MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shewanella sediminis HAW-EB3 chromosome

Total Repeats: 17456

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10002	NC_009831	CAA	2	6	3106813	3106818	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10003	NC_009831	T	6	6	3106819	3106824	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10004	NC_009831	ATT	2	6	3106829	3106834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10005	NC_009831	GAA	2	6	3106854	3106859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10006	NC_009831	ATT	2	6	3106894	3106899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10007	NC_009831	TCT	2	6	3106919	3106924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10008	NC_009831	AT	3	6	3107016	3107021	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10009	NC_009831	GGT	2	6	3107033	3107038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10010	NC_009831	TGTA	2	8	3107218	3107225	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10011	NC_009831	GCT	2	6	3107228	3107233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10012	NC_009831	CGCC	2	8	3107289	3107296	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10013	NC_009831	TTA	2	6	3107310	3107315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10014	NC_009831	CGCC	2	8	3108173	3108180	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10015	NC_009831	TTA	2	6	3108195	3108200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10016	NC_009831	TC	3	6	3108554	3108559	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10017	NC_009831	AAT	2	6	3108620	3108625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10018	NC_009831	AGC	2	6	3108748	3108753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10019	NC_009831	TCC	2	6	3108809	3108814	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10020	NC_009831	ATG	2	6	3108851	3108856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10021	NC_009831	GAAA	2	8	3108942	3108949	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10022	NC_009831	AGG	2	6	3109097	3109102	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10023	NC_009831	ATG	2	6	3109129	3109134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10024	NC_009831	GTT	2	6	3109144	3109149	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10025	NC_009831	GAT	2	6	3109196	3109201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10027	NC_009831	AGG	2	6	3110777	3110782	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10028	NC_009831	GCC	2	6	3110802	3110807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10029	NC_009831	A	6	6	3110836	3110841	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10030	NC_009831	GAGTT	2	10	3110900	3110909	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
10031	NC_009831	CTT	2	6	3113388	3113393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10032	NC_009831	GAC	2	6	3113429	3113434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10033	NC_009831	AGGG	2	8	3113491	3113498	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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10035	NC_009831	TGAA	2	8	3113543	3113550	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10036	NC_009831	T	7	7	3113603	3113609	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10037	NC_009831	T	6	6	3113629	3113634	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10038	NC_009831	AT	3	6	3114541	3114546	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10039	NC_009831	AAC	2	6	3114563	3114568	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10040	NC_009831	A	8	8	3114599	3114606	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10041	NC_009831	A	6	6	3115156	3115161	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10042	NC_009831	TGT	2	6	3116126	3116131	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10043	NC_009831	AAT	2	6	3116134	3116139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10044	NC_009831	TTAAA	2	10	3116153	3116162	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10045	NC_009831	TTA	2	6	3116185	3116190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10046	NC_009831	TAT	3	9	3116202	3116210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10047	NC_009831	TCATTA	2	12	3117000	3117011	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10048	NC_009831	AACCA	2	10	3117027	3117036	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
10049	NC_009831	TA	3	6	3117050	3117055	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10050	NC_009831	GCC	2	6	3117109	3117114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10051	NC_009831	GA	3	6	3117121	3117126	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10052	NC_009831	TAT	2	6	3117178	3117183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10054	NC_009831	AGG	2	6	3117254	3117259	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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10057	NC_009831	ACT	2	6	3117452	3117457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10059	NC_009831	TGT	2	6	3117518	3117523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10060	NC_009831	A	6	6	3117527	3117532	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10061	NC_009831	TGAA	2	8	3117608	3117615	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10062	NC_009831	GCC	2	6	3117680	3117685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10063	NC_009831	TAGTCA	2	12	3117738	3117749	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10064	NC_009831	CGG	2	6	3121515	3121520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10065	NC_009831	AT	3	6	3121543	3121548	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10066	NC_009831	GTT	2	6	3121628	3121633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10067	NC_009831	GTTT	2	8	3121669	3121676	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
10068	NC_009831	CTTTG	2	10	3121722	3121731	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
10069	NC_009831	ATC	2	6	3121784	3121789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10071	NC_009831	AACC	2	8	3121860	3121867	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10072	NC_009831	ATA	3	9	3121893	3121901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10073	NC_009831	GTA	2	6	3121940	3121945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10074	NC_009831	GAAA	2	8	3122084	3122091	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10075	NC_009831	TCT	2	6	3123091	3123096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10077	NC_009831	ACAG	2	8	3123263	3123270	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10078	NC_009831	TGT	2	6	3123282	3123287	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10079	NC_009831	T	6	6	3123392	3123397	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10080	NC_009831	TAATA	2	10	3123409	3123418	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10081	NC_009831	AG	3	6	3123430	3123435	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10082	NC_009831	AGCTG	2	10	3123440	3123449	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
10083	NC_009831	TA	3	6	3123453	3123458	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10084	NC_009831	ACA	2	6	3123532	3123537	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10085	NC_009831	TGA	2	6	3123972	3123977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10087	NC_009831	AAT	2	6	3124068	3124073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10088	NC_009831	CTGA	2	8	3124097	3124104	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10089	NC_009831	TTA	2	6	3124175	3124180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10091	NC_009831	TAAA	2	8	3124767	3124774	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10092	NC_009831	G	6	6	3124786	3124791	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10093	NC_009831	CAAGCC	2	12	3125235	3125246	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
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10095	NC_009831	CT	3	6	3126189	3126194	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10096	NC_009831	AT	3	6	3126197	3126202	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10097	NC_009831	CCAT	2	8	3126981	3126988	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10098	NC_009831	ATG	2	6	3127161	3127166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10100	NC_009831	CAG	2	6	3127207	3127212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10102	NC_009831	GAG	2	6	3128880	3128885	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10103	NC_009831	AAGC	2	8	3128893	3128900	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10104	NC_009831	CAA	2	6	3128966	3128971	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10105	NC_009831	ATA	2	6	3129003	3129008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10106	NC_009831	TAAA	2	8	3129017	3129024	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10107	NC_009831	GGT	2	6	3129122	3129127	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10108	NC_009831	CAC	2	6	3129130	3129135	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10109	NC_009831	T	6	6	3129162	3129167	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10110	NC_009831	GCG	2	6	3129182	3129187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10111	NC_009831	ATC	2	6	3129192	3129197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10112	NC_009831	T	6	6	3129276	3129281	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10113	NC_009831	TTG	2	6	3129307	3129312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10114	NC_009831	TAAC	2	8	3129370	3129377	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10115	NC_009831	A	6	6	3129415	3129420	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10116	NC_009831	TCAA	2	8	3129428	3129435	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10117	NC_009831	TCAA	2	8	3129443	3129450	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10118	NC_009831	CTC	2	6	3130865	3130870	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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10121	NC_009831	T	6	6	3131455	3131460	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10122	NC_009831	AAT	2	6	3131584	3131589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10123	NC_009831	A	6	6	3131596	3131601	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10124	NC_009831	ACA	2	6	3131774	3131779	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10125	NC_009831	AAT	2	6	3131807	3131812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10126	NC_009831	CTG	2	6	3131834	3131839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10128	NC_009831	CGTT	2	8	3132729	3132736	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10129	NC_009831	TCA	2	6	3133164	3133169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10395	NC_009831	AT	3	6	3228153	3228158	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10396	NC_009831	AAC	2	6	3228252	3228257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10397	NC_009831	AGGA	2	8	3228273	3228280	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10398	NC_009831	CAT	2	6	3229136	3229141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10399	NC_009831	GCGATG	2	12	3229148	3229159	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
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10402	NC_009831	TTC	2	6	3230631	3230636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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