MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Shewanella sediminis HAW-EB3 chromosome

Total Repeats: 17456

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_009831	ATA	2	6	2171063	2171068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7002	NC_009831	TATC	2	8	2172465	2172472	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7003	NC_009831	AAAT	2	8	2172526	2172533	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7004	NC_009831	TACT	2	8	2172558	2172565	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7005	NC_009831	ATT	2	6	2176242	2176247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7006	NC_009831	GCT	2	6	2176451	2176456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7007	NC_009831	GCAG	2	8	2176476	2176483	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7008	NC_009831	TAA	2	6	2176486	2176491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7009	NC_009831	CCG	2	6	2177207	2177212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7010	NC_009831	CCT	2	6	2178814	2178819	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7011	NC_009831	AAGA	2	8	2178864	2178871	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
7012	NC_009831	TCGT	2	8	2178872	2178879	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7013	NC_009831	TCT	2	6	2178908	2178913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7014	NC_009831	GAC	2	6	2178920	2178925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7015	NC_009831	AGTT	2	8	2179021	2179028	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7016	NC_009831	AAT	2	6	2179050	2179055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7017	NC_009831	CTGG	2	8	2179169	2179176	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7018	NC_009831	TGG	2	6	2179202	2179207	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7019	NC_009831	AGA	2	6	2179219	2179224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7020	NC_009831	CTG	2	6	2179228	2179233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7021	NC_009831	GCT	2	6	2179421	2179426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7022	NC_009831	TGA	2	6	2179477	2179482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7023	NC_009831	TGA	2	6	2179484	2179489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7024	NC_009831	AC	3	6	2179593	2179598	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7025	NC_009831	CCG	2	6	2179604	2179609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7026	NC_009831	T	6	6	2181474	2181479	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7027	NC_009831	ATT	2	6	2182082	2182087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7028	NC_009831	TGAC	2	8	2183146	2183153	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7029	NC_009831	A	6	6	2183185	2183190	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7030	NC_009831	GATAA	2	10	2183280	2183289	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
7031	NC_009831	A	6	6	2183360	2183365	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7032	NC_009831	GAG	2	6	2183401	2183406	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7033	NC_009831	TTC	2	6	2183410	2183415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7034	NC_009831	GCC	2	6	2185305	2185310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7035	NC_009831	T	6	6	2185331	2185336	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7036	NC_009831	GTT	2	6	2185371	2185376	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7037	NC_009831	AATTT	2	10	2186217	2186226	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
7038	NC_009831	ATC	2	6	2186253	2186258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7039	NC_009831	GATA	2	8	2186284	2186291	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7040	NC_009831	T	6	6	2186308	2186313	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7041	NC_009831	CAC	2	6	2186317	2186322	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7042	NC_009831	GT	3	6	2188473	2188478	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7043	NC_009831	GTTT	2	8	2188542	2188549	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
7044	NC_009831	ATCC	2	8	2188624	2188631	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
7045	NC_009831	CGA	2	6	2188641	2188646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7046	NC_009831	TTAT	2	8	2188690	2188697	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7047	NC_009831	GATTTG	2	12	2188704	2188715	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7048	NC_009831	GTT	2	6	2188769	2188774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7049	NC_009831	CAC	2	6	2188775	2188780	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7050	NC_009831	TTC	2	6	2188891	2188896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7051	NC_009831	ATG	2	6	2188935	2188940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7053	NC_009831	GTG	2	6	2189169	2189174	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7054	NC_009831	AGG	2	6	2189182	2189187	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7055	NC_009831	TGC	2	6	2189202	2189207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7056	NC_009831	ATG	2	6	2189214	2189219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7057	NC_009831	AGA	2	6	2189288	2189293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7058	NC_009831	ATG	2	6	2189317	2189322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7059	NC_009831	TTGCT	2	10	2189349	2189358	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
7060	NC_009831	GCA	2	6	2189583	2189588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7061	NC_009831	TAT	2	6	2189684	2189689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7062	NC_009831	GAAAA	2	10	2189749	2189758	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
7063	NC_009831	AC	3	6	2189883	2189888	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7064	NC_009831	CAA	2	6	2189914	2189919	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7065	NC_009831	CAACG	2	10	2189939	2189948	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
7066	NC_009831	TTG	2	6	2190077	2190082	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7067	NC_009831	TCC	2	6	2190096	2190101	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7068	NC_009831	TGT	2	6	2190145	2190150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7069	NC_009831	GCCA	2	8	2190160	2190167	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7070	NC_009831	T	7	7	2190206	2190212	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7071	NC_009831	TAG	2	6	2190225	2190230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7072	NC_009831	GT	3	6	2190300	2190305	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7073	NC_009831	TCAT	2	8	2190306	2190313	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7074	NC_009831	T	7	7	2190313	2190319	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7075	NC_009831	GCAA	2	8	2190348	2190355	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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7078	NC_009831	CAA	2	6	2190442	2190447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7079	NC_009831	A	6	6	2190452	2190457	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7080	NC_009831	TTGGCT	2	12	2190461	2190472	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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7083	NC_009831	T	6	6	2190499	2190504	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7085	NC_009831	AGGG	2	8	2190531	2190538	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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7088	NC_009831	CCAA	2	8	2191021	2191028	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7089	NC_009831	AAT	2	6	2191088	2191093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7090	NC_009831	ATT	2	6	2195052	2195057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7091	NC_009831	AAG	2	6	2195165	2195170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7092	NC_009831	ACA	2	6	2195175	2195180	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7093	NC_009831	ATA	2	6	2195259	2195264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7094	NC_009831	TAT	2	6	2195488	2195493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7095	NC_009831	T	6	6	2195562	2195567	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7098	NC_009831	TCT	2	6	2196903	2196908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7099	NC_009831	GAA	2	6	2197980	2197985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7100	NC_009831	TTA	2	6	2197999	2198004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7101	NC_009831	TA	3	6	2198098	2198103	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7102	NC_009831	AAGA	2	8	2199703	2199710	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
7103	NC_009831	CT	3	6	2199957	2199962	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7104	NC_009831	TATCA	2	10	2200101	2200110	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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7107	NC_009831	TAG	2	6	2200574	2200579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7109	NC_009831	TC	3	6	2200700	2200705	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7110	NC_009831	TA	3	6	2200769	2200774	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7111	NC_009831	AC	3	6	2200775	2200780	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7112	NC_009831	TTC	2	6	2201259	2201264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7113	NC_009831	AGCA	2	8	2201348	2201355	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7114	NC_009831	AGC	2	6	2201360	2201365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7115	NC_009831	T	7	7	2201375	2201381	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7116	NC_009831	CTC	2	6	2201385	2201390	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7117	NC_009831	TGC	2	6	2201432	2201437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7118	NC_009831	GTT	2	6	2201480	2201485	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7119	NC_009831	A	6	6	2203896	2203901	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7120	NC_009831	ATC	2	6	2207409	2207414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7121	NC_009831	A	7	7	2207481	2207487	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7122	NC_009831	AAT	2	6	2207525	2207530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7123	NC_009831	AT	3	6	2209004	2209009	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7124	NC_009831	TAA	2	6	2209069	2209074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7125	NC_009831	ATT	2	6	2209076	2209081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7126	NC_009831	TACCGG	2	12	2209117	2209128	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7127	NC_009831	T	6	6	2209145	2209150	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7128	NC_009831	TTG	2	6	2209167	2209172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7129	NC_009831	GCTAT	2	10	2210407	2210416	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
7130	NC_009831	AG	3	6	2210418	2210423	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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7132	NC_009831	AGT	2	6	2210810	2210815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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