MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus USA300_TCH1516 chromosome

Total Repeats: 14696

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_010079	TA	3	6	2182070	2182075	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11002	NC_010079	ATT	2	6	2182079	2182084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11003	NC_010079	TAATC	2	10	2182106	2182115	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
11004	NC_010079	TCT	2	6	2182238	2182243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11005	NC_010079	TA	3	6	2182291	2182296	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11006	NC_010079	ATAA	2	8	2182312	2182319	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11007	NC_010079	TTGTA	2	10	2182347	2182356	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
11008	NC_010079	ATTT	2	8	2184990	2184997	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11009	NC_010079	ATT	2	6	2185107	2185112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11010	NC_010079	AC	3	6	2185120	2185125	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11011	NC_010079	CAT	2	6	2185126	2185131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11012	NC_010079	ACT	2	6	2185153	2185158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11013	NC_010079	T	7	7	2185158	2185164	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11014	NC_010079	TCT	2	6	2185206	2185211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11015	NC_010079	ATT	2	6	2185220	2185225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11016	NC_010079	TAA	2	6	2185270	2185275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11017	NC_010079	TTAA	2	8	2185294	2185301	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11018	NC_010079	TAA	2	6	2185328	2185333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11019	NC_010079	TAA	2	6	2185377	2185382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11020	NC_010079	TTA	2	6	2186959	2186964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11021	NC_010079	CCA	2	6	2186996	2187001	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11022	NC_010079	ATT	2	6	2187016	2187021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11023	NC_010079	AAT	2	6	2187035	2187040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11024	NC_010079	TCT	2	6	2187047	2187052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11025	NC_010079	T	6	6	2187052	2187057	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11026	NC_010079	CCT	2	6	2188072	2188077	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11027	NC_010079	ATTT	2	8	2188134	2188141	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11029	NC_010079	A	8	8	2188199	2188206	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11030	NC_010079	A	6	6	2188232	2188237	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11031	NC_010079	TAA	2	6	2188255	2188260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11032	NC_010079	A	6	6	2188259	2188264	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11033	NC_010079	TTC	2	6	2188313	2188318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11034	NC_010079	ATT	2	6	2188343	2188348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11035	NC_010079	TTTA	2	8	2188377	2188384	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11036	NC_010079	ATA	2	6	2188401	2188406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11037	NC_010079	TTA	2	6	2188969	2188974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11038	NC_010079	TCC	2	6	2190181	2190186	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11039	NC_010079	A	6	6	2193155	2193160	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11040	NC_010079	ATTTT	2	10	2193185	2193194	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
11041	NC_010079	ATG	2	6	2193198	2193203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11042	NC_010079	TTC	2	6	2193240	2193245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11043	NC_010079	TTAA	2	8	2193266	2193273	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11044	NC_010079	ATG	2	6	2193324	2193329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11045	NC_010079	TCCT	2	8	2193914	2193921	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11046	NC_010079	AT	3	6	2197662	2197667	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11047	NC_010079	AAC	2	6	2197784	2197789	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11048	NC_010079	GA	3	6	2197798	2197803	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11049	NC_010079	TTA	2	6	2197825	2197830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11050	NC_010079	AAAT	2	8	2197856	2197863	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11051	NC_010079	GAA	2	6	2197882	2197887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11052	NC_010079	TAT	2	6	2197888	2197893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11053	NC_010079	TAAA	2	8	2201272	2201279	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11054	NC_010079	A	6	6	2201277	2201282	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11055	NC_010079	T	6	6	2201318	2201323	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11056	NC_010079	TTA	2	6	2201333	2201338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11057	NC_010079	T	6	6	2201375	2201380	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11058	NC_010079	TTTA	2	8	2201411	2201418	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11059	NC_010079	ATT	2	6	2201425	2201430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11060	NC_010079	TA	3	6	2201457	2201462	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11061	NC_010079	CAC	2	6	2201465	2201470	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11062	NC_010079	TGG	2	6	2201474	2201479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11063	NC_010079	ATT	2	6	2201581	2201586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11064	NC_010079	A	6	6	2201593	2201598	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11065	NC_010079	AAT	2	6	2203160	2203165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11066	