MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shewanella sediminis HAW-EB3 chromosome

Total Repeats: 17456

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_009831	ATG	2	6	2484988	2484993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8002	NC_009831	TAA	2	6	2485027	2485032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8003	NC_009831	TAA	2	6	2485052	2485057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8004	NC_009831	GA	3	6	2485079	2485084	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8005	NC_009831	GATA	2	8	2485096	2485103	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8006	NC_009831	GTG	2	6	2485107	2485112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8007	NC_009831	T	6	6	2485204	2485209	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8008	NC_009831	TAC	2	6	2485224	2485229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8009	NC_009831	TGG	2	6	2485260	2485265	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8010	NC_009831	CTT	2	6	2485366	2485371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8011	NC_009831	T	6	6	2485374	2485379	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8012	NC_009831	TGT	2	6	2485395	2485400	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8013	NC_009831	TGG	2	6	2485415	2485420	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8014	NC_009831	AT	3	6	2485502	2485507	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8015	NC_009831	TC	4	8	2485530	2485537	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8016	NC_009831	TGG	2	6	2485560	2485565	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8017	NC_009831	CTC	2	6	2485641	2485646	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8018	NC_009831	GCG	2	6	2485651	2485656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8019	NC_009831	AAT	2	6	2485659	2485664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8020	NC_009831	AATT	2	8	2485700	2485707	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8021	NC_009831	TTG	2	6	2485753	2485758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8022	NC_009831	T	7	7	2485762	2485768	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8023	NC_009831	AG	3	6	2486335	2486340	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8024	NC_009831	TGAG	2	8	2486408	2486415	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8025	NC_009831	ATA	2	6	2486428	2486433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8026	NC_009831	AAG	2	6	2486500	2486505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8027	NC_009831	TAA	2	6	2486514	2486519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8028	NC_009831	GT	3	6	2486847	2486852	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8029	NC_009831	TGA	2	6	2489197	2489202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8030	NC_009831	CTA	2	6	2490294	2490299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8031	NC_009831	GT	3	6	2490358	2490363	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8032	NC_009831	TA	3	6	2490992	2490997	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8033	NC_009831	A	7	7	2491010	2491016	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8034	NC_009831	T	6	6	2491040	2491045	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8035	NC_009831	ATC	2	6	2492953	2492958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8036	NC_009831	TAG	2	6	2492963	2492968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8037	NC_009831	A	6	6	2492978	2492983	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8038	NC_009831	TTG	2	6	2492994	2492999	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8039	NC_009831	CCT	2	6	2494325	2494330	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8040	NC_009831	CGT	2	6	2494340	2494345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8041	NC_009831	GAG	2	6	2495998	2496003	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8042	NC_009831	A	6	6	2496013	2496018	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8043	NC_009831	AAG	2	6	2496034	2496039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8044	NC_009831	A	6	6	2496040	2496045	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8045	NC_009831	TTGA	2	8	2496051	2496058	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8046	NC_009831	ATG	2	6	2496086	2496091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8047	NC_009831	CT	3	6	2496988	2496993	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8048	NC_009831	TAA	2	6	2497378	2497383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8049	NC_009831	AT	4	8	2497415	2497422	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8050	NC_009831	TTG	2	6	2498365	2498370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8051	NC_009831	AGG	2	6	2499811	2499816	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8052	NC_009831	TAA	2	6	2499838	2499843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8053	NC_009831	TCTTT	2	10	2501242	2501251	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
8054	NC_009831	GA	3	6	2501268	2501273	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8055	NC_009831	GTC	2	6	2501284	2501289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8056	NC_009831	TAT	2	6	2501313	2501318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8057	NC_009831	ATAA	2	8	2501374	2501381	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8058	NC_009831	GTC	2	6	2501435	2501440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8059	NC_009831	AAT	2	6	2501469	2501474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8060	NC_009831	TTGCC	2	10	2501676	2501685	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
8061	NC_009831	TTTAA	2	10	2501925	2501934	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8062	NC_009831	CAAAA	2	10	2502609	2502618	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
8063	NC_009831	AAT	2	6	2504920	2504925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8064	NC_009831	CA	3	6	2504933	2504938	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8065	NC_009831	T	8	8	2504971	2504978	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8066	NC_009831	ACTG	2	8	2505011	2505018	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8067	NC_009831	CTA	2	6	2505046	2505051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8068	NC_009831	A	6	6	2505051	2505056	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8069	NC_009831	GCTTGA	2	12	2505106	2505117	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
