MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus USA300_TCH1516 chromosome

Total Repeats: 14696

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_010079	ATTT	2	8	2510490	2510497	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13002	NC_010079	AGTACA	2	12	2510505	2510516	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13003	NC_010079	ATA	2	6	2510557	2510562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13004	NC_010079	AT	3	6	2510573	2510578	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13005	NC_010079	ATTGA	2	10	2510601	2510610	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
13006	NC_010079	CATTTA	2	12	2510736	2510747	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13007	NC_010079	AT	3	6	2510752	2510757	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13008	NC_010079	TGA	2	6	2510783	2510788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13009	NC_010079	TAA	2	6	2510792	2510797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13010	NC_010079	TGC	2	6	2510831	2510836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13011	NC_010079	A	6	6	2510878	2510883	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13012	NC_010079	ACA	2	6	2510907	2510912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13013	NC_010079	A	6	6	2510923	2510928	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13014	NC_010079	TAA	2	6	2510929	2510934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13015	NC_010079	ACA	2	6	2511708	2511713	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13016	NC_010079	AAT	2	6	2511731	2511736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13017	NC_010079	A	7	7	2511861	2511867	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13018	NC_010079	AGA	2	6	2511894	2511899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13019	NC_010079	ATGT	2	8	2512616	2512623	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13020	NC_010079	TCC	2	6	2520639	2520644	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13021	NC_010079	T	6	6	2520728	2520733	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13022	NC_010079	ATA	2	6	2520807	2520812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13023	NC_010079	AT	3	6	2520892	2520897	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13024	NC_010079	TC	3	6	2520898	2520903	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13025	NC_010079	CTTA	2	8	2520913	2520920	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13026	NC_010079	ATTT	2	8	2520924	2520931	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13027	NC_010079	T	6	6	2520929	2520934	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13028	NC_010079	ATA	2	6	2524652	2524657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13029	NC_010079	A	7	7	2524666	2524672	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13030	NC_010079	TTTTGT	2	12	2525467	2525478	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13031	NC_010079	A	7	7	2525570	2525576	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13032	NC_010079	AT	3	6	2525584	2525589	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13033	NC_010079	ATTT	2	8	2525605	2525612	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13034	NC_010079	AGCA	2	8	2525614	2525621	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13035	NC_010079	AT	3	6	2525625	2525630	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13036	NC_010079	TAT	3	9	2525648	2525656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13037	NC_010079	T	6	6	2526209	2526214	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13038	NC_010079	ATTTT	2	10	2526230	2526239	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
13039	NC_010079	AAAT	2	8	2526242	2526249	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13040	NC_010079	TTA	2	6	2526329	2526334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13041	NC_010079	CT	3	6	2526342	2526347	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13042	NC_010079	A	6	6	2526354	2526359	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13043	NC_010079	GAA	2	6	2526384	2526389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13044	NC_010079	GAT	2	6	2527184	2527189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13045	NC_010079	CAA	2	6	2527197	2527202	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13046	NC_010079	TC	3	6	2527352	2527357	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13047	NC_010079	TTTC	2	8	2527369	2527376	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
13048	NC_010079	ACG	2	6	2527434	2527439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13049	NC_010079	T	6	6	2527478	2527483	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13050	NC_010079	TTA	2	6	2527559	2527564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13051	NC_010079	AGA	2	6	2527591	2527596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13052	NC_010079	TAG	2	6	2527597	2527602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13053	NC_010079	TGT	2	6	2527603	2527608	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13054	NC_010079	AT	3	6	2527613	2527618	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13055	NC_010079	ATC	2	6	2527654	2527659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13056	NC_010079	ATT	2	6	2527683	2527688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13057	NC_010079	A	6	6	2527705	2527710	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13058	NC_010079	CAA	2	6	2527726	2527731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13059	NC_010079	TTG	2	6	2527803	2527808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13060	NC_010079	CTT	2	6	2527814	2527819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13061	NC_010079	TTG	2	6	2527820	2527825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13062	NC_010079	AT	3	6	2527945	2527950	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13063	NC_010079	