MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus USA300_TCH1516 chromosome

Total Repeats: 14696

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_010079	AATT	2	8	320820	320827	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_010079	T	6	6	320842	320847	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_010079	GATG	2	8	321945	321952	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_010079	ACGA	2	8	321990	321997	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1505	NC_010079	GTT	2	6	322001	322006	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_010079	GA	3	6	322044	322049	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_010079	TAACTT	2	12	322206	322217	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1508	NC_010079	T	6	6	323230	323235	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_010079	CTC	2	6	326004	326009	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1510	NC_010079	TCC	2	6	327594	327599	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1511	NC_010079	ATT	2	6	327602	327607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_010079	TTA	2	6	327638	327643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_010079	TAA	2	6	327689	327694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_010079	TAA	2	6	327699	327704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_010079	TAA	2	6	327718	327723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_010079	A	6	6	327729	327734	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_010079	TAA	2	6	327777	327782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_010079	T	7	7	327789	327795	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_010079	GAA	2	6	327799	327804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_010079	ATTT	2	8	327806	327813	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_010079	A	6	6	328523	328528	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_010079	ATTTA	2	10	330192	330201	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_010079	TTAA	2	8	330239	330246	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_010079	AT	3	6	330249	330254	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_010079	AT	3	6	330266	330271	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_010079	A	7	7	330278	330284	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_010079	A	6	6	330298	330303	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_010079	TA	3	6	330305	330310	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_010079	TAA	2	6	330318	330323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_010079	TA	3	6	330326	330331	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_010079	A	6	6	330357	330362	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_010079	AGG	2	6	330401	330406	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_010079	T	7	7	330760	330766	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_010079	AAC	2	6	330772	330777	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1535	NC_010079	AGG	2	6	340316	340321	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_010079	TCA	2	6	344490	344495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1538	NC_010079	A	6	6	344584	344589	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_010079	TA	4	8	345322	345329	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_010079	ATT	2	6	345359	345364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_010079	ATG	2	6	345374	345379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_010079	TTTA	2	8	346079	346086	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_010079	A	6	6	346096	346101	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_010079	TA	3	6	346103	346108	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_010079	T	6	6	346120	346125	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_010079	TAAA	2	8	346144	346151	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_010079	AAT	2	6	346163	346168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_010079	GAA	2	6	346418	346423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_010079	GTT	2	6	346444	346449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_010079	TTTA	2	8	346458	346465	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_010079	GAA	2	6	347567	347572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_010079	AAATG	2	10	347578	347587	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_010079	TAG	2	6	347611	347616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1555	NC_010079	TA	3	6	347657	347662	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_010079	GAT	2	6	347663	347668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1558	NC_010079	TGAAT	2	10	347708	347717	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_010079	TGA	2	6	347765	347770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1561	NC_010079	TTTG	2	8	347792	347799	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_010079	ATTT	2	8	347812	347819	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_010079	AGA	2	6	347822	347827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1566	NC_010079	TAA	2	6	347996	348001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_010079	AT	3	6	348020	348025	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1571	NC_010079	ATT	2	6	349515	349520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_010079	ATG	2	6	349530	349535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1595	NC_010079	TGA	2	6	351302	351307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1599	NC_010079	ATT	2	6	351448	351453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1605	NC_010079	A	7	7	352817	352823	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_010079	TA	3	6	352835	352840	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_010079	T	6	6	352852	352857	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1619	NC_010079	CT	3	6	354164	354169	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1620	NC_010079	AG	3	6	354203	354208	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_010079	A	7	7	354263	354269	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1624	NC_010079	T	6	6	355269	355274	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1627	NC_010079	AGAC	2	8	355304	355311	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1629	NC_010079	AAGT	2	8	356890	356897	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_010079	TGAG	2	8	356940	356947	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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