MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus USA300_TCH1516 chromosome

Total Repeats: 14696

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_010079	ATG	2	6	2000269	2000274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10002	NC_010079	GCT	2	6	2000275	2000280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10003	NC_010079	AT	3	6	2000334	2000339	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10004	NC_010079	TGG	2	6	2000354	2000359	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10005	NC_010079	AATT	2	8	2000419	2000426	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10006	NC_010079	AAT	2	6	2000495	2000500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10007	NC_010079	GA	3	6	2000533	2000538	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10008	NC_010079	TCGGT	2	10	2000610	2000619	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
10009	NC_010079	ACT	2	6	2000815	2000820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10010	NC_010079	AG	3	6	2000910	2000915	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10011	NC_010079	TCC	2	6	2000936	2000941	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10012	NC_010079	CGT	2	6	2000969	2000974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10013	NC_010079	AG	3	6	2000991	2000996	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10014	NC_010079	ACA	2	6	2000997	2001002	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10015	NC_010079	ATT	2	6	2001017	2001022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10016	NC_010079	CTT	2	6	2001025	2001030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10017	NC_010079	GAT	2	6	2001046	2001051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10018	NC_010079	GTC	2	6	2001061	2001066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10019	NC_010079	CAA	2	6	2001100	2001105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10020	NC_010079	TTG	2	6	2001112	2001117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10021	NC_010079	TCGC	2	8	2001136	2001143	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10022	NC_010079	CTA	2	6	2001146	2001151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10023	NC_010079	TTTTCT	2	12	2001163	2001174	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10024	NC_010079	TCC	2	6	2001175	2001180	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10025	NC_010079	CTTA	2	8	2001298	2001305	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10026	NC_010079	TCG	2	6	2001323	2001328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10027	NC_010079	TAA	2	6	2001381	2001386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10028	NC_010079	CCA	2	6	2001401	2001406	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10029	NC_010079	TTA	2	6	2001466	2001471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10030	NC_010079	ATT	2	6	2001502	2001507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10031	NC_010079	TACT	2	8	2001574	2001581	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10032	NC_010079	TGG	2	6	2001607	2001612	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10033	NC_010079	CCT	2	6	2001637	2001642	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10034	NC_010079	ATTAA	2	10	2001691	2001700	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10035	NC_010079	TGG	2	6	2001701	2001706	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10036	NC_010079	ACC	2	6	2001723	2001728	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10037	NC_010079	TGAA	2	8	2001785	2001792	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10038	NC_010079	TCT	2	6	2001835	2001840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10039	NC_010079	GAA	2	6	2001841	2001846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10040	NC_010079	AT	3	6	2001857	2001862	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10041	NC_010079	AGG	2	6	2001871	2001876	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10042	NC_010079	GTG	2	6	2001998	2002003	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10043	NC_010079	GT	3	6	2002013	2002018	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10044	NC_010079	AAC	2	6	2002117	2002122	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10045	NC_010079	GT	3	6	2002182	2002187	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10046	NC_010079	ATG	2	6	2002207	2002212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10047	NC_010079	TCC	2	6	2002233	2002238	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10048	NC_010079	ATG	2	6	2002277	2002282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10049	NC_010079	CACGA	2	10	2002332	2002341	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
10050	NC_010079	GAC	2	6	2002345	2002350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10051	NC_010079	CAC	2	6	2002358	2002363	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10052	NC_010079	TTC	2	6	2002435	2002440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10053	NC_010079	GCA	2	6	2002554	2002559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10054	NC_010079	TCC	2	6	2002699	2002704	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10055	NC_010079	A	6	6	2002820	2002825	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10056	NC_010079	CG	3	6	2002833	2002838	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10057	NC_010079	AAT	2	6	2002849	2002854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10058	NC_010079	GCT	2	6	2002889	2002894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10059	NC_010079	TTAC	2	8	2002947	2002954	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10060	NC_010079	TTC	2	6	2002962	2002967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10061	NC_010079	TAA	2	6	2002970	2002975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10062	NC_010079	TCA	2	6	2003000	2003005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10063	NC_010079	CTG	2	6	2003057	2003062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10064	NC_010079	TTACC	2	10	2003151	2003160	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