AAT	2	6	2528104	2528109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13064	NC_010079	A	6	6	2528165	2528170	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13065	NC_010079	TAT	2	6	2528177	2528182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13066	NC_010079	A	6	6	2528330	2528335	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13067	NC_010079	CCT	2	6	2529944	2529949	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13068	NC_010079	TA	3	6	2529976	2529981	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13069	NC_010079	ATA	2	6	2530018	2530023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13070	NC_010079	ATA	2	6	2530127	2530132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13071	NC_010079	A	7	7	2530137	2530143	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13072	NC_010079	CCT	2	6	2530758	2530763	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13073	NC_010079	AC	3	6	2530768	2530773	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13074	NC_010079	A	7	7	2530816	2530822	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13075	NC_010079	CTA	2	6	2530823	2530828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13077	NC_010079	CTA	2	6	2530878	2530883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13078	NC_010079	CTA	2	6	2532011	2532016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13079	NC_010079	AACT	2	8	2532026	2532033	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13080	NC_010079	TAAT	2	8	2532041	2532048	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13081	NC_010079	ACT	2	6	2532080	2532085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13083	NC_010079	ATAAA	2	10	2532184	2532193	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13084	NC_010079	A	7	7	2532191	2532197	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13085	NC_010079	ATT	2	6	2532202	2532207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13086	NC_010079	AG	3	6	2532236	2532241	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13087	NC_010079	ACA	2	6	2533525	2533530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13088	NC_010079	CAT	2	6	2533546	2533551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13089	NC_010079	AT	3	6	2535812	2535817	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13090	NC_010079	CTTATT	2	12	2535821	2535832	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13091	NC_010079	TA	3	6	2535908	2535913	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13092	NC_010079	A	6	6	2537392	2537397	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13093	NC_010079	AC	3	6	2537400	2537405	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13094	NC_010079	A	6	6	2537440	2537445	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13095	NC_010079	TTA	2	6	2537457	2537462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13096	NC_010079	AGT	2	6	2537501	2537506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13097	NC_010079	ATA	2	6	2537515	2537520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13098	NC_010079	AGG	2	6	2537529	2537534	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13099	NC_010079	ACTC	2	8	2537769	2537776	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
13100	NC_010079	GAT	2	6	2538541	2538546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13101	NC_010079	TTTTC	2	10	2538560	2538569	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
13102	NC_010079	AT	3	6	2538571	2538576	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13103	NC_010079	CATTTT	2	12	2538637	2538648	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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13105	NC_010079	ACC	2	6	2538671	2538676	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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13108	NC_010079	TAA	2	6	2538760	2538765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13109	NC_010079	CCT	2	6	2538771	2538776	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13110	NC_010079	TA	3	6	2538785	2538790	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13111	NC_010079	ACC	2	6	2539687	2539692	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13112	NC_010079	TAGTA	2	10	2539699	2539708	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
13113	NC_010079	ATGA	2	8	2539717	2539724	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13114	NC_010079	ATTTTA	2	12	2539728	2539739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13115	NC_010079	ATTC	2	8	2539785	2539792	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13116	NC_010079	AAT	2	6	2539805	2539810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13117	NC_010079	TGTT	2	8	2539861	2539868	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
13118	NC_010079	TAG	2	6	2539910	2539915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13120	NC_010079	TCT	2	6	2540010	2540015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13121	NC_010079	ATTT	2	8	2540020	2540027	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13122	NC_010079	TGTT	2	8	2540052	2540059	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
13123	NC_010079	TA	3	6	2540134	2540139	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13124	NC_010079	GAA	2	6	2540140	2540145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13125	NC_010079	TCTAC	2	10	2540177	2540186	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
13126	NC_010079	CT	3	6	2540191	2540196	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13127	NC_010079	TATT	2	8	2540218	2540225	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13128	NC_010079	TAA	2	6	2540341	2540346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13129	NC_010079	AAAG	2	8	2540414	2540421	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13130	NC_010079	TCT	2	6	2541755	2541760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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