MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salinispora arenicola CNS-205 chromosome

Total Repeats: 19266

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009953	GTAC	2	8	4	11	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_009953	CGGT	2	8	42	49	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3	NC_009953	CCG	2	6	65	70	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_009953	CGG	2	6	108	113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_009953	ACG	2	6	142	147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_009953	CCGGA	2	10	1978	1987	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
7	NC_009953	GCC	2	6	1993	1998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_009953	CGC	2	6	2049	2054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_009953	CGC	2	6	2060	2065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_009953	GTCC	2	8	2094	2101	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_009953	GCAC	2	8	2260	2267	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_009953	ATC	2	6	2414	2419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_009953	CGA	2	6	2465	2470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_009953	TCT	2	6	2486	2491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_009953	ACA	2	6	2495	2500	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_009953	ATC	2	6	2508	2513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_009953	ACC	2	6	2545	2550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_009953	TCG	2	6	2560	2565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_009953	CG	3	6	2606	2611	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_009953	GGC	2	6	2642	2647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_009953	TCGG	2	8	2648	2655	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_009953	GA	3	6	2669	2674	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009953	CGA	2	6	3846	3851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_009953	ACG	2	6	3855	3860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_009953	C	6	6	4760	4765	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
26	NC_009953	CCGG	2	8	7119	7126	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_009953	TCG	2	6	7145	7150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_009953	GC	3	6	7169	7174	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_009953	GCC	2	6	7179	7184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_009953	G	6	6	7220	7225	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009953	CGGC	2	8	7244	7251	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_009953	GCC	2	6	7265	7270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_009953	GTG	2	6	7287	7292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009953	GTC	2	6	7298	7303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_009953	ATC	2	6	7379	7384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_009953	CGG	2	6	7427	7432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_009953	CG	3	6	7478	7483	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_009953	CCG	2	6	7503	7508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_009953	CGTGG	2	10	7530	7539	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
40	NC_009953	CGT	2	6	9533	9538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_009953	CGA	2	6	13101	13106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_009953	CCG	2	6	13122	13127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_009953	GGCCG	2	10	13165	13174	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
44	NC_009953	TCG	2	6	13190	13195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_009953	G	6	6	13202	13207	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009953	CCG	2	6	13284	13289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_009953	GGA	2	6	13322	13327	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009953	CG	3	6	13502	13507	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_009953	GTC	2	6	13528	13533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_009953	GCGTG	2	10	13616	13625	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
51	NC_009953	TGA	2	6	13628	13633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009953	CA	3	6	13667	13672	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_009953	GT	3	6	13702	13707	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009953	GCCA	2	8	13920	13927	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
55	NC_009953	CG	4	8	13948	13955	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_009953	ACA	2	6	13969	13974	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_009953	GTG	2	6	13998	14003	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009953	GGC	2	6	14026	14031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_009953	CCG	2	6	14032	14037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_009953	CGG	2	6	14048	14053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_009953	CGC	2	6	14056	14061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_009953	ACC	2	6	15296	15301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_009953	GC	3	6	15347	15352	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_009953	CGAA	2	8	15428	15435	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_009953	CCG	2	6	15449	15454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_009953	CCG	2	6	15961	15966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_009953	CCA	2	6	15967	15972	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_009953	ATCCGG	2	12	16034	16045	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_009953	GCC	2	6	16099	16104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_009953	CGG	2	6	16122	16127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_009953	GTG	2	6	16157	16162	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009953	CTA	2	6	16193	16198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_009953	GGT	2	6	16206	16211	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009953	GCG	2	6	16250	16255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_009953	CCCCA	2	10	16289	16298	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
76	NC_009953	CCG	2	6	16300	16305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_009953	ACG	2	6	17440	17445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_009953	CCCG	2	8	17452	17459	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
79	NC_009953	GTC	2	6	17486	17491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_009953	ACG	2	6	17494	17499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_009953	CGC	2	6	17534	17539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_009953	TGG	2	6	17597	17602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009953	GTG	3	9	18007	18015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009953	GGT	2	6	18022	18027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009953	ACC	2	6	18710	18715	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_009953	GCCG	2	8	18765	18772	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87	NC_009953	CGACAC	2	12	18774	18785	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
88	NC_009953	CGG	2	6	18791	18796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_009953	ACCG	2	8	18925	18932	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
90	NC_009953	GCG	2	6	18950	18955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_009953	GTG	2	6	19018	19023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009953	CCA	2	6	19045	19050	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_009953	GCA	2	6	19053	19058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_009953	GGA	2	6	20251	20256	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009953	TG	3	6	20301	20306	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009953	CTTG	2	8	20310	20317	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_009953	TCC	2	6	20398	20403	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_009953	CGA	2	6	20522	20527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_009953	CG	3	6	20609	20614	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100	NC_009953	TCG	2	6	20637	20642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_009953	GTG	2	6	20661	20666	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009953	GCCCC	2	10	20759	20768	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
103	NC_009953	TGG	2	6	20770	20775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009953	GGCT	2	8	20783	20790	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
