MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Shewanella sediminis HAW-EB3 chromosome

Total Repeats: 17456

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009831	AAATT	2	10	4	13	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009831	TAA	2	6	14	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009831	T	6	6	29	34	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009831	CTTT	2	8	114	121	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_009831	TTG	2	6	125	130	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009831	AT	3	6	131	136	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009831	T	6	6	257	262	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009831	GAT	2	6	270	275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009831	ATTT	2	8	354	361	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009831	AGCGC	2	10	450	459	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
11	NC_009831	TA	3	6	1933	1938	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009831	A	6	6	1943	1948	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009831	GTTA	2	8	4387	4394	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009831	A	6	6	4429	4434	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009831	CAA	2	6	4469	4474	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_009831	AATT	2	8	4505	4512	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009831	GATC	2	8	4621	4628	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_009831	TAA	2	6	4638	4643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009831	AAT	2	6	4667	4672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009831	GAT	2	6	4715	4720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009831	TAT	2	6	4738	4743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009831	ATC	2	6	4754	4759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_009831	CT	3	6	4780	4785	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_009831	TG	3	6	4787	4792	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009831	A	6	6	7330	7335	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009831	CA	3	6	7336	7341	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_009831	T	7	7	7368	7374	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009831	AGG	2	6	7401	7406	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009831	TCT	2	6	7505	7510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_009831	GA	3	6	11199	11204	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009831	T	6	6	11213	11218	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009831	AAG	2	6	11405	11410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009831	ATG	2	6	11515	11520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009831	GCAT	2	8	11561	11568	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_009831	ATT	2	6	12343	12348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009831	CTT	2	6	12352	12357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_009831	CAGC	2	8	12433	12440	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
38	NC_009831	CTT	2	6	14178	14183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_009831	AGTT	2	8	14198	14205	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009831	TCG	2	6	14216	14221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_009831	AGTA	2	8	14233	14240	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009831	ACC	2	6	14281	14286	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_009831	TAG	2	6	14339	14344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009831	TC	3	6	14465	14470	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_009831	TCG	2	6	18751	18756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_009831	CTA	2	6	18763	18768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_009831	GAT	2	6	18782	18787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009831	CTTT	2	8	18794	18801	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_009831	A	6	6	18838	18843	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009831	T	6	6	18886	18891	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009831	CA	3	6	18894	18899	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_009831	A	7	7	20779	20785	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009831	TTTTA	2	10	20808	20817	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009831	TCTA	2	8	20840	20847	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_009831	ATT	2	6	20872	20877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009831	T	6	6	20876	20881	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009831	A	6	6	20894	20899	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009831	T	6	6	20918	20923	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009831	TA	3	6	24255	24260	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009831	TAT	2	6	24275	24280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009831	GT	3	6	24315	24320	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009831	T	6	6	24324	24329	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009831	TGCTC	2	10	24857	24866	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
64	NC_009831	TTA	2	6	25809	25814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009831	TCT	2	6	25909	25914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_009831	AGA	2	6	26008	26013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009831	TCT	2	6	26036	26041	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_009831	ACTTA	2	10	26043	26052	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_009831	TTCC	2	8	27244	27251	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_009831	ATC	2	6	29455	29460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_009831	ACA	2	6	29550	29555	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_009831	CAT	2	6	29559	29564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_009831	ACA	2	6	29607	29612	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_009831	TAA	2	6	29743	29748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009831	GAC	2	6	31939	31944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_009831	GGA	2	6	33449	33454	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009831	AAT	2	6	34047	34052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009831	AT	3	6	34080	34085	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009831	AAT	2	6	34548	34553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009831	GAGCTA	2	12	34597	34608	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_009831	TTA	2	6	34630	34635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009831	TAGC	2	8	35248	35255	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_009831	TTG	2	6	35311	35316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009831	CGC	2	6	35381	35386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_009831	GCA	2	6	35412	35417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_009831	T	6	6	35459	35464	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009831	CTT	2	6	35478	35483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_009831	GAAT	2	8	35521	35528	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009831	TTC	2	6	35701	35706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_009831	TCG	2	6	36226	36231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_009831	GGT	2	6	36285	36290	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009831	TTCT	2	8	36332	36339	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_009831	GA	3	6	36383	36388	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009831	TGG	2	6	36422	36427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009831	GCG	2	6	36464	36469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_009831	AAG	2	6	45161	45166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009831	CCT	2	6	45178	45183	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_009831	T	6	6	45183	45188	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009831	ATGG	2	8	45217	45224	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009831	CTT	2	6	45249	45254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_009831	TCC	2	6	45314	45319	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_009831	GTG	2	6	47890	47895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009831	ATAG	2	8	48500	48507	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009831	ATA	2	6	48512	48517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009831	TAT	2	6	49532	49537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009831	A	6	6	49587	49592	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009831	AAT	2	6	49597	49602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009831	CCCA	2	8	49664	49671	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
109	NC_009831	ACA	2	6	51472	51477	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_009831	ATA	2	6	51484	51489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009831	CAA	2	6	51594	51599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_009831	A	6	6	51656	51661	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009831	CCAA	2	8	51672	51679	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_009831	CCT	2	6	51697	51702	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_009831	TG	3	6	51782	51787	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009831	TTC	2	6	51895	51900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_009831	CAA	2	6	51949	51954	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_009831	GGC	2	6	51997	52002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_009831	GCG	2	6	52059	52064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_009831	AGG	2	6	52154	52159	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009831	TAG	2	6	52206	52211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009831	CGA	2	6	52234	52239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_009831	GAT	2	6	52259	52264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009831	GCA	2	6	52308	52313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_009831	GT	3	6	52361	52366	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009831	GAA	2	6	52367	52372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009831	GAG	2	6	52401	52406	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009831	AGGT	2	8	52410	52417	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009831	TAA	2	6	52421	52426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009831	TGCT	2	8	52428	52435	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
131	NC_009831	AGA	2	6	52450	52455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009831	CAG	2	6	52476	52481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_009831	G	6	6	52623	52628	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009831	GGC	2	6	52687	52692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_009831	GAA	2	6	52930	52935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009831	TGC	2	6	53006	53011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_009831	GTC	2	6	53018	53023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_009831	CCTTAT	2	12	53070	53081	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_009831	TGG	2	6	53096	53101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
140	NC_009831	GGA	2	6	53132	53137	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
141	NC_009831	GAC	2	6	53145	53150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_009831	TCA	2	6	53157	53162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_009831	AC	3	6	53183	53188	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_009831	AC	3	6	53352	53357	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_009831	CCT	2	6	53495	53500	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
146	NC_009831	TGTT	2	8	53521	53528	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_009831	CA	3	6	53536	53541	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_009831	CTTGTT	2	12	53547	53558	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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