8070	NC_009831	GGCT	2	8	2505124	2505131	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8071	NC_009831	A	9	9	2505189	2505197	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8072	NC_009831	GAAT	2	8	2505223	2505230	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8073	NC_009831	A	7	7	2506697	2506703	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8074	NC_009831	ACAA	2	8	2506750	2506757	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
8075	NC_009831	TGT	2	6	2506830	2506835	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8076	NC_009831	GTAAT	2	10	2507737	2507746	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
8077	NC_009831	TATT	2	8	2507749	2507756	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8078	NC_009831	AG	3	6	2507772	2507777	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8079	NC_009831	CTA	2	6	2507840	2507845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8080	NC_009831	TA	4	8	2507844	2507851	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8081	NC_009831	TG	4	8	2507883	2507890	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8082	NC_009831	T	6	6	2507915	2507920	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8083	NC_009831	TGT	2	6	2507949	2507954	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8084	NC_009831	ACA	2	6	2507961	2507966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8085	NC_009831	ATCGA	2	10	2507983	2507992	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
8086	NC_009831	GAA	2	6	2512050	2512055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8087	NC_009831	ATC	2	6	2512728	2512733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8088	NC_009831	GCT	2	6	2513391	2513396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8089	NC_009831	T	7	7	2513495	2513501	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8090	NC_009831	ATT	2	6	2513525	2513530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8091	NC_009831	AT	3	6	2513610	2513615	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8092	NC_009831	CGA	2	6	2513690	2513695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8093	NC_009831	A	6	6	2513695	2513700	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8094	NC_009831	GAT	2	6	2513725	2513730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8095	NC_009831	AG	3	6	2514777	2514782	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8096	NC_009831	CTC	2	6	2515285	2515290	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8097	NC_009831	T	6	6	2515294	2515299	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8098	NC_009831	TTG	2	6	2515406	2515411	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8099	NC_009831	TGAT	2	8	2515431	2515438	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8100	NC_009831	GTGG	2	8	2515439	2515446	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
8101	NC_009831	T	6	6	2515456	2515461	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8102	NC_009831	TAAA	2	8	2515479	2515486	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8103	NC_009831	A	6	6	2515499	2515504	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8104	NC_009831	AAC	2	6	2515562	2515567	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8105	NC_009831	T	6	6	2516623	2516628	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8106	NC_009831	TAG	2	6	2519454	2519459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8107	NC_009831	GCC	2	6	2519498	2519503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8108	NC_009831	AAAT	2	8	2519558	2519565	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8109	NC_009831	G	6	6	2519602	2519607	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
8110	NC_009831	TG	3	6	2519652	2519657	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8111	NC_009831	ATA	2	6	2519710	2519715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8112	NC_009831	TCA	2	6	2520768	2520773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8113	NC_009831	CTA	2	6	2520796	2520801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8114	NC_009831	ACT	2	6	2520828	2520833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8115	NC_009831	TAA	2	6	2520860	2520865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8116	NC_009831	GAT	2	6	2520880	2520885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8117	NC_009831	TGC	2	6	2520892	2520897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8118	NC_009831	TGC	2	6	2520933	2520938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8119	NC_009831	AATT	2	8	2520939	2520946	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8120	NC_009831	CTG	2	6	2520972	2520977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8121	NC_009831	GAG	2	6	2521105	2521110	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8122	NC_009831	GCA	2	6	2521146	2521151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8123	NC_009831	GGGC	2	8	2521204	2521211	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
8124	NC_009831	ATTC	2	8	2521228	2521235	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8125	NC_009831	TACC	2	8	2521243	2521250	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8126	NC_009831	TGC	2	6	2521330	2521335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8127	NC_009831	GAC	2	6	2526679	2526684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8128	NC_009831	TGA	2	6	2532708	2532713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8129	NC_009831	TAT	2	6	2532740	2532745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8130	NC_009831	TAA	2	6	2532746	2532751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8131	NC_009831	GTTC	2	8	2533723	2533730	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8132	NC_009831	GAT	2	6	2533739	2533744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8133	NC_009831	GAG	2	6	2533855	2533860	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8134	NC_009831	GAG	2	6	2533979	2533984	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8135	NC_009831	GTG	2	6	2534020	2534025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8136	NC_009831	GAT	2	6	2534029	2534034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8138	NC_009831	GTT	2	6	2537589	2537594	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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