105	NC_009953	GGGC	2	8	20791	20798	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
106	NC_009953	AGGT	2	8	20837	20844	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009953	GGC	2	6	21032	21037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_009953	CCA	2	6	21120	21125	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_009953	CGAT	2	8	21196	21203	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_009953	CCA	2	6	21220	21225	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_009953	CTGT	2	8	21231	21238	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_009953	CGTGC	3	15	21239	21253	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
113	NC_009953	CGC	2	6	21289	21294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_009953	GTC	2	6	21296	21301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_009953	CGT	2	6	21325	21330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_009953	TCG	2	6	21338	21343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_009953	CGC	2	6	24124	24129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_009953	GCG	2	6	25089	25094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_009953	GCCG	2	8	25099	25106	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120	NC_009953	GTCG	2	8	25132	25139	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
121	NC_009953	GCC	2	6	25140	25145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_009953	ACG	2	6	29694	29699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_009953	GCT	2	6	29730	29735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_009953	CCG	2	6	29737	29742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_009953	GT	3	6	29766	29771	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009953	CGG	2	6	29774	29779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_009953	CCCG	2	8	29788	29795	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
128	NC_009953	CCGT	2	8	29797	29804	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
129	NC_009953	CTG	2	6	29812	29817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_009953	CCG	2	6	30205	30210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_009953	CGG	2	6	30233	30238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_009953	GCG	2	6	30263	30268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_009953	GGAC	2	8	30286	30293	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
134	NC_009953	CGG	2	6	30504	30509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_009953	TGCC	2	8	30516	30523	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
136	NC_009953	TCG	2	6	30549	30554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_009953	TGT	2	6	30556	30561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009953	ATG	2	6	30574	30579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009953	TCG	2	6	30581	30586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_009953	GGT	2	6	31742	31747	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
141	NC_009953	CGC	2	6	31785	31790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
142	NC_009953	CAC	2	6	31792	31797	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
143	NC_009953	TCC	2	6	32254	32259	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
144	NC_009953	ACCT	2	8	32311	32318	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_009953	GTCC	2	8	32353	32360	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
146	NC_009953	CCG	2	6	32384	32389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
147	NC_009953	CAC	2	6	32404	32409	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
148	NC_009953	CAGG	2	8	32443	32450	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
149	NC_009953	GGC	2	6	32467	32472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_009953	GCCC	2	8	33276	33283	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
151	NC_009953	GCCG	2	8	33322	33329	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
152	NC_009953	GAC	2	6	34258	34263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_009953	GAC	2	6	34287	34292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_009953	TCC	3	9	35576	35584	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
155	NC_009953	GCT	2	6	35688	35693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
156	NC_009953	GGT	2	6	35765	35770	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
157	NC_009953	GT	3	6	35785	35790	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
158	NC_009953	GCCG	2	8	35828	35835	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
159	NC_009953	GCA	2	6	35863	35868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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161	NC_009953	GGA	2	6	36589	36594	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
162	NC_009953	TCG	2	6	37943	37948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
163	NC_009953	GGT	2	6	37950	37955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
164	NC_009953	GTG	2	6	37969	37974	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
165	NC_009953	TGG	2	6	38034	38039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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169	NC_009953	GCC	2	6	39088	39093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
170	NC_009953	GTG	2	6	39148	39153	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
171	NC_009953	GC	3	6	39199	39204	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
172	NC_009953	GCG	2	6	39215	39220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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175	NC_009953	AGG	2	6	40817	40822	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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180	NC_009953	CGG	2	6	44673	44678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
181	NC_009953	TGGG	2	8	44690	44697	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
182	NC_009953	GCGA	2	8	44714	44721	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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184	NC_009953	CGG	2	6	44799	44804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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186	NC_009953	CTAT	2	8	44840	44847	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
187	NC_009953	CGC	2	6	44910	44915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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189	NC_009953	GCG	2	6	44925	44930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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191	NC_009953	GCCGGT	2	12	44997	45008	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
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194	NC_009953	CGGC	2	8	45269	45276	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
195	NC_009953	TCG	2	6	46868	46873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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262	NC_009953	TCAT	2	8	75016	75023	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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280	NC_009953	TCC	2	6	76380	76385	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
281	NC_009953	GC	4	8	76392	76399	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
282	NC_009953	GCC	2	6	76416	76421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
283	NC_009953	CAG	2	6	76534	76539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
284	NC_009953	GCGG	2	8	76540	76547	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
285	NC_009953	GCCGA	2	10	76590	76599	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
286	NC_009953	CCG	2	6	76605	76610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
287	NC_009953	GGCCC	2	10	76624	76633	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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431	NC_009953	CGT	2	6	110475	110480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
432	NC_009953	TGT	2	6	110513	110518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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453	NC_009953	CGG	2	6	110965	110970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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463	NC_009953	AGT	2	6	114256	114261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
464	NC_009953	GAT	2	6	114262	114267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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467	NC_009953	AGA	2	6	115781	115786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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