MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shewanella baltica OS195 plasmid pS19503

Total Repeats: 151

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010000	ACG	2	6	50	55	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_010000	T	6	6	3495	3500	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010000	ACT	2	6	3507	3512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_010000	TTCG	2	8	3517	3524	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_010000	CTA	2	6	3555	3560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_010000	TGA	2	6	6797	6802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010000	ATA	2	6	7078	7083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010000	AATAA	2	10	7090	7099	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010000	A	7	7	7482	7488	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010000	GAA	2	6	8722	8727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010000	TCA	2	6	8756	8761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_010000	AGCA	2	8	8763	8770	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_010000	TAA	2	6	10705	10710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010000	TTA	2	6	10796	10801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010000	T	6	6	11117	11122	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010000	T	6	6	11156	11161	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010000	AAC	2	6	12380	12385	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_010000	AC	3	6	12389	12394	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_010000	GT	3	6	12397	12402	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010000	TA	3	6	12425	12430	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010000	TAT	2	6	12463	12468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010000	T	9	9	12515	12523	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010000	A	7	7	13626	13632	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010000	T	6	6	13665	13670	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010000	GGTA	2	8	13672	13679	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010000	ATT	2	6	13720	13725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010000	CAGC	2	8	13795	13802	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
28	NC_010000	CG	3	6	13889	13894	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_010000	A	7	7	14633	14639	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010000	GGAA	2	8	14648	14655	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010000	GCT	2	6	15726	15731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_010000	T	8	8	15770	15777	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010000	TAA	2	6	15789	15794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010000	ATA	2	6	15810	15815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010000	CAA	2	6	15858	15863	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_010000	AAT	2	6	15912	15917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010000	TGA	2	6	16159	16164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010000	CAT	3	9	16172	16180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_010000	A	8	8	16226	16233	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010000	TAGC	2	8	17307	17314	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_010000	CTAG	2	8	17348	17355	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_010000	TAGC	2	8	17372	17379	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_010000	TAG	2	6	17389	17394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010000	TAGC	2	8	17396	17403	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_010000	TAT	2	6	17425	17430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010000	ACT	2	6	17547	17552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_010000	AGC	2	6	17585	17590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_010000	TGA	2	6	17601	17606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010000	AT	3	6	17674	17679	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010000	A	6	6	17691	17696	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010000	AAT	2	6	17792	17797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010000	AAT	2	6	17808	17813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010000	TAA	2	6	17892	17897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010000	ATC	2	6	17939	17944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_010000	TGATT	2	10	18027	18036	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010000	T	6	6	18103	18108	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010000	GCA	2	6	18125	18130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_010000	GCT	2	6	18172	18177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_010000	TCA	2	6	18211	18216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_010000	AACT	2	8	18309	18316	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_010000	T	9	9	18323	18331	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010000	TTA	2	6	18343	18348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010000	AAAG	2	8	18350	18357	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010000	CAATC	2	10	18381	18390	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
65	NC_010000	TAA	2	6	18432	18437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010000	TGAT	2	8	18495	18502	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010000	GAA	2	6	18507	18512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010000	GGC	2	6	19509	19514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_010000	GTATCT	2	12	19522	19533	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_010000	TGC	2	6	19550	19555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_010000	TTTG	2	8	19584	19591	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010000	AAACG	2	10	19649	19658	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
73	NC_010000	A	6	6	19703	19708	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010000	T	6	6	19732	19737	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010000	AC	3	6	19770	19775	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_010000	TAAC	2	8	19805	19812	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_010000	TGC	2	6	19838	19843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_010000	T	9	9	19885	19893	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010000	ACC	2	6	19924	19929	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_010000	ATTGC	2	10	20011	20020	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
81	NC_010000	T	6	6	20028	20033	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010000	A	6	6	20078	20083	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010000	TGA	2	6	20094	20099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010000	A	6	6	20119	20124	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010000	TTA	2	6	20126	20131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010000	T	7	7	20237	20243	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010000	CAG	2	6	20258	20263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_010000	AAC	2	6	20317	20322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_010000	C	6	6	20443	20448	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
90	NC_010000	TAG	2	6	20456	20461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_010000	TGG	2	6	20518	20523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010000	CTA	2	6	20537	20542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_010000	ATT	2	6	20557	20562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010000	GTAAA	2	10	20603	20612	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010000	ACA	2	6	20663	20668	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_010000	TC	3	6	20674	20679	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_010000	AATT	2	8	20682	20689	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010000	G	6	6	20761	20766	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
99	NC_010000	CTC	2	6	20772	20777	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_010000	CAAA	2	8	20787	20794	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_010000	CAAT	2	8	20809	20816	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_010000	TTAA	2	8	20817	20824	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_010000	AAAAC	2	10	20852	20861	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
104	NC_010000	AAC	2	6	20920	20925	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_010000	AC	3	6	21011	21016	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_010000	GTG	2	6	21186	21191	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_010000	TGG	2	6	21230	21235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010000	GGT	2	6	21285	21290	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010000	ATC	2	6	21351	21356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_010000	GGC	2	6	21367	21372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_010000	TGA	2	6	21377	21382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_010000	TAAA	2	8	21426	21433	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_010000	ACA	2	6	21455	21460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_010000	TATT	2	8	21462	21469	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_010000	TTA	2	6	21473	21478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_010000	TTA	2	6	21481	21486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010000	TTA	2	6	21551	21556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010000	ACA	2	6	21583	21588	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_010000	ATCA	2	8	21595	21602	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_010000	AAT	2	6	22539	22544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_010000	ATC	2	6	22875	22880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_010000	ATT	2	6	22974	22979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_010000	CATT	2	8	23017	23024	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_010000	TGT	2	6	23035	23040	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_010000	AAT	2	6	23066	23071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010000	C	6	6	23135	23140	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
127	NC_010000	ATT	2	6	23155	23160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_010000	ATAC	2	8	25616	25623	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_010000	TGG	2	6	27734	27739	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_010000	C	6	6	31095	31100	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
131	NC_010000	TA	3	6	31102	31107	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_010000	A	7	7	31157	31163	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_010000	CA	3	6	37777	37782	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_010000	TTTAT	2	10	37838	37847	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_010000	A	6	6	37850	37855	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_010000	C	7	7	40607	40613	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
137	NC_010000	AATA	2	8	40614	40621	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_010000	TAAA	2	8	40625	40632	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_010000	ATTT	2	8	40636	40643	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_010000	T	7	7	40758	40764	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_010000	AAAC	2	8	40786	40793	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_010000	TAA	2	6	40807	40812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_010000	AAG	2	6	40819	40824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_010000	AAC	2	6	40864	40869	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_010000	CAACA	2	10	42971	42980	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
146	NC_010000	A	6	6	43005	43010	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_010000	TTA	2	6	43160	43165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_010000	TCA	2	6	43180	43185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_010000	TTC	2	6	43208	43213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_010000	AG	3	6	43254	43259	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_010000	A	6	6	44603	44608	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.