NC_010079	TCA	2	6	2203223	2203228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11067	NC_010079	TA	3	6	2203234	2203239	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11068	NC_010079	ACC	2	6	2203242	2203247	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11069	NC_010079	A	7	7	2203248	2203254	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11070	NC_010079	TTA	2	6	2203285	2203290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11071	NC_010079	ATTG	2	8	2203302	2203309	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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11074	NC_010079	A	6	6	2203379	2203384	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11075	NC_010079	T	6	6	2203385	2203390	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11076	NC_010079	CAA	2	6	2203419	2203424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11079	NC_010079	ACT	2	6	2203499	2203504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11080	NC_010079	TA	3	6	2203508	2203513	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11081	NC_010079	GT	3	6	2203516	2203521	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11082	NC_010079	AAAAAG	2	12	2203568	2203579	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11083	NC_010079	AC	3	6	2203594	2203599	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11084	NC_010079	ACC	2	6	2203603	2203608	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11085	NC_010079	TCT	2	6	2203609	2203614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11087	NC_010079	AT	3	6	2206137	2206142	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11088	NC_010079	TA	3	6	2207687	2207692	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11089	NC_010079	CGT	2	6	2207702	2207707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11090	NC_010079	AT	3	6	2207722	2207727	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11091	NC_010079	ATA	2	6	2207740	2207745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11092	NC_010079	TA	3	6	2207802	2207807	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11093	NC_010079	A	6	6	2207838	2207843	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11094	NC_010079	ATC	2	6	2207847	2207852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11096	NC_010079	GT	3	6	2207878	2207883	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11097	NC_010079	TAC	2	6	2208098	2208103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11098	NC_010079	ATTT	2	8	2208123	2208130	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11099	NC_010079	TACTA	2	10	2208710	2208719	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
11100	NC_010079	GT	3	6	2208749	2208754	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11101	NC_010079	TAA	2	6	2208802	2208807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11102	NC_010079	TAC	2	6	2208812	2208817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11103	NC_010079	GAG	2	6	2210344	2210349	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11104	NC_010079	GTA	2	6	2211019	2211024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11105	NC_010079	TGA	2	6	2211025	2211030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11106	NC_010079	GTT	2	6	2211047	2211052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11107	NC_010079	TTGATG	2	12	2211302	2211313	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11108	NC_010079	ATG	2	6	2211363	2211368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11109	NC_010079	TGT	2	6	2211438	2211443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11110	NC_010079	TAT	2	6	2211461	2211466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11111	NC_010079	TTA	2	6	2211479	2211484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11112	NC_010079	TGA	2	6	2211546	2211551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11113	NC_010079	GAA	2	6	2211579	2211584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11114	NC_010079	TTA	2	6	2211596	2211601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11115	NC_010079	ATT	2	6	2211633	2211638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11116	NC_010079	CAG	2	6	2211650	2211655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11117	NC_010079	ATC	2	6	2211678	2211683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11118	NC_010079	CTG	2	6	2211687	2211692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11119	NC_010079	AAT	2	6	2211749	2211754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11120	NC_010079	ATT	2	6	2211800	2211805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11121	NC_010079	ATA	2	6	2212652	2212657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11122	NC_010079	GTA	2	6	2212671	2212676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11123	NC_010079	T	6	6	2212681	2212686	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11124	NC_010079	ATT	2	6	2212781	2212786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11125	NC_010079	A	7	7	2212787	2212793	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11126	NC_010079	ATT	2	6	2212892	2212897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11127	NC_010079	TA	3	6	2213027	2213032	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11128	NC_010079	AAT	2	6	2213090	2213095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11129	NC_010079	CAT	2	6	2213134	2213139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11130	NC_010079	CAT	3	9	2213188	2213196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11131	NC_010079	CAT	2	6	2213212	2213217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11132	NC_010079	TGA	2	6	2213220	2213225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11133	NC_010079	TGC	2	6	2213327	2213332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11134	NC_010079	AAATA	2	10	2213383	2213392	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11385	NC_010079	TAAA	2	8	2245353	2245360	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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