10065	NC_010079	TAGG	2	8	2003284	2003291	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10066	NC_010079	CCG	2	6	2003315	2003320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10067	NC_010079	AAGC	2	8	2003333	2003340	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10068	NC_010079	CGC	2	6	2003377	2003382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10069	NC_010079	ATG	2	6	2003425	2003430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10070	NC_010079	AAT	2	6	2003453	2003458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10071	NC_010079	ATT	2	6	2003577	2003582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10072	NC_010079	ATT	2	6	2003587	2003592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10073	NC_010079	A	6	6	2003601	2003606	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10074	NC_010079	AATT	2	8	2003622	2003629	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10075	NC_010079	CAA	2	6	2003630	2003635	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10076	NC_010079	ATT	2	6	2003638	2003643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10077	NC_010079	TTA	2	6	2003644	2003649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10078	NC_010079	TTA	2	6	2003686	2003691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10079	NC_010079	CAA	2	6	2003703	2003708	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10080	NC_010079	T	6	6	2003722	2003727	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10081	NC_010079	GAC	2	6	2003745	2003750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10082	NC_010079	TA	3	6	2003754	2003759	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10083	NC_010079	TAG	2	6	2003774	2003779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10085	NC_010079	ATT	2	6	2003830	2003835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10086	NC_010079	ACAA	2	8	2003898	2003905	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
10087	NC_010079	TAG	2	6	2003934	2003939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10088	NC_010079	TTTA	2	8	2003963	2003970	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10089	NC_010079	TTA	2	6	2003984	2003989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10090	NC_010079	TTCTT	2	10	2004017	2004026	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
10091	NC_010079	A	8	8	2004055	2004062	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10092	NC_010079	AAC	2	6	2004067	2004072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10093	NC_010079	CTT	2	6	2004088	2004093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10094	NC_010079	CTTA	2	8	2004104	2004111	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10095	NC_010079	T	6	6	2004130	2004135	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10096	NC_010079	TAC	2	6	2004145	2004150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10097	NC_010079	TCTT	2	8	2004619	2004626	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10098	NC_010079	ATA	2	6	2004629	2004634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10099	NC_010079	ATT	3	9	2004635	2004643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10100	NC_010079	GTA	2	6	2004663	2004668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10101	NC_010079	GC	3	6	2004671	2004676	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10102	NC_010079	ATG	2	6	2004691	2004696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10103	NC_010079	TTC	2	6	2006128	2006133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10105	NC_010079	ATTAA	2	10	2006171	2006180	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10106	NC_010079	TAG	2	6	2007537	2007542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10107	NC_010079	TTTTA	2	10	2007598	2007607	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10108	NC_010079	CTAA	2	8	2007630	2007637	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10109	NC_010079	TAT	2	6	2007657	2007662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10110	NC_010079	ATTT	2	8	2007668	2007675	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10111	NC_010079	AAC	2	6	2007677	2007682	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10112	NC_010079	AAATT	2	10	2008930	2008939	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10113	NC_010079	A	6	6	2008941	2008946	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10114	NC_010079	ATT	2	6	2008955	2008960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10115	NC_010079	CCA	2	6	2009004	2009009	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10116	NC_010079	AAC	2	6	2009050	2009055	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10117	NC_010079	C	6	6	2010805	2010810	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10118	NC_010079	CCTAT	2	10	2010822	2010831	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
10119	NC_010079	TTC	2	6	2010883	2010888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10120	NC_010079	TATTC	2	10	2010972	2010981	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
10121	NC_010079	CTT	2	6	2011032	2011037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10122	NC_010079	CAC	2	6	2011639	2011644	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10123	NC_010079	TAT	2	6	2011692	2011697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10124	NC_010079	TAC	2	6	2011728	2011733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10125	NC_010079	TAA	2	6	2011735	2011740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10126	NC_010079	TAC	2	6	2011764	2011769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10127	NC_010079	TA	3	6	2011798	2011803	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10129	NC_010079	TA	3	6	2011817	2011822	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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