MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus USA300_TCH1516 chromosome

Total Repeats: 14696

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_010079	TGAT	2	8	1221688	1221695	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6502	NC_010079	TAA	2	6	1221700	1221705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6503	NC_010079	A	6	6	1221724	1221729	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6504	NC_010079	ATG	3	9	1221751	1221759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6505	NC_010079	ATT	2	6	1225417	1225422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6506	NC_010079	TTA	2	6	1225588	1225593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6507	NC_010079	TACT	2	8	1225634	1225641	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6508	NC_010079	AAAC	2	8	1225665	1225672	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6509	NC_010079	TATC	2	8	1225742	1225749	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6510	NC_010079	ACT	2	6	1225759	1225764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6511	NC_010079	ATT	2	6	1225768	1225773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6512	NC_010079	ATAA	2	8	1225845	1225852	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6513	NC_010079	T	6	6	1225854	1225859	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6514	NC_010079	TATG	2	8	1225865	1225872	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6515	NC_010079	CAAA	2	8	1225884	1225891	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6516	NC_010079	TG	3	6	1226875	1226880	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6517	NC_010079	AAAT	2	8	1226883	1226890	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6518	NC_010079	TAC	2	6	1226895	1226900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6519	NC_010079	AAT	2	6	1226905	1226910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6520	NC_010079	AAT	3	9	1226914	1226922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6521	NC_010079	TAA	2	6	1226965	1226970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6522	NC_010079	ATA	2	6	1226992	1226997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6523	NC_010079	ATTT	2	8	1227014	1227021	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6524	NC_010079	TCA	2	6	1227052	1227057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6525	NC_010079	TAA	2	6	1227086	1227091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6526	NC_010079	TG	3	6	1227101	1227106	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6527	NC_010079	TAA	2	6	1227201	1227206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6528	NC_010079	ATAA	2	8	1227210	1227217	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6529	NC_010079	TTTC	2	8	1227233	1227240	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6530	NC_010079	TAT	2	6	1227282	1227287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6531	NC_010079	ATC	2	6	1227328	1227333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6532	NC_010079	TAT	2	6	1227391	1227396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6533	NC_010079	ATG	2	6	1227460	1227465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6534	NC_010079	AT	3	6	1227482	1227487	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6535	NC_010079	TGA	2	6	1227504	1227509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6536	NC_010079	GAG	2	6	1227518	1227523	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6537	NC_010079	TCA	2	6	1234179	1234184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6538	NC_010079	TA	3	6	1234255	1234260	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6539	NC_010079	ATA	2	6	1234281	1234286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6540	NC_010079	TAA	2	6	1236512	1236517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6541	NC_010079	TAA	2	6	1236533	1236538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6542	NC_010079	TAGA	2	8	1236550	1236557	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6543	NC_010079	ATA	3	9	1236567	1236575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6544	NC_010079	TAAT	2	8	1236590	1236597	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6545	NC_010079	TAT	2	6	1236616	1236621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6546	NC_010079	ATT	2	6	1236706	1236711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6549	NC_010079	T	6	6	1236845	1236850	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6550	NC_010079	AT	3	6	1236858	1236863	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6551	NC_010079	TTA	2	6	1236864	1236869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6552	NC_010079	T	6	6	1236918	1236923	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6553	NC_010079	TAG	2	6	1236980	1236985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6555	NC_010079	TAA	2	6	1237070	1237075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6558	NC_010079	TTAA	2	8	1237104	1237111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6559	NC_010079	AAT	2	6	1237141	1237146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6561	NC_010079	TGAA	2	8	1237232	1237239	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6562	NC_010079	TTTA	2	8	1237252	1237259	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6563	NC_010079	TAC	2	6	1237264	1237269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6565	NC_010079	AAT	2	6	1237391	1237396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6566	NC_010079	AAT	2	6	1237463	1237468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6572	NC_010079	ATAAA	2	10	1239664	1239673	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6596	NC_010079	GAGG	2	8	1251810	1251817	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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6602	NC_010079	TTA	2	6	1252049	1252054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6603	NC_010079	ACC	2	6	1252122	1252127	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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6609	NC_010079	ACA	2	6	1252211	1252216	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6610	NC_010079	A	6	6	1252216	1252221	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6611	NC_010079	GCA	2	6	1252234	1252239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6614	NC_010079	AGA	2	6	1252368	1252373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6615	NC_010079	CAG	2	6	1252400	1252405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6617	NC_010079	AAG	2	6	1252445	1252450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6618	NC_010079	GTG	3	9	1252592	1252600	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6619	NC_010079	TTCG	2	8	1252613	1252620	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6620	NC_010079	TTG	2	6	1252643	1252648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6621	NC_010079	CAA	2	6	1252750	1252755	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6622	NC_010079	GAT	2	6	1252819	1252824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6625	NC_010079	GAT	2	6	1252867	1252872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6627	NC_010079	AAG	2	6	1253057	1253062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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