MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus USA300_TCH1516 chromosome

Total Repeats: 14696

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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14503	NC_010079	ATTTA	2	10	2825896	2825905	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14504	NC_010079	TA	3	6	2825958	2825963	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14505	NC_010079	A	7	7	2825969	2825975	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14506	NC_010079	T	7	7	2825988	2825994	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14507	NC_010079	ATT	2	6	2826009	2826014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14508	NC_010079	AAC	2	6	2826677	2826682	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14509	NC_010079	CTAA	2	8	2826730	2826737	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14510	NC_010079	AGGT	2	8	2826742	2826749	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
14511	NC_010079	TGAC	2	8	2830220	2830227	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14512	NC_010079	AT	3	6	2830260	2830265	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14513	NC_010079	ATTT	2	8	2830331	2830338	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14521	NC_010079	T	7	7	2832679	2832685	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14522	NC_010079	ATT	2	6	2832708	2832713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14523	NC_010079	AAT	2	6	2832729	2832734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14524	NC_010079	A	6	6	2832810	2832815	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14537	NC_010079	CTAAA	2	10	2833138	2833147	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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14543	NC_010079	AGTT	2	8	2833277	2833284	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14544	NC_010079	T	6	6	2833283	2833288	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14545	NC_010079	AT	3	6	2833370	2833375	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14551	NC_010079	TAT	2	6	2842129	2842134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14555	NC_010079	CTATTT	2	12	2842738	2842749	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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14561	NC_010079	A	7	7	2846823	2846829	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14562	NC_010079	TAT	2	6	2846830	2846835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14613	NC_010079	A	6	6	2856446	2856451	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14614	NC_010079	TA	3	6	2856477	2856482	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14632	NC_010079	CTA	2	6	2859451	2859456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14633	NC_010079	TTCA	2	8	2859485	2859492	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14634	NC_010079	CTA	2	6	2859517	2859522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14635	NC_010079	ATT	2	6	2859531	2859536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14640	NC_010079	GA	3	6	2864032	2864037	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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14646	NC_010079	T	6	6	2864455	2864460	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14667	NC_010079	ATC	2	6	2865346	2865351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14672	NC_010079	AGAC	2	8	2865655	2865662	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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14676	NC_010079	TTA	2	6	2866201	2866206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14692	NC_010079	TTAT	2	8	2872478	2872485	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14693	NC_010079	TATT	2	8	2872540	2872547	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14694	NC_010079	A	8	8	2872561	2872568	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.