MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shewanella sediminis HAW-EB3 chromosome

Total Repeats: 17456

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_009831	TG	3	6	3253984	3253989	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10502	NC_009831	TTAA	2	8	3254037	3254044	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10503	NC_009831	TTA	2	6	3254048	3254053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10504	NC_009831	TAAT	2	8	3254063	3254070	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10505	NC_009831	TTA	2	6	3254103	3254108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10506	NC_009831	TGAT	2	8	3254214	3254221	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10507	NC_009831	AT	3	6	3254265	3254270	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10508	NC_009831	ATA	2	6	3254294	3254299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10509	NC_009831	T	8	8	3256478	3256485	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10510	NC_009831	TTA	2	6	3257797	3257802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10511	NC_009831	ACAA	2	8	3257805	3257812	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
10512	NC_009831	A	6	6	3257827	3257832	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10513	NC_009831	T	6	6	3257859	3257864	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10514	NC_009831	TTTTAT	2	12	3259744	3259755	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10515	NC_009831	TTA	2	6	3259837	3259842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10516	NC_009831	GTTT	2	8	3259879	3259886	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
10517	NC_009831	GAA	2	6	3259991	3259996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10518	NC_009831	T	6	6	3260934	3260939	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10519	NC_009831	GAT	2	6	3261021	3261026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10520	NC_009831	TGC	2	6	3261111	3261116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10521	NC_009831	AAC	2	6	3261137	3261142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10522	NC_009831	ATT	2	6	3261324	3261329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10523	NC_009831	CAAT	2	8	3261364	3261371	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10524	NC_009831	GATT	2	8	3265012	3265019	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10525	NC_009831	TA	3	6	3265041	3265046	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10526	NC_009831	ATA	2	6	3265056	3265061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10527	NC_009831	A	7	7	3265082	3265088	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10528	NC_009831	ATA	2	6	3265119	3265124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10529	NC_009831	CTGA	2	8	3265151	3265158	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10530	NC_009831	TCGGT	2	10	3265386	3265395	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
10531	NC_009831	ATC	2	6	3265739	3265744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10533	NC_009831	TA	3	6	3265912	3265917	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10534	NC_009831	TAA	2	6	3265972	3265977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10535	NC_009831	CATT	2	8	3265990	3265997	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10536	NC_009831	GGCA	2	8	3266009	3266016	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10537	NC_009831	CTAAAG	2	12	3267366	3267377	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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10541	NC_009831	TAA	2	6	3268574	3268579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10542	NC_009831	GCA	3	9	3268586	3268594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10543	NC_009831	CA	3	6	3268628	3268633	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10544	NC_009831	CAG	2	6	3268680	3268685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10546	NC_009831	GGGTT	2	10	3268827	3268836	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
10547	NC_009831	GTTT	2	8	3268859	3268866	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
10548	NC_009831	TTGC	2	8	3268896	3268903	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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10554	NC_009831	TAAT	2	8	3270978	3270985	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10555	NC_009831	TTG	2	6	3271013	3271018	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10556	NC_009831	GTAG	2	8	3272158	3272165	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10557	NC_009831	TGC	2	6	3273920	3273925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10560	NC_009831	GCA	2	6	3274013	3274018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10561	NC_009831	T	7	7	3274032	3274038	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10562	NC_009831	TA	3	6	3274050	3274055	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10563	NC_009831	AAT	2	6	3274076	3274081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10564	NC_009831	TTG	2	6	3274174	3274179	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10565	NC_009831	T	7	7	3274181	3274187	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10566	NC_009831	ATT	2	6	3274233	3274238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10579	NC_009831	C	6	6	3277259	3277264	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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10593	NC_009831	TCA	2	6	3279345	3279350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10598	NC_009831	AT	3	6	3280474	3280479	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10599	NC_009831	GCTAT	2	10	3280591	3280600	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
10600	NC_009831	TTC	2	6	3280604	3280609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10602	NC_009831	CTT	2	6	3280628	3280633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10603	NC_009831	T	7	7	3280639	3280645	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10607	NC_009831	TAA	2	6	3281877	3281882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10608	NC_009831	CCT	2	6	3281943	3281948	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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10610	NC_009831	AACTT	2	10	3282594	3282603	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
10611	NC_009831	AAG	2	6	3283107	3283112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10612	NC_009831	AAG	2	6	3283118	3283123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10613	NC_009831	TC	4	8	3283140	3283147	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10614	NC_009831	TAGG	2	8	3283469	3283476	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10615	NC_009831	CCT	2	6	3283557	3283562	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10616	NC_009831	TGGG	2	8	3283623	3283630	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
10617	NC_009831	ATTA	2	8	3283633	3283640	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10618	NC_009831	AT	3	6	3283690	3283695	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10621	NC_009831	ATTCCA	2	12	3286505	3286516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10623	NC_009831	CTC	2	6	3291066	3291071	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10624	NC_009831	CA	3	6	3291083	3291088	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10625	NC_009831	TCT	2	6	3291104	3291109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10626	NC_009831	CT	4	8	3291114	3291121	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10627	NC_009831	T	6	6	3291186	3291191	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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