	2291551	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
4626	NC_010102	CGG	2	6	2291570	2291575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4627	NC_010102	CGC	2	6	2291609	2291614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4628	NC_010102	CAG	2	6	2291630	2291635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4629	NC_010102	CGC	2	6	2291683	2291688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4630	NC_010102	GCC	3	9	2291703	2291711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4631	NC_010102	AGT	2	6	2291740	2291745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4632	NC_010102	TCAGCG	2	12	2291746	2291757	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4633	NC_010102	GCC	3	9	2291790	2291798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4634	NC_010102	CAG	3	9	2291801	2291809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4635	NC_010102	CAG	2	6	2291825	2291830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4636	NC_010102	GCG	2	6	2291875	2291880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4637	NC_010102	CAGCGC	2	12	2291981	2291992	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
4638	NC_010102	GC	3	6	2292022	2292027	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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4640	NC_010102	CAG	2	6	2292077	2292082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4644	NC_010102	GCCA	2	8	2292186	2292193	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4645	NC_010102	CAG	4	12	2292194	2292205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4646	NC_010102	CAG	2	6	2292212	2292217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4648	NC_010102	GCCTG	2	10	2292225	2292234	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4649	NC_010102	ATA	2	6	2294331	2294336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4650	NC_010102	TAA	2	6	2294349	2294354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4652	NC_010102	AAC	2	6	2295681	2295686	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4653	NC_010102	CAA	2	6	2295711	2295716	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4658	NC_010102	TA	3	6	2295888	2295893	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4662	NC_010102	ATCT	2	8	2300477	2300484	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4663	NC_010102	AAT	2	6	2300527	2300532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4664	NC_010102	A	7	7	2300546	2300552	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4665	NC_010102	A	6	6	2301140	2301145	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4666	NC_010102	ATG	2	6	2301202	2301207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4684	NC_010102	TGG	2	6	2304988	2304993	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4686	NC_010102	TGA	2	6	2305074	2305079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4748	NC_010102	TTGA	2	8	2326737	2326744	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4749	NC_010102	T	6	6	2328182	2328187	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4750	NC_010102	ATT	2	6	2328197	2328202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4751	NC_010102	CT	3	6	2328220	2328225	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4752	NC_010102	ATTA	2	8	2328229	2328236	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4753	NC_010102	ATA	2	6	2330164	2330169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4754	NC_010102	AAT	2	6	2330380	2330385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4755	NC_010102	TA	4	8	2333225	2333232	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4756	NC_010102	ATGA	2	8	2333247	2333254	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4757	NC_010102	TTA	2	6	2333285	2333290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4758	NC_010102	A	6	6	2333353	2333358	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4759	NC_010102	TCA	2	6	2333371	2333376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4760	NC_010102	CAT	2	6	2333387	2333392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4762	NC_010102	TAT	2	6	2335210	2335215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4763	NC_010102	GAA	2	6	2336774	2336779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4765	NC_010102	CAT	2	6	2339938	2339943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4892	NC_010102	CA	3	6	2395049	2395054	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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4896	NC_010102	CAA	2	6	2396159	2396164	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4897	NC_010102	GCT	2	6	2396179	2396184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4899	NC_010102	GC	3	6	2398357	2398362	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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4926	NC_010102	AACC	2	8	2427891	2427